公开(公告)号：CN113151498A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110446583.0

申请日：2021-04-25

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  林珊 ,  韩博 ,  杨宇泽 ,  唐韶青 ,  刘林 ,  麻柱 ,  刘亚楠 ,  吕小青

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种用于检测奶牛产奶性状的COL5A3基因SNPs标记及其应用。本发明提供了用于检测SNP甲基因型的物质和/或用于检测SNP乙基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用；所述SNP甲为7:g.14587807C>A；所述SNP乙为7:g.14587168G>A。本发明公开的分子标记可以应用于辅助鉴定具有优良产奶性状的牛群体，具有如下优点：简便、快速、灵敏，结果可靠、稳定、准确，适合实验室大群体规模检测的需要。

公开(公告)号：CN113151499B

公开(公告)日：2022-07-05

申请号：CN202110446586.4

申请日：2021-04-25

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  刘亚楠 ,  韩博 ,  路永强 ,  麻柱 ,  刘林 ,  唐韶青 ,  杨宇泽 ,  林珊 ,  吕小青

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种利用FGFR4基因SNPs分子标记检测奶牛产奶性状的方法及应用，所述产奶性状具体涉及乳脂量和乳蛋白量。g.38574544T>A和/或g.38582134C>T和/或g.38585427C>T分子标记在第一泌乳期与乳脂量和乳蛋白量达到显著或极显著水平的关联(P＝0.0385～0.0068)；在第二泌乳期与产奶量、乳脂量和乳蛋白量达到显著或极显著水平的关联(P＝0.0449～0.0006)。

公开(公告)号：CN113151499A

公开(公告)日：2021-07-23

申请号：CN202110446586.4

申请日：2021-04-25

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  刘亚楠 ,  韩博 ,  路永强 ,  麻柱 ,  刘林 ,  唐韶青 ,  杨宇泽 ,  林珊 ,  吕小青

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种利用FGFR4基因SNPs分子标记检测奶牛产奶性状的方法及应用，所述产奶性状具体涉及乳脂量和乳蛋白量。g.38574544T>A和/或g.38582134C>T和/或g.38585427C>T分子标记在第一泌乳期与乳脂量和乳蛋白量达到显著或极显著水平的关联(P＝0.0385～0.0068)；在第二泌乳期与产奶量、乳脂量和乳蛋白量达到显著或极显著水平的关联(P＝0.0449～0.0006)。

公开(公告)号：CN116356041A

公开(公告)日：2023-06-30

申请号：CN202310266276.3

申请日：2023-03-20

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  张琪 ,  麻柱 ,  刘林 ,  李艳华 ,  倪俊卿 ,  李喜和 ,  孙伟 ,  李建斌 ,  贺巾锋 ,  郑伟杰 ,  韩博 ,  张毅 ,  杨智超

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种低密度奶牛全基因组30K SNP芯片，其包含检测30326个SNP位点的试剂，所述SNP位点来自：第一类，发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点，包含3,399个SNP位点；第二类，奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点，包含226个SNP个位点；第三类，基于我国的大规模奶牛群体，根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布，从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点，包含26,701个SNP位点。本发明的芯片，可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

公开(公告)号：CN117431324A

公开(公告)日：2024-01-23

申请号：CN202311218327.1

申请日：2023-09-20

Applicant: 中国农业大学 ,  北京奶牛中心

Inventor： 孙东晓 ,  麻柱 ,  刘林 ,  郑伟杰 ,  张琪 ,  吕小青 ,  李艳华 ,  贺巾锋 ,  韩博

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6874

Abstract: 本发明提供一种中高密度奶牛全基因组126K SNP芯片，其包含检测120,155个SNP位点的试剂，所述SNP位点来自：第一类，发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点，包含5,363个SNP位点；第二类，奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点，包含223个SNP个位点；第三类，基于我国的大规模奶牛群体，根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布，从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点，包含114,569个SNP位点。本发明的芯片，可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

