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公开(公告)号：CN118853864A
公开(公告)日：2024-10-29
申请号：CN202410999404.X
申请日：2024-07-24
Applicant: 北京大学人民医院 , 广州市金圻睿生物科技有限责任公司
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种用于检测血流感染的线粒体标志物及其应用。所述线粒体标志物包括人源线粒体游离核酸。本发明创造性地发现用于检测血流感染的线粒体标志物，能够准确、快速、灵敏的实现对血流感染的检测。
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公开(公告)号：CN116426696B
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN202310704893.7
申请日：2023-06-14
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/70 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供一种基于测序技术的血浆病毒检测分析方法，包括：富集血浆样本病毒颗粒，和病毒检测分析；其中，所述富集血浆样本病毒颗粒如下进行：离心步骤；核酸酶处理步骤；过滤步骤；超滤离心浓缩步骤；所述对所述测序结果进行病毒组去污染分析包括：批内污染过滤；非特异性病毒序列过滤；非人源宿主病毒过滤。采用本发明的方法可降低假阳性结果，提高病毒检测能力，实验结果表明本发明的方法平均LoD检测限提高约100倍，甚至可以低至5 Copies/ml的检测限，适用于临床样本中极低丰度的病毒病原的检测。
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公开(公告)号：CN115083527A
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202210991561.7
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种聚类泛基因组数据库构建方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤a）序列相似性计算：计算微生物菌株基因组序列的相似性；步骤b）序列聚类：根据序列的相似性计算结果进行聚类，将相似序列聚为同一簇；步骤c）构建聚类泛基因组数据库：对于聚类之后的每一簇，构建该簇所有菌株的泛基因组，作为该簇菌株的序列特征，每簇泛基因组序列包含序列ID以及与原始菌株对应信息，进而构建成物种的聚类泛基因组数据库。构建的数据库在保证数据库完整的情况下，极大地缩小数据库体量，可应用于快速、准确鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN119530434A
公开(公告)日：2025-02-28
申请号：CN202411783018.3
申请日：2024-12-05
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/845 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种快速检测根毛霉和根霉的引物组及试剂盒，其包括用于检测微小根毛霉、小孢根霉、根毛霉属、根霉属中的一种或多种的扩增引物对和探针，形成稳定的多重PCR反应试剂盒体系，确保可以有效地检测到临床中常见的根毛霉和根霉病原体。通过实验发现，本发明的引物组及试剂盒具有极高的特异性和灵敏度，最小可实现对浓度为4‑5pg/μL的根毛霉和根霉病原体的检测，可以实现快速高效精准的检测，大大缩短了检测时间，节约了检测成本，提高了检测效率。
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公开(公告)号：CN115064215B
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN115064215A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN116426696A
公开(公告)日：2023-07-14
申请号：CN202310704893.7
申请日：2023-06-14
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/70 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供一种基于测序技术的血浆病毒检测分析方法，包括：富集血浆样本病毒颗粒，和病毒检测分析；其中，所述富集血浆样本病毒颗粒如下进行：离心步骤；核酸酶处理步骤；过滤步骤；超滤离心浓缩步骤；所述对所述测序结果进行病毒组去污染分析包括：批内污染过滤；非特异性病毒序列过滤；非人源宿主病毒过滤。采用本发明的方法可降低假阳性结果，提高病毒检测能力，实验结果表明本发明的方法平均LoD检测限提高约100倍，甚至可以低至5 Copies/ml的检测限，适用于临床样本中极低丰度的病毒病原的检测。
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公开(公告)号：CN118667950A
公开(公告)日：2024-09-20
申请号：CN202410999401.6
申请日：2024-07-24
Applicant: 广州市金圻睿生物科技有限责任公司 , 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种用于检测血流感染的标志物及其应用。所述标志物包括游离核酸，所述游离核酸包括人源游离核酸和血流感染病原微生物游离核酸。本发明创造性地发现用于检测血流感染的标志物，能够准确、快速、灵敏的实现对血流感染的检测以及对血流感染病原微生物的鉴定。
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