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公开(公告)号：CN116486914A
公开(公告)日：2023-07-25
申请号：CN202310017756.6
申请日：2023-01-06
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种基于单细胞转录组测序的物种间同源基因转换分析方法，包括：步骤一、利用单细胞转录组标准分析软件Seurat产生获得RDS文件；步骤二、根据需要做同源转换的物种拉丁名，判断所述需要做同源转换的物种是否属于21个模式生物列表中；步骤三、若待转换的物种属于步骤二中的模式生物列表中，则使用homologene方法进行同源基因转换，获得物种间同源基因列表；或，若待转换的物种不属于步骤二中的模式生物列表中，则使用blast方法进行同源基因转换，获得物种间同源基因列表；步骤四、根据步骤