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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119899904A
公开(公告)日：2025-04-29
申请号：CN202510081854.5
申请日：2025-01-20
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/22
Abstract: 本发明公开了一种检测肺炎克雷伯菌及其高危克隆基因分型的引物组及试剂盒，其包括用于检测炎克雷伯菌和高危克隆标志基因mltC和ppsC分型中的一种或多种的扩增引物对和探针，形成稳定的多重PCR反应试剂盒体系，确保可以高效准确地检测到临床中肺炎克雷伯菌病原体以及对高危克隆标志基因mltC和ppsC进行基因分型检测。通过实验发现，本发明的引物组及试剂盒具有极高的特异性和准确度，可有效的对临床中肺炎克雷伯菌病原体以及高危克隆标志基因mltC和ppsC的分型进行检测，能够实现快速高效精准和低成本的检测，大大缩短了检测时间，节约了检测成本，便于规模化应用。
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公开(公告)号：CN119530434A
公开(公告)日：2025-02-28
申请号：CN202411783018.3
申请日：2024-12-05
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/845 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种快速检测根毛霉和根霉的引物组及试剂盒，其包括用于检测微小根毛霉、小孢根霉、根毛霉属、根霉属中的一种或多种的扩增引物对和探针，形成稳定的多重PCR反应试剂盒体系，确保可以有效地检测到临床中常见的根毛霉和根霉病原体。通过实验发现，本发明的引物组及试剂盒具有极高的特异性和灵敏度，最小可实现对浓度为4‑5pg/μL的根毛霉和根霉病原体的检测，可以实现快速高效精准的检测，大大缩短了检测时间，节约了检测成本，提高了检测效率。
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公开(公告)号：CN115064215B
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN115064215A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN115083527A
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202210991561.7
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种聚类泛基因组数据库构建方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤a）序列相似性计算：计算微生物菌株基因组序列的相似性；步骤b）序列聚类：根据序列的相似性计算结果进行聚类，将相似序列聚为同一簇；步骤c）构建聚类泛基因组数据库：对于聚类之后的每一簇，构建该簇所有菌株的泛基因组，作为该簇菌株的序列特征，每簇泛基因组序列包含序列ID以及与原始菌株对应信息，进而构建成物种的聚类泛基因组数据库。构建的数据库在保证数据库完整的情况下，极大地缩小数据库体量，可应用于快速、准确鉴定出病原微生物的属性和来源。
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