公开(公告)号：CN117594156A

公开(公告)日：2024-02-23

申请号：CN202311496788.5

申请日：2023-11-10

Applicant: 之江实验室

Inventor： 杨耀东 ,  陈广勇 ,  李蓝青 ,  李金鹏 ,  张昊天 ,  王二成 ,  王平安

IPC: G16C20/50 ,  G16C20/70 ,  G06F16/901 ,  G06F16/903 ,  G06F17/18

Abstract: 本发明公开了一种基于蒙特卡洛树搜索的多目标分子生成方法和装置，属于基于靶点的分子生成领域，包括：基于已知的蛋白质序列和分子碎片，以及用户多目标属性需求，本发明采用构建蒙特卡洛树的方式，依次将满足用户需求且亲和力强的原子符号拼接到分子碎片之后，最后得到的完整的分子再通过化学工具分析属性，得到分子的评估值，其中包含了用户对于分子的多目标属性的需求，再将构建起来的非支配的分子加入全局帕累托集合中，用于构建用户需要的分子。本发明采用蒙特卡洛树搜索算法，同时提出多目标选择标准，实现了用户指定的多目标属性的分子生成，具有简单易行、快速有效且搜索效率高的优势。

公开(公告)号：CN117316330A

公开(公告)日：2023-12-29

申请号：CN202311158775.7

申请日：2023-09-08

Applicant: 之江实验室

Inventor： 张昊天 ,  侯廷军 ,  陈广勇 ,  王二成 ,  张徐俊 ,  黄元盛 ,  吴正健 ,  杨耀东 ,  王天玥

IPC: G16C20/50 ,  G16C20/70 ,  G16C20/10 ,  G06N3/0895

Abstract: 本申请涉及一种先导化合物优化方法、装置、电子装置和存储介质，其中，该方法包括：将蛋白小分子掩码训练对数据输入至待训练先导化合物优化模型；调用多个网络层对先导化合物的训练样本数据进行预测，得到与蛋白口袋匹配的新生成原子的信息；基于新生成原子的信息，计算得到待训练先导化合物优化模型的损失值；确定损失值在预设的阈值范围内的待训练先导化合物优化模型为目标先导化合物优化模型；将待优化蛋白口袋数据和待优化分子片段数据输入至目标先导化合物优化模型，得到优化后的先导化合物。通过本申请解决了传统先导化合物优化方法受限于事先准备的化合物库所表达的活性化合物空间的问题。