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公开(公告)号：CN118122293A
公开(公告)日：2024-06-04
申请号：CN202410025733.4
申请日：2024-01-08
Applicant: 北京大学 , 北京大学成都前沿交叉生物技术研究院
IPC: B01J20/285 , G01N30/02 , G01N30/72 , G01N23/2251 , G01N33/68 , C12Q1/37 , C12Q1/44 , B01D15/08 , B01J20/30
Abstract: 本发明提供了一种用于分离EVs的DSPE功能化琼脂糖介质及其制备方法和应用，属于分析化学、细胞生物学与生物化学技术领域。本发明将NHS beads与PEG2000‑NH2共同孵育后，获得可用于高效提取细胞外囊泡EVs的功能化琼脂糖介质，具有稳定性高、特异性好、获得胞外囊泡的蛋白质种类多的优点。本发明还提供一种快速、简便、高通量的胞外囊泡蛋白质组学分析方法。该方法可以在单管中完成样本制备，与高通量自动化样本制备工作站具有良好的兼容性，有望发展成为一种自动化的样本制备流程。本发明为胞外囊泡蛋白质组的分析提供了便捷的工具，在临床诊断标志物的发现、临床药物开发、疾病机制研究等领域具有良好的应用前景。
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公开(公告)号：CN119661351A
公开(公告)日：2025-03-21
申请号：CN202411784902.9
申请日：2024-12-05
Applicant: 北京大学
Abstract: 本发明公开了一种巴豆酰化检测探针及其制备方法和应用，制备方法包括：以炔醇(化合物II)为原料，氧化剂的作用下与甲氧羰基亚甲基三苯基正磷反应得到甲酯类化合物(化合物III)，在碱的作用下水解得到酸(化合物IV)，最后与碱反应，过滤，冻干得到探针分子(化合物I)。将具有炔基的化学探针(化合物I)在细胞中施用，通过代谢标记选择性地在特定修饰位点将炔基装载到目标蛋白上，通过生物正交化学反应，荧光染料可以正交地连接到修饰位点，从而使探针用于细胞中对巴豆酰化蛋白进行荧光成像并鉴定巴豆酰化的修饰底物与位点，利用该探针可以通过定量化学蛋白质组学确定组蛋白去乙酰化酶(HDACs)调控的巴豆酰化位点。
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公开(公告)号：CN114966036A
公开(公告)日：2022-08-30
申请号：CN202210350984.0
申请日：2022-04-02
Applicant: 北京大学
IPC: G01N33/68 , G01N33/532 , G01N30/72
Abstract: 本申请涉及化学蛋白质组领域，尤其涉及硫辛酰化修饰位点的定量化学蛋白质组学方法，采用含醛基与炔基的探针对生物样品的蛋白质组进行硫辛酰化修饰的化学选择性标记；通过定量化学蛋白质组学技术，对化学选择性标记后的硫辛酰化修饰位点进行定量分析。可实现对生物样品中所有的硫辛酰化修饰位点的鉴定与定量，从而为研究硫辛酰化修饰对蛋白质结构和功能的影响提供分析工具，有利于推进硫辛酰化修饰对于相关疾病的分子机制的研究，可实现高覆盖度、高重现性以及高精确度的靶标筛选，为后续药物开发提供相应的技术支持。
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公开(公告)号：CN114354733A
公开(公告)日：2022-04-15
申请号：CN202111665395.3
申请日：2021-12-31
Applicant: 北京大学
Abstract: 本申请涉及化学蛋白质组领域，尤其涉及基于数据非依赖型采集(Data‑independent acquisition，简称DIA)的定量化学蛋白质组学筛选靶标的方法，包括采用活性分子探针，共价修饰蛋白质组中的特定的活性氨基酸；通过基于DIA的定量组学方法，对探针共价修饰后的位点进行定量分析，得到候选靶标。本申请提供的基于DIA的定量化学蛋白质组学筛选靶标的方法，将基于DIA的定量组学技术应用到ABPP当中，形成DIA‑ABPP，可实现高覆盖度、高重现性以及高精确度的靶标筛选，为后续药物开发提供相应的技术支持。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN114751962B
公开(公告)日：2023-11-07
申请号：CN202210263458.0
申请日：2022-03-17