公开(公告)号：CN113151498B

公开(公告)日：2022-09-27

申请号：CN202110446583.0

申请日：2021-04-25

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  林珊 ,  韩博 ,  杨宇泽 ,  唐韶青 ,  刘林 ,  麻柱 ,  刘亚楠 ,  吕小青

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了一种用于检测奶牛产奶性状的COL5A3基因SNPs标记及其应用。本发明提供了用于检测SNP甲基因型的物质和/或用于检测SNP乙基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用；所述SNP甲为7:g.14587807C>A；所述SNP乙为7:g.14587168G>A。本发明公开的分子标记可以应用于辅助鉴定具有优良产奶性状的牛群体，具有如下优点：简便、快速、灵敏，结果可靠、稳定、准确，适合实验室大群体规模检测的需要。

公开(公告)号：CN114150073A

公开(公告)日：2022-03-08

申请号：CN202111526936.4

申请日：2021-12-14

Applicant: 北京奶牛中心 ,  中国农业大学

Inventor： 吕小青 ,  刘林 ,  孙东晓 ,  麻柱 ,  韩博 ,  杨宇泽 ,  赵凤 ,  李艳华 ,  路永强 ,  张建聪 ,  王彦平

IPC: C12Q1/6888 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及用于检测奶牛产奶性状的23个SNP标记及应用。本发明提供了检测如下23个SNP位点基因型的物质在鉴定或辅助鉴定奶牛产奶性状中的应用。该23个SNP位点与奶牛305天产奶量、乳脂量、乳脂率、乳脂蛋白量或乳脂蛋白率相关，可用于奶牛选育。

公开(公告)号：CN116356041B

公开(公告)日：2025-04-01

申请号：CN202310266276.3

申请日：2023-03-20

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  张琪 ,  麻柱 ,  刘林 ,  李艳华 ,  倪俊卿 ,  李喜和 ,  孙伟 ,  李建斌 ,  贺巾锋 ,  郑伟杰 ,  韩博 ,  张毅 ,  杨智超

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6837 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种低密度奶牛全基因组30K SNP芯片，其包含检测30326个SNP位点的试剂，所述SNP位点来自：第一类，发明人团队前期研究挖掘与鉴定的奶牛重要经济性状显著相关的SNP位点，包含3,399个SNP位点；第二类，奶牛主要遗传缺陷基因位点和亲子鉴定基因位点，包含226个SNP个位点；第三类，基于我国的大规模奶牛群体，根据检出率、基因频率、位置唯一性、基因型填充原理及基因组上的分布，从现有商业化奶牛基因组芯片挑选的SNP位点，包含26,701个SNP位点。本发明的芯片，可用于进行中国荷斯坦牛的全基因组关联分析、全基因组选择育种、亲子鉴定和常见牛遗传缺陷鉴定等方面。

公开(公告)号：CN119433045A

公开(公告)日：2025-02-14

申请号：CN202411691647.3

申请日：2024-11-25

Applicant: 中国农业大学

Inventor： 孙东晓 ,  宋建 ,  贺巾锋 ,  郑伟杰 ,  刘林 ,  麻柱 ,  钱长嵩 ,  孙伟 ,  顾垚 ,  韩博 ,  倪俊卿 ,  李建斌

IPC: C12Q1/6888 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q1/6874 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明公开了基于靶向捕获测序的奶牛10K低密度SNP芯片及其应用。本发明提供了用于检测奶牛基因型的10K低密度芯片，包括：特异性检测奶牛基因组上11352个SNP位点和6个INDEL位点(主要包括与奶牛重要性状相关的位点、亲子鉴定和遗传缺陷位点以及从现有商业化奶牛基因组芯片上挑选的位点这三类)的单链核苷酸探针。本发明所提供的10K低密度基因组芯片较现有的高密度芯片检测成本低，且与现有高密度芯片相比，本发明10K芯片在SNP检出率、多态性检测、个体基因型检出率、遗传评估准确性等方面检测性能一致。本发明的芯片可应用于奶牛全基因组选择以及遗传缺陷鉴定，对于后备牛的早期选育、母牛核心群组建、选种选配以及加快遗传进展、提升饲料管理效率具有重要意义。