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公开(公告)号：CN119979734A
公开(公告)日：2025-05-13
申请号：CN202411801896.3
申请日：2024-12-09
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/689 , G01N27/62 , C12Q1/70 , C12Q1/6883 , G01N33/569 , G16B40/00
Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域，具体涉及一种基于宿主反应鉴别病原微生物类型的标志物，其包括下组编码RNA的组合或其编码的蛋白质：SLC37A3、UBALD2。该生物标志物可用于诊断病原微生物的类型，区分细菌或病毒感染。并且，在感染早期即可通过该标志物进行诊断，具有耗时较短、特异性较高、灵敏度较高等优点。
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公开(公告)号：CN119979692A
公开(公告)日：2025-05-13
申请号：CN202411801895.9
申请日：2024-12-09
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/6883 , G01N27/62 , G01N33/68 , G01N33/573 , G16B40/20 , G06F18/211 , G06F18/27
Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域，具体涉及一种用于重症脓毒性休克早期诊断的宿主应答标志物，其包括下组编码RNA的组合或其编码的蛋白质：CHKA、SPRY1、NRTN、KRTAP1‑4。该标志物可用于诊断脓毒性休克，具有良好的特异性和灵敏度，以及较为稳定的诊断性能。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN116426696A
公开(公告)日：2023-07-14
申请号：CN202310704893.7
申请日：2023-06-14
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/70 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供一种基于测序技术的血浆病毒检测分析方法，包括：富集血浆样本病毒颗粒，和病毒检测分析；其中，所述富集血浆样本病毒颗粒如下进行：离心步骤；核酸酶处理步骤；过滤步骤；超滤离心浓缩步骤；所述对所述测序结果进行病毒组去污染分析包括：批内污染过滤；非特异性病毒序列过滤；非人源宿主病毒过滤。采用本发明的方法可降低假阳性结果，提高病毒检测能力，实验结果表明本发明的方法平均LoD检测限提高约100倍，甚至可以低至5 Copies/ml的检测限，适用于临床样本中极低丰度的病毒病原的检测。
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公开(公告)号：CN115064215B
公开(公告)日：2023-10-24
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN115064215A
公开(公告)日：2022-09-16
申请号：CN202210991537.3
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种通过相似度进行菌株溯源及属性鉴定的方法，其包含如下步骤：a）将样本中菌株的测序序列或组装序列和聚类泛基因组数据库中每个簇的泛基因组进行序列比对；b）根据比对上序列的覆盖度筛选比对结果；c）根据筛选的比对结果计算簇相似度，选取簇相似度最大的L个簇作为候选簇；d）从每个所述候选簇中选取株相似度最大的M个原始菌株作为候选菌株；e）从所述候选菌株中，选取株相似度最大的N个原始菌株，作为来源菌株；f）根据所述来源菌株获取所述样本中菌株的来源信息及属性信息。采用此方法可快速、准确地鉴定出病原微生物的属性和来源。
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公开(公告)号：CN116426696B
公开(公告)日：2024-01-26
申请号：CN202310704893.7
申请日：2023-06-14
Applicant: 北京大学人民医院
IPC: C12Q1/70 , G16B20/30 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提供一种基于测序技术的血浆病毒检测分析方法，包括：富集血浆样本病毒颗粒，和病毒检测分析；其中，所述富集血浆样本病毒颗粒如下进行：离心步骤；核酸酶处理步骤；过滤步骤；超滤离心浓缩步骤；所述对所述测序结果进行病毒组去污染分析包括：批内污染过滤；非特异性病毒序列过滤；非人源宿主病毒过滤。采用本发明的方法可降低假阳性结果，提高病毒检测能力，实验结果表明本发明的方法平均LoD检测限提高约100倍，甚至可以低至5 Copies/ml的检测限，适用于临床样本中极低丰度的病毒病原的检测。
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公开(公告)号：CN115083527A
公开(公告)日：2022-09-20
申请号：CN202210991561.7
申请日：2022-08-18
Applicant: 北京大学人民医院
Abstract: 本发明提供一种聚类泛基因组数据库构建方法，其特征在于，包括如下步骤：步骤a）序列相似性计算：计算微生物菌株基因组序列的相似性；步骤b）序列聚类：根据序列的相似性计算结果进行聚类，将相似序列聚为同一簇；步骤c）构建聚类泛基因组数据库：对于聚类之后的每一簇，构建该簇所有菌株的泛基因组，作为该簇菌株的序列特征，每簇泛基因组序列包含序列ID以及与原始菌株对应信息，进而构建成物种的聚类泛基因组数据库。构建的数据库在保证数据库完整的情况下，极大地缩小数据库体量，可应用于快速、准确鉴定出病原微生物的属性和来源。
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