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公开(公告)号:CN115083611B
公开(公告)日:2022-11-11
申请号:CN202210977871.3
申请日:2022-08-16
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
Abstract: 本发明提供了一种可用来评估免疫微环境的空间分析方法,在该方法中,我们创立了两个空间指标——“互作评分”和“互作百分比”,二者分别指代在肿瘤中心视野内,距离20um范围内,中心细胞(肿瘤细胞)与周边细胞(特定免疫细胞亚型)的配对数与中心细胞总细胞数的比值,以及以肿瘤细胞为中心,半径20um内,是否有免疫细胞亚型细胞存在,如果有记为1,如果没有记为0,然后比上所有中心细胞数量的比值。该方法可通过空间分析距离肿瘤细胞最近的免疫细胞数量,从空间分布来反映患者的免疫状态,进一步可分析其与免疫治疗疗效和预后的关系。
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公开(公告)号:CN115083611A
公开(公告)日:2022-09-20
申请号:CN202210977871.3
申请日:2022-08-16
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
Abstract: 本发明提供了一种可用来评估免疫微环境的空间分析方法,在该方法中,我们创立了两个空间指标——“互作评分”和“互作百分比”,二者分别指代在肿瘤中心视野内,距离20um范围内,中心细胞(肿瘤细胞)与周边细胞(特定免疫细胞亚型)的配对数与中心细胞总细胞数的比值,以及以肿瘤细胞为中心,半径20um内,是否有免疫细胞亚型细胞存在,如果有记为1,如果没有记为0,然后比上所有中心细胞数量的比值。该方法可通过空间分析距离肿瘤细胞最近的免疫细胞数量,从空间分布来反映患者的免疫状态,进一步可分析其与免疫治疗疗效和预后的关系。
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公开(公告)号:CN114974420A
公开(公告)日:2022-08-30
申请号:CN202111280551.4
申请日:2021-10-29
Applicant: 无锡臻和生物科技有限公司 , 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
Abstract: 本发明提出了一种预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物及其应用,该标志物为HLA‑B趋异进化指数(HLA‑BHED),HLA‑B趋异进化指数(HLA‑BHED)具有可以作为预测对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂疗效的标志物的用途。根据本发明所述的HLA‑B基因的趋异进化指数(HLA‑BHED)通过反映机体HLA分子与抗原肽结合域的序列多样性准确预测所述免疫检查点抑制剂对胃肠肿瘤的治疗效果,HLA‑BHED指数高的对象,HLA‑B能够结合多种抗原肽提呈给T细胞诱导免疫应答,所述对象给予免疫检查点抑制剂治疗后展现出临床显著获益,总生存期及无病进展期显著延长。
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公开(公告)号:CN113981078B
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202111089720.6
申请日:2021-09-16
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) , 无锡臻和生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种用于预测晚期食管癌患者抗EGFR靶向治疗疗效的生物标志物及疗效预测试剂盒,其中,生物标志物获取方法包括:提取待检测样本RNA,将待检测样本RNA打断,进行反转录,得到cDNA;基于cDNA通过末端修复、接头连接和文库富集方法构建基因文库;通过捕获探针与目标区域特异性杂交从构建的基因文库中捕获并富集目标基因;利用高通量测序仪测序,获得RNA靶向测序数据;采用RPKM方法定量评估RNA靶向测序数据中基因ALK、NTRK2及NTRK3的表达量;基于评估得到的表达量取平均数得到生物标志物。具备检测灵敏度高、测序费用低、节省探针等优点,更适用于临床试剂盒开发。
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公开(公告)号:CN114231628A
公开(公告)日:2022-03-25
申请号:CN202111466674.7
申请日:2021-12-03
Applicant: 无锡臻和生物科技有限公司 , 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11 , G16B20/20
Abstract: 本发明提出了一种预测胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗疗效的标志物组合及其应用,该标志物组合所述标志物组合包含HLA‑B62超型中的至少之一。根据本发明实施例的标志物组合可以对对象胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂的治疗疗效进行准确预测,如PD‑1/PD‑L1抑制剂单用,或与CTLA‑4抑制剂联用,提高胃肠肿瘤免疫检查点抑制剂治疗的响应率。
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公开(公告)号:CN113981078A
公开(公告)日:2022-01-28
申请号:CN202111089720.6
申请日:2021-09-16
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院) , 无锡臻和生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明提供了一种用于预测晚期食管癌患者抗EGFR靶向治疗疗效的生物标志物及疗效预测试剂盒,其中,生物标志物获取方法包括:提取待检测样本RNA,将待检测样本RNA打断,进行反转录,得到cDNA;基于cDNA通过末端修复、接头连接和文库富集方法构建基因文库;通过捕获探针与目标区域特异性杂交从构建的基因文库中捕获并富集目标基因;利用高通量测序仪测序,获得RNA靶向测序数据;采用RPKM方法定量评估RNA靶向测序数据中基因ALK、NTRK2及NTRK3的表达量;基于评估得到的表达量取平均数得到生物标志物。具备检测灵敏度高、测序费用低、节省探针等优点,更适用于临床试剂盒开发。
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公开(公告)号:CN117701719A
公开(公告)日:2024-03-15
申请号:CN202410155860.6
申请日:2024-02-04
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/574 , G01N33/68
Abstract: 本发明属于医学诊断技术领域,公开了肿瘤靶向CLDN18.2治疗耐药标志物及其应用。本发明揭示了细胞外囊泡(EV)携带的CLDN18.2、PD1、PD‑L2表达及其衍生组合评分或模型作为肿瘤靶向CLDN18.2治疗方案疗效和耐药标志物的用途,能够划分有效人群、预测治疗效果、监测耐药发生,且对细胞治疗类药物和抗体类药物都具有明确的标志物潜力,有望推动靶向CLDN18.2治疗方案的伴随诊断手段的开发,为今后CLDN18.2靶向治疗药物的临床实践积累宝贵经验。
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公开(公告)号:CN117701719B
公开(公告)日:2024-05-31
申请号:CN202410155860.6
申请日:2024-02-04
Applicant: 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/574 , G01N33/68
Abstract: 本发明属于医学诊断技术领域,公开了肿瘤靶向CLDN18.2治疗耐药标志物及其应用。本发明揭示了细胞外囊泡(EV)携带的CLDN18.2、PD1、PD‑L2表达及其衍生组合评分或模型作为肿瘤靶向CLDN18.2治疗方案疗效和耐药标志物的用途,能够划分有效人群、预测治疗效果、监测耐药发生,且对细胞治疗类药物和抗体类药物都具有明确的标志物潜力,有望推动靶向CLDN18.2治疗方案的伴随诊断手段的开发,为今后CLDN18.2靶向治疗药物的临床实践积累宝贵经验。
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