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公开(公告)号：CN103745231A
公开(公告)日：2014-04-23
申请号：CN201410020395.1
申请日：2014-01-16
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种小麦矮腥黑穗病TCK及其近似种TCT的冬孢子图像鉴定方法，该方法包括构建稀疏字典、矮腥黑穗病害图像鉴定、输出鉴定结果这三个步骤，利用小麦矮腥黑穗病菌冬孢子图像作为鉴定对象，根据冬孢子的形态学特征，应用基于稀疏表示的模式识别方法，能实现TCK及其近似种TCT的快速、准确的鉴定，且鉴定成本低廉，仅需要制作用于显微镜下观察病害图像的玻片即可。这相比现有技术，本发明方法能够解决或规避当前对小麦矮腥黑穗病鉴定中，分子生物学方法存在的程序复杂、常规PCR检测时间长等问题，以及显微镜下观察冬孢子形态学特征的鉴定方法对检测人员技术水平要求较高、测量过程繁琐等问题。
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公开(公告)号：CN103745231B
公开(公告)日：2017-01-18
申请号：CN201410020395.1
申请日：2014-01-16
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种小麦矮腥黑穗病TCK及其近似种TCT的冬孢子图像鉴定方法，该方法包括构建稀疏字典、矮腥黑穗病害图像鉴定、输出鉴定结果这三个步骤，利用小麦矮腥黑穗病菌冬孢子图像作为鉴定对象，根据冬孢子的形态学特征，应用基于稀疏表示的模式识别方法，能实现TCK及其近似种TCT的快速、准确的鉴定，且鉴定成本低廉，仅需要制作用于显微镜下观察病害图像的玻片即可。这相比现有技术，本发明方法能够解决或规避当前对小麦矮腥黑穗病鉴定中，分子生物学方法存在的程序复杂、常规PCR检测时间长等问题，以及显微镜下观察冬孢子形态学特征的鉴定方法对检测人员技术水平要求较高、测量过程繁琐等问题。
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公开(公告)号：CN103593659B
公开(公告)日：2016-09-14
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3‑10‑1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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公开(公告)号：CN103593659A
公开(公告)日：2014-02-19
申请号：CN201310611263.1
申请日：2013-11-26
Applicant: 华南农业大学 , 中国林业科学研究院热带林业研究所
Abstract: 本发明公开了一种针对二倍体PCR产物的Sanger测序中个体内SNP的识别方法，首先单独分离出色谱图中包含的腺瞟呤A、鸟瞟呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T四种碱基的荧光数据；采用小波多尺度分析方法对分离的荧光数据分别进行滤波去噪处理；再分析四种碱基荧光数据的波形特征，检测出波形的第一峰与第二峰，选择波峰距离、高度比值和起伏度比值这三个波形特征，作为SNP位点判别的要素；选择结构为3-10-1的BP神经网络作为SNP位点检测的分类器，并采用Levenberg Marquardt算法来对BP神经网络进行训练；采用分段线性变换将输出映射为0～100的SNP评价分数，根据评价分数将SNP位点的类别定义为1～5级，并据此判定该位点的SNP置信度。本发明能够有效检测测序文件的个体内SNP位点。
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