公开(公告)号：CN119763720A

公开(公告)日：2025-04-04

申请号：CN202411330327.5

申请日：2024-09-24

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 齐晓宁 ,  赵连鹤 ,  赵屹

IPC: G16C20/70 ,  G16C20/64 ,  G06N3/0455 ,  G16B40/00 ,  G16B25/10

Abstract: 本发明提供一种用于预测对新型药物扰动的转录响应的方法、基于该预测方法的虚拟筛选的方法以及基于以上方法的虚拟筛选系统。其中，预测模型包括扰动适配器、扰动编码器和扰动解码器。扰动适配器，用于将输入的一种或多种新型药物的化学结构和其剂量信息编码到扰动嵌入中；扰动编码器，用于将新型药物的扰动对输入的未扰动转录谱的影响映射到可解释的潜在空间，得到未扰动状态的潜在表示；以及扰动解码器，用于基于潜在表示和扰动嵌入预测新型药物扰动的转录响应的分布。根据新型药物的预测转录响应进行虚拟筛选，计算候选化合物对疾病敏感药物的富集分数，根据富集分数进型化合物推荐。本发明的预测模型的灵活性和扩展性能够无需先验知识或注释。

公开(公告)号：CN119541828A

公开(公告)日：2025-02-28

申请号：CN202411597421.7

申请日：2024-11-11

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 乔艺璇 ,  赵屹 ,  赵连鹤 ,  吴杨

IPC: G16H50/20 ,  G06F18/241 ,  G06F18/25 ,  G06N3/0442 ,  G06N3/045 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/0985

Abstract: 本发明提出一种慢性肾脏疾病进展预测方法、装置，该方法包含：收集关于慢性肾脏疾病的多模态数据，将所述多模态数据输入至构建的预测模型中进行训练，若识别属于表格数据，通过所述表格特征提取器对该模态数据进行特征聚合并编码为多个一维特征向量，且将该多个一维特征向量整合为表格数据代表向量；若识别属于图像数据，通过所述图像特征提取器对该模态数据整图进行训练，整合得到图像代表向量；通过所述多模态融合分类器对所有所述表格数据代表向量与所有所述图像代表向量进行拼接融合后进行分类预测。该方法能够以极高的精度预测慢性肾脏疾病进展。

公开(公告)号：CN115602326A

公开(公告)日：2023-01-13

申请号：CN202211292710.7

申请日：2022-10-21

Applicant: 中国科学院计算技术研究所(CN)

Inventor： 卜德超 ,  赵屹 ,  靳辉 ,  赵连鹤

IPC: G16H50/30 ,  G16H50/70 ,  G16B35/20 ,  G16B50/00

Abstract: 本发明提供了一种用于挖掘肿瘤标志物的方法，包括：S1、获取预定的多个分子通路所含有的所有基因在预设的实验组、对照组中分别发生变异的频率，实验组中的每个样本患有预定类别的肿瘤，对照组中的每个样本未患有所述预定类别的肿瘤或者患有所述预定类别的肿瘤但与实验组的样本的分型不同；S2、基于每个分子通路所含有的基因在实验组、对照组中分别发生变异的频率，确定在实验组和对照组中每个基因发生变异频率的差异指数；S3、针对每个分子通路，将该分子通路所含有的所有基因发生变异频率的差异指数求和，得到该分子通路的差异指数；S4、从预定的多个分子通路中，选择分子通路的差异指数大于预定检测阈值的分子通路作为肿瘤标志物。