Applicant: 北京大学
IPC: C07K7/64 , C07K7/08 , C07K1/04 , A61K38/12 , A61K38/10 , A61P29/00 , A61P37/02 , A61P19/02 , A61P19/08 , A61P17/06 , A61P1/00
Abstract: 本申请涉及生物医药领域，特别涉及订书肽、其制备方法以及制药用途。具体地，本申请涉及一种订书肽，其包含选自以下的主链氨基酸序列：(a)如IHVTIPADLWDWINK(SEQ ID NO:1)所示的氨基酸序列；(b)与SEQ ID NO:1具有至少80％、86.7％或93％序列同一性的氨基酸序列；或(c)与SEQ ID NO:1相比具有1个、2个或3个氨基酸残基的添加或置换的氨基酸序列；所述订书肽的主链的第i位与第i+3位的氨基酸残基、或第i位与第i+4位的氨基酸残基、或第i位与第i+7位的氨基酸残基通过连接子偶联成环，所述连接子包含至少一个氨基酸；所述i为大于或等于1的整数。所述订书肽可用于治疗与IL‑17A过度表达相关的疾病。
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公开(公告)号：CN116337567A
公开(公告)日：2023-06-27
申请号：CN202310247865.7
申请日：2023-03-15
Applicant: 北京大学
IPC: G01N1/28
Abstract: 本申请公开了一种快速高效的化学蛋白质组学样品制备方法，涉及蛋白质组学领域，设计并合成了一种表面包被有可切割linker化合物的琼脂糖微球，可切割linker化合物的自由端含有叠氮基团，与现有炔基探针具有较好的兼容性。通过一步高效的点击化学反应，可以将探针标记肽段特异性地捕获到琼脂糖微球表面，由于琼脂糖微球与肽段之间是共价连接，可以使用非常强的变性剂或者表面活性剂对介质进行洗杂，以尽可能地除去非特异性吸附，最后通过切割处理就可以高效地将探针标记肽段从琼脂糖微球上解离下来。本发明中的样品制备方法将繁琐的“点击化学和链霉亲和素富集”简化为一步快速的“点击化学”反应，极大简化的操作流程。
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公开(公告)号：CN109810099B
公开(公告)日：2020-12-25
申请号：CN201910143817.7
申请日：2019-02-27
Applicant: 北京大学
IPC: C07D405/12 , A61K31/396 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了一种黄芩素活性探针，活性探针是以黄芩素为反应基团，二吖丙啶为光交联基团，炔基为生物正交基团；结构式如下：；并提供了其合成方法和应用。其有益效果为：1)基于细胞氧化磷酸化通路的抗癌机制，是新的抗癌机制，可能实现选择性杀伤癌细胞的作用；2)黄芩素是第一个被发现的细胞氧化磷酸化通路的激活剂；3)细胞氧化磷酸化通路中关键蛋白ATP4A(P20648)，ATP5A1(P25705)，ATP5F1(P24539)，ATP5L(O75964)，ATP6V1A(P38606)，ATP6V1H(Q9UI12)，ATP12A(P54707)以及NDUFA13(Q9P0J0)是开发抗癌新药的靶点。
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公开(公告)号：CN109810099A
公开(公告)日：2019-05-28
申请号：CN201910143817.7
申请日：2019-02-27
Applicant: 北京大学
IPC: C07D405/12 , A61K31/396 , A61P35/00
Abstract: 本发明公开了一种黄芩素活性探针，活性探针是以黄芩素为反应基团，二吖丙啶为光交联基团，炔基为生物正交基团；结构式如下：；并提供了其合成方法和应用。其有益效果为：1)基于细胞氧化磷酸化通路的抗癌机制，是新的抗癌机制，可能实现选择性杀伤癌细胞的作用；2)黄芩素是第一个被发现的细胞氧化磷酸化通路的激活剂；3)细胞氧化磷酸化通路中关键蛋白ATP4A(P20648)，ATP5A1(P25705)，ATP5F1(P24539)，ATP5L(O75964)，ATP6V1A(P38606)，ATP6V1H(Q9UI12)，ATP12A(P54707)以及NDUFA13(Q9P0J0)是开发抗癌新药的靶点。
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