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公开(公告)号：CN105063761A
公开(公告)日：2015-11-18
申请号：CN201510552734.5
申请日：2015-09-02
Applicant: 云南大学
Abstract: 一种用DNA条形码鉴别捕食线虫丝孢菌节丛孢属的方法，属真菌物种鉴定领域。该方法使用RPB2基因作为捕食线虫丝孢菌节丛孢属鉴定的目标DNA条形码基因，采用合并节丛孢属样本实验数据和目标真菌数据的策略构建高容量数据库，同时使用待鉴别真菌的RPB2基因与基因库进行比较，基于Kimura-2-parameter概率的遗传距离法和聚类分析的系统发生树法设立鉴定的规则鉴别物种。有益效果在于：RPB2基因作为最适合鉴别捕食线虫丝孢菌的DNA条形码，具有通用、易扩增、易比对的特点；该鉴别方法的鉴定效率及其鉴定的可靠性和准确性也大大优于常规的DNA条形码方法，弥补了捕食线虫丝孢菌DNA条形码分子标记的空白，为捕食线虫丝孢菌的种质资源挖掘、生防应用和遗传多样性研究提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN107177672A
公开(公告)日：2017-09-19
申请号：CN201710406538.6
申请日：2017-06-02
Applicant: 云南大学
Abstract: 本发明涉及一种用于圆盘菌的标准基因序列及鉴定方法，属物种分子鉴定领域。所述标准检测线粒体mtLSU基因，基因序列SEQ ID NO.1。使用线粒体大亚基mtLSU基因通用引物ML7,ML8进行聚合酶链式反应(PCR)扩增，再用特异引物序列ML‑chaoF：AGAACAACGGCTAGGTGG，ML‑chaoR：GAACGAGTCCGCAGAAGA进行扩增，PCR产物经过琼脂糖胶进行验证后测序。根据mtLSU基因的序列差异，可以快速准确的鉴定圆盘菌。本发明采用可靠的DNA分子鉴定技术，无需耗费大量的时间对其进行形态学鉴定，可以快速、准确的鉴定圆盘菌，为动植物线虫的防治提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN107177672B
公开(公告)日：2020-12-11
申请号：CN201710406538.6
申请日：2017-06-02
Applicant: 云南大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明涉及一种用于圆盘菌的标准基因序列及鉴定方法，属物种分子鉴定领域。所述标准检测线粒体mtLSU基因，基因序列SEQ ID NO.1。使用线粒体大亚基mtLSU基因通用引物ML7,ML8进行聚合酶链式反应(PCR)扩增，再用特异引物序列ML‑chaoF：AGAACAACGGCTAGGTGG，ML‑chaoR：GAACGAGTCCGCAGAAGA进行扩增，PCR产物经过琼脂糖胶进行验证后测序。根据mtLSU基因的序列差异，可以快速准确的鉴定圆盘菌。本发明采用可靠的DNA分子鉴定技术，无需耗费大量的时间对其进行形态学鉴定，可以快速、准确的鉴定圆盘菌，为动植物线虫的防治提供有力的研究工具。
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公开(公告)号：CN107190061A
公开(公告)日：2017-09-22
申请号：CN201710406542.2
申请日：2017-06-02
Applicant: 云南大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/166
Abstract: 本发明涉及一种用于捕食线虫丝孢菌的标准基因序列及鉴定方法，属物种分子鉴定领域。所述标准检测COX1基因，基因序列SEQ ID NO.1。使用线粒体细胞色素氧化酶I COX1基因通用引物PenF1,AspR1进行聚合酶链式反应(PCR)扩增，再用特异引物序列PenF1‑chao：ATGCTAAAGACATTGGTA,AspR1‑chao：ACGTATACCTGGACTTC进行扩增，PCR产物经过琼脂糖胶进行验证后测序。根据COX1基因的序列差异，可以快速准确的鉴定捕食线虫丝孢菌。本发明可以快速、准确的鉴定该捕食线虫丝孢菌，为动植物线虫的防治提供有力的研究工具。
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