公开(公告)号：CN118166128A

公开(公告)日：2024-06-11

申请号：CN202211582824.5

申请日：2022-12-09

申请人： 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)

发明人： 吴舟桥 ,  周源 ,  刘磊波 ,  王一丁 ,  郭婷 ,  李子禹 ,  季加孚

IPC分类号： C12Q1/689 ,  G16B40/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/04 ,  C12R1/01 ,  C12R1/38 ,  C12R1/46 ,  C12R1/63

摘要： 本发明涉及生物信息学和生物医学，具体涉及术后感染的诊断；通过对胃肠道肿瘤术后患者引流液中细菌的16S rRNA进行检测，经过微生物分类数据聚类、分析，获得胃肠道肿瘤术后患者术后感染的代表性菌群，通过菌群的差异性，通过差异分析和特征筛选，最终得到30个OTUs，涵盖26个Genus(属)；由30个OTUs特征构建的逻辑回归模型进行验证，ROC分析结果中AUC可稳定在0.95以上；从而通过ROC预测曲线预测胃肠道肿瘤术后患者感染的风险；当ROC曲线的AUC面积大于预定值，则诊断为有腹腔感染。

公开(公告)号：CN108959843A

公开(公告)日：2018-12-07

申请号：CN201810573816.1

申请日：2018-06-06

申请人： 北京大学

发明人： 崔庆华 ,  周源 ,  曾攀

IPC分类号： G06F19/00

摘要： 本发明公开了靶向RNA的化学小分子药物计算机筛选方法，包含以下步骤：(1)收集和整理训练数据集，(2)挖掘预测方法特征，(3)创建预测方法与模型，(4)验证预测方法与模型。本发明可为靶向RNA的化学小分子的计算机筛选；基于RNA的重大疾病防治提供新的解决策略。

公开(公告)号：CN116333930A

公开(公告)日：2023-06-27

申请号：CN202310224045.6

申请日：2023-03-10

申请人： 北京肿瘤医院(北京大学肿瘤医院)

发明人： 王一丁 ,  吴舟桥 ,  周源 ,  刘磊波 ,  郭婷 ,  陕飞 ,  邢晓芳 ,  李子禹 ,  季加孚

IPC分类号： C12N1/20 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/6869 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  C12R1/01 ,  C12R1/21 ,  C12R1/22 ,  C12R1/38 ,  C12R1/46

摘要： 本发明涉及生物信息学和生物医学，具体涉及肠癌术后腹腔感染的诊断；通过对肠癌术后患者引流液中细菌的16SrRNA进行检测，经过微生物分类数据聚类、分析，获得肠癌患者术后腹腔感染的代表性菌群，通过菌群的差异性，通过差异分析和特征筛选，最终得到得到24个OTUs，涵盖23个Genus。由24个特征构建的Logistic回归模型进行验证，ROC分析结果AUC可稳定在0.95以上。从而通过ROC预测曲线预测胃肠道肿瘤术后患者感染的风险；当ROC曲线的AUC面积大于预定值，则诊断为有腹腔感染。