一种针对CRISPR-Cas系统的筛选方法及装置

    公开(公告)号:CN115954048B

    公开(公告)日:2023-06-16

    申请号:CN202310004646.6

    申请日:2023-01-03

    Abstract: 本说明书公开了一种针对CRISPR‑Cas系统的筛选方法及装置,可以获取CRISPR‑Cas系统的相关信息以及对应的标注信息,CRISPR‑Cas系统对应的标注信息用于表示该CRISPR‑Cas系统是否具有自处理能力;而后,可以根据该相关信息,确定CRISPR‑Cas系统中的保守重复序列,并根据保守重复序列,确定该CRISPR‑Cas系统对应的基因特征,进而对预测模型进行训练,训练后的预测模型可以用于筛选出用于基因编辑工具开发的目标CRISPR‑Cas系统,本方法通过自动筛选出一批存在较大概率具有自处理能力的CRISPR‑Cas系统,能够提高基因编辑工具的开发的效率。

    一种CRISPR-Cas酶可突变位点推荐方法和装置

    公开(公告)号:CN115312122B

    公开(公告)日:2022-12-16

    申请号:CN202211245583.5

    申请日:2022-10-12

    Abstract: 本发明公开了一种CRISPR‑Cas酶可突变位点推荐方法和装置,该方法分三个层次推荐蛋白突变位点:1)基于蛋白质碱性氨基酸比例推荐单突变位点;2)基于蛋白3D结构空间距离推荐双突变位点;3)基于空间距离聚类推荐多突变位点。本发明在蛋白质序列同源比对的基础上,利用同源蛋白的碱性氨基酸比例、蛋白质3D结构空间距离等信息预测、排序、推荐可突变位点,相较于传统的定向进化技术实现了可突变位点的高效筛选,降低了寻找可突变位点的湿实验成本,其实现方法简单灵活、使用推荐的位点进行突变得到的Cas酶活性显著增强。这些优势使得基于本发明的CRISPR‑Cas酶活性增强工具在基因功能研究、致病位点修复等多种领域具有较高的应用价值。

    一种针对CRISPR-Cas系统的筛选方法及装置

    公开(公告)号:CN115954048A

    公开(公告)日:2023-04-11

    申请号:CN202310004646.6

    申请日:2023-01-03

    Abstract: 本说明书公开了一种针对CRISPR‑Cas系统的筛选方法及装置,可以获取CRISPR‑Cas系统的相关信息以及对应的标注信息,CRISPR‑Cas系统对应的标注信息用于表示该CRISPR‑Cas系统是否具有自处理能力;而后,可以根据该相关信息,确定CRISPR‑Cas系统中的保守重复序列,并根据保守重复序列,确定该CRISPR‑Cas系统对应的基因特征,进而对预测模型进行训练,训练后的预测模型可以用于筛选出用于基因编辑工具开发的目标CRISPR‑Cas系统,本方法通过自动筛选出一批存在较大概率具有自处理能力的CRISPR‑Cas系统,能够提高基因编辑工具的开发的效率。

    一种CRISPR-Cas酶可突变位点推荐方法和装置

    公开(公告)号:CN115312122A

    公开(公告)日:2022-11-08

    申请号:CN202211245583.5

    申请日:2022-10-12

    Abstract: 本发明公开了一种CRISPR‑Cas酶可突变位点推荐方法和装置,该方法分三个层次推荐蛋白突变位点:1)基于蛋白质碱性氨基酸比例推荐单突变位点;2)基于蛋白3D结构空间距离推荐双突变位点;3)基于空间距离聚类推荐多突变位点。本发明在蛋白质序列同源比对的基础上,利用同源蛋白的碱性氨基酸比例、蛋白质3D结构空间距离等信息预测、排序、推荐可突变位点,相较于传统的定向进化技术实现了可突变位点的高效筛选,降低了寻找可突变位点的湿实验成本,其实现方法简单灵活、使用推荐的位点进行突变得到的Cas酶活性显著增强。这些优势使得基于本发明的CRISPR‑Cas酶活性增强工具在基因功能研究、致病位点修复等多种领域具有较高的应用价值。

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