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公开(公告)号：CN117867072A
公开(公告)日：2024-04-12
申请号：CN202311780744.5
申请日：2023-12-22
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/24
Abstract: 本发明公开了一种肠道样本预处理和单细胞悬液制备方法，即一种肠道组织样本预处理方法和优化的两步法制备单细胞悬液的方法。本发明通过样本固定预处理、优化酶解消化体系和实验流程，显著提升了肠道样本在保存或运输期间的样本稳定性，缩短了解离所需时间，并显著改善了以往肠道样本单细胞测序中常见的细胞类型偏好性和线粒体基因表达偏高等缺点。本发明方法可应用于单细胞测序、单细胞悬液制备、肠道原代细胞解离等。本发明具有广泛应用前景。
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公开(公告)号：CN115896003A
公开(公告)日：2023-04-04
申请号：CN202211026669.9
申请日：2022-08-25
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/071 , C12N5/078 , C12N5/0784 , C12N5/0786 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明首次创新公开了一种用于单细胞测序的肝组织样本制备方法，包括离体肝组织灌注处理和单细胞悬液制备方法。本发明还公开用于前述方法中的试剂盒。本发明弥补了以往实验方法造成的某些细胞类型的细胞数过少或丢失的缺点。本发明还公开了所述的方法在单细胞测序、单细胞悬液制备、肝脏原代细胞解离中的应用。
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公开(公告)号：CN115584338A
公开(公告)日：2023-01-10
申请号：CN202211257502.3
申请日：2022-10-14
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04
Abstract: 本发明提供了一种拟南芥叶片样本组织解离液及解离方法。本发明使用自主研发的酶解方案提升了拟南芥叶片的原生质体得率，通过组织表面清洗、样本剪碎、酶解消化、筛网过滤、去杂洗涤、细胞重悬，使得原生质体的质量较好(活性高，数量多，杂质少)。本发明在原生质体得率上与减少叶绿体的占比上有了明显的提高。
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公开(公告)号：CN116486914A
公开(公告)日：2023-07-25
申请号：CN202310017756.6
申请日：2023-01-06
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于单细胞转录组测序的物种间同源基因转换分析方法，包括：步骤一、利用单细胞转录组标准分析软件Seurat产生获得RDS文件；步骤二、根据需要做同源转换的物种拉丁名，判断所述需要做同源转换的物种是否属于21个模式生物列表中；步骤三、若待转换的物种属于步骤二中的模式生物列表中，则使用homologene方法进行同源基因转换，获得物种间同源基因列表；或，若待转换的物种不属于步骤二中的模式生物列表中，则使用blast方法进行同源基因转换，获得物种间同源基因列表；步骤四、根据步骤三中获得的物种间同源基因列表，对待转换物种的RDS文件中的表达矩阵进行替换；步骤五、将替换完成后的文件保存为新的RDS文件。本发明还公开了实现上述方法的系统。
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公开(公告)号：CN116403640A
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202310304174.6
申请日：2023-03-27
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种同一组织外泌体miRNA和单细胞核转录组数据联合分析，以获取miRNA介导的细胞群调控网络的方法。通过鉴定单细胞核转录组数据中primarymiRNA及其在mRNA细胞类群中的表达数据，可获得上游细胞和miRNA关系对；通过关联外泌体miRNA表达数据、单细胞mRNA表达数据，可获得miRNA和下游细胞类型gene(mRNA)关系对；最后基于前两种方法结果和单细胞转录组细胞通讯数据，可构建完整上游细胞‑miRNA‑下游细胞功能互作调控网络，为鉴定特定miRNA的来源细胞类型以及下游调控细胞类型，明确不同细胞类型之间的互作与调控提供了数据支持。实现从实验到生物信息分析的同一组织外泌体miRNA测序分析及单细胞核测序分析的完整技术方案。本发明还公开了实现上述方法的系统及方法的应用。
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