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公开(公告)号:CN119433045A
公开(公告)日:2025-02-14
申请号:CN202411691647.3
申请日:2024-11-25
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6883 , C12Q1/6874 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了基于靶向捕获测序的奶牛10K低密度SNP芯片及其应用。本发明提供了用于检测奶牛基因型的10K低密度芯片,包括:特异性检测奶牛基因组上11352个SNP位点和6个INDEL位点(主要包括与奶牛重要性状相关的位点、亲子鉴定和遗传缺陷位点以及从现有商业化奶牛基因组芯片上挑选的位点这三类)的单链核苷酸探针。本发明所提供的10K低密度基因组芯片较现有的高密度芯片检测成本低,且与现有高密度芯片相比,本发明10K芯片在SNP检出率、多态性检测、个体基因型检出率、遗传评估准确性等方面检测性能一致。本发明的芯片可应用于奶牛全基因组选择以及遗传缺陷鉴定,对于后备牛的早期选育、母牛核心群组建、选种选配以及加快遗传进展、提升饲料管理效率具有重要意义。
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公开(公告)号:CN119993270A
公开(公告)日:2025-05-13
申请号:CN202510100761.2
申请日:2025-01-21
Applicant: 石家庄博瑞迪生物技术有限公司 , 中国农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习和遗传特性进行猪品种鉴定的方法,涉及生物基因模型预测领域。本发明利用图神经网络深度学习模型,从基因型数据中学习样本间复杂的遗传关系和血统结构,有效克服了现有技术在血统组成预测中的局限性。通过构建基于基因型数据相似性和遗传关系的图结构,模型能够捕捉到基因位点之间的相互作用以及样本之间的关系,从而提供更加精确的血统占比预测。本发明不仅提高了对复杂血统组成的预测准确性,而且能够根据样本的具体基因型数据动态调整血统占比的估算,避免了传统方法中血统分类的局限性。
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