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公开(公告)号：CN104946763A
公开(公告)日：2015-09-30
申请号：CN201510338932.1
申请日：2015-06-18
Applicant: 云南省热带作物科学研究所 , 云南大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明涉及暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，属DNA分子标记技术领域。本发明在已经获得其基因组数据的基础之上，利用常规的生物信息学方法，在基因组水平上检测其SSR的分布，进行引物设计，利用来自西双版纳地区的暗褐网柄牛肝菌样品，选取部分引物进行初筛、复筛后，得到15个具有多态性的SSR分子标记，其编号为： PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147。本发明的有益效果在于：暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，建立技术体系，弥补其特异性分子标记的空白，为暗褐网柄牛肝菌遗传多样性，群体遗传学及种质鉴定研究提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN113604602A
公开(公告)日：2021-11-05
申请号：CN202111039221.6
申请日：2021-09-06
Applicant: 云南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了捕食线虫真菌寡孢节丛孢的STR分子标记，具体涉及DNA分子标记技术领域，包括以下具体步骤：步骤一、寡孢节丛孢全基因组STR扫描及引物设计，步骤二、寡孢节丛孢基因组DNA的提取和检测，步骤三、STR引物的初筛和及产物检测，步骤四、基于STR数据的遗传多样性分析。本发明通过在已经获得寡孢节丛孢基因组数据的基础之上，利用常规生物信息学方法，在基因组水平上检测其STR的分布，进行引物设计，利用分离自不同生长环境的寡孢节丛孢菌株样品，选取部分引物进行初筛、复筛后，得到20个具有多态性的STR分子标记，且该分子标记具有多态性高，重复性好，检测方便快捷和使用成本低廉等优势。
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公开(公告)号：CN104946763B
公开(公告)日：2018-03-16
申请号：CN201510338932.1
申请日：2015-06-18
Applicant: 云南省热带作物科学研究所 , 云南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，属DNA分子标记技术领域。本发明在已经获得其基因组数据的基础之上，利用常规的生物信息学方法，在基因组水平上检测其SSR的分布，进行引物设计，利用来自西双版纳地区的暗褐网柄牛肝菌样品，选取部分引物进行初筛、复筛后，得到15个具有多态性的SSR分子标记，其编号为：PP50097、PP64100、PP32087、PP85099、PP80085、PP56123、PP76127、PP57130、PP39117、PP60130、PP93120、PP23157、PP45160、PP30156、PP48147。本发明的有益效果在于：暗褐网柄牛肝菌SSR分子标记，建立技术体系，弥补其特异性分子标记的空白，为暗褐网柄牛肝菌遗传多样性，群体遗传学及种质鉴定研究提供有力的研究工具。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN105063761A
公开(公告)日：2015-11-18
申请号：CN201510552734.5
申请日：2015-09-02
Applicant: 云南大学
Abstract: 一种用DNA条形码鉴别捕食线虫丝孢菌节丛孢属的方法，属真菌物种鉴定领域。该方法使用RPB2基因作为捕食线虫丝孢菌节丛孢属鉴定的目标DNA条形码基因，采用合并节丛孢属样本实验数据和目标真菌数据的策略构建高容量数据库，同时使用待鉴别真菌的RPB2基因与基因库进行比较，基于Kimura-2-parameter概率的遗传距离法和聚类分析的系统发生树法设立鉴定的规则鉴别物种。有益效果在于：RPB2基因作为最适合鉴别捕食线虫丝孢菌的DNA条形码，具有通用、易扩增、易比对的特点；该鉴别方法的鉴定效率及其鉴定的可靠性和准确性也大大优于常规的DNA条形码方法，弥补了捕食线虫丝孢菌DNA条形码分子标记的空白，为捕食线虫丝孢菌的种质资源挖掘、生防应用和遗传多样性研究提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN113604602B
公开(公告)日：2023-03-24
申请号：CN202111039221.6
申请日：2021-09-06
Applicant: 云南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了捕食线虫真菌寡孢节丛孢的STR分子标记，具体涉及DNA分子标记技术领域，由20个STR分子标记组合。本发明通过在已经获得寡孢节丛孢基因组数据的基础之上，利用常规生物信息学方法，在基因组水平上检测其STR的分布，进行引物设计，利用分离自不同生长环境的寡孢节丛孢菌株样品，选取部分引物进行初筛、复筛后，得到20个具有多态性的STR分子标记，且该分子标记具有多态性高，重复性好，检测方便快捷和使用成本低廉等优势。
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公开(公告)号：CN105238796A
公开(公告)日：2016-01-13
申请号：CN201510569031.3
申请日：2015-09-09
Applicant: 云南大学
Abstract: 本发明涉及鸡油菌复合种的标准基因及分子鉴定方法，属真菌物种鉴定领域。本发明引物序列：RPB1-S 5'-TTTGGGCGGTGAGGACTA-3'，RPB1-A 5'-GTGGGACGGGTAAGACAG-3'，该通用引物可针对鸡油菌RNA聚合酶Ⅰ大亚基基因（RPB1）基因进行扩增，获得标准检测基因。根据RPB1基因DNA序列的差异，可以快速准确鉴定鸡油菌复合种内的各个物种。本发明的有益效果在于：RPB1基因克服了传统鸡油菌形态不易鉴定的缺点，具有通用、易扩增、易比对的特点，其鉴定的可靠性和准确性也大大提高，为鸡油菌的种质资源挖掘、保护和利用提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN105238795A
公开(公告)日：2016-01-13
申请号：CN201510568850.6
申请日：2015-09-09
Applicant: 云南大学
Abstract: 本发明公开了一种毒蘑菇—毒沟褶菌(Trogia venenata)的DNA条形码的标准基因序列，所述条形码标准检测基因为TEF基因，基因序列SEQ ID NO.1。使用该方法进行聚合酶链式反应(PCR)扩增出样品TEF基因，PCR产物经过琼脂糖胶进行验证后送至生物测序公司测序，将测序结果通过手工校对、序列拼接，并进行比对，如果与所述基因序列SEQ ID NO.1的同源性在99％以上，即可判断所述的待测组织为毒沟褶菌(T. venenata)。本发明采用可靠的DNA分子鉴定技术，无需耗费大量的时间对其进行形态学鉴定，可以快速、准确的鉴定该种毒蘑菇。
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公开(公告)号：CN105238794A
公开(公告)日：2016-01-13
申请号：CN201510568849.3
申请日：2015-09-09
Applicant: 云南大学
Abstract: 本发明涉及一种鸡枞菌（Termitomyces clypeatus）分子鉴定的标准基因及分子鉴定方法，属真菌物种鉴定领域。本发明引物序列： RPB2B-f: 5’-CCGCAAAGGCTGGTGTATC-3’, RPB2B-r: 5’-TTCGAATGAGTTCAAGTGT-3’，该通用引物可针对鸡枞菌RNA聚合酶Ⅱ大亚基基因（RPB2）基因进行扩增，获得标准检测基因。根据RPB2基因DNA序列的差异，可以快速准确鉴定鸡枞菌（尖盾白蚁伞）。本发明的有益效果在于：RPB2基因克服了传统鸡枞菌形态不易鉴定的缺点，具有通用、易扩增、易比对的特点，其鉴定的可靠性和准确性也大大提高，为鸡枞菌的种质资源挖掘、保护和利用提供有力的研究工具。
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