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公开(公告)号：CN109523520A
公开(公告)日：2019-03-26
申请号：CN201811250267.0
申请日：2018-10-25
Applicant: 北京大学第三医院 , 中国科学院计算技术研究所
CPC classification number: G06T7/0012 , G06K9/0014 , G06K9/00147 , G06N3/0454 , G06T2207/10056 , G06T2207/20081 , G06T2207/30004 , G06T2207/30242
Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的染色体自动计数方法，包括以下步骤：(1)图像收集和预处理步骤；(2)图像分类和回归步骤；(3)模型训练步骤；(4)测试计数步骤，其中，在步骤(2)中采用新的抽样策略，并对Faster R-CNN模型损失函数进行了改进。本发明所需的数据来源于真实显微镜视野下的G显带染色体，所述方法无需复杂实验过程，成本低廉，耗时更短，能够自动准确完成目标染色体计数。本发明使用1000例标注的染色体图训练模型，随后用175例标注的染色体图做测试，统计显示175例共包含8023条染色体，测试的准确率为98.95％，召回率为98.67％。测试结果显示用机器计数后人工校正的方法完成一份报告的染色体计数所需时间短于目前的1/3。
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公开(公告)号：CN113408505B
公开(公告)日：2022-06-14
申请号：CN202110957126.8
申请日：2021-08-19
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) , 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明提供了一种基于深度学习的染色体极性识别方法，所述方法包括（1）收集数据集，（2）构建训练集和测试集，（3）基于训练集对染色体极性识别模型进行学习训练，（4）将测试集输入到染色体极性识别模型进行测试，输出待预测染色体的极性结果。本发明还提供了一种基于深度学习的染色体极性识别系统。本发明提供的方法和系统基于深度学习分类算法，能够准确地判断当前染色体极性类别，并据此完成染色体极性调整，使得染色体均保持短臂朝上的状态。所述方法和系统染色体极性识别准确率达96.36%，而且数据来源简单，染色体分析自动化程度高，流程更加简洁，具有广泛的工业实用性。
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公开(公告)号：CN109523520B
公开(公告)日：2020-12-18
申请号：CN201811250267.0
申请日：2018-10-25
Applicant: 北京大学第三医院 , 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的染色体自动计数方法，包括以下步骤：(1)图像收集和预处理步骤；(2)图像分类和回归步骤；(3)模型训练步骤；(4)测试计数步骤，其中，在步骤(2)中采用新的抽样策略，并对Faster R‑CNN模型损失函数进行了改进。本发明所需的数据来源于真实显微镜视野下的G显带染色体，所述方法无需复杂实验过程，成本低廉，耗时更短，能够自动准确完成目标染色体计数。本发明使用1000例标注的染色体图训练模型，随后用175例标注的染色体图做测试，统计显示175例共包含8023条染色体，测试的准确率为98.95％，召回率为98.67％。测试结果显示用机器计数后人工校正的方法完成一份报告的染色体计数所需时间短于目前的1/3。
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公开(公告)号：CN113408505A
公开(公告)日：2021-09-17
申请号：CN202110957126.8
申请日：2021-08-19
Applicant: 北京大学第三医院(北京大学第三临床医学院) , 中国科学院计算技术研究所
Abstract: 本发明提供了一种基于深度学习的染色体极性识别方法，所述方法包括（1）收集数据集，（2）构建训练集和测试集，（3）基于训练集对染色体极性识别模型进行学习训练，（4）将测试集输入到染色体极性识别模型进行测试，输出待预测染色体的极性结果。本发明还提供了一种基于深度学习的染色体极性识别系统。本发明提供的方法和系统基于深度学习分类算法，能够准确地判断当前染色体极性类别，并据此完成染色体极性调整，使得染色体均保持短臂朝上的状态。所述方法和系统染色体极性识别准确率达96.36%，而且数据来源简单，染色体分析自动化程度高，流程更加简洁，具有广泛的工业实用性。
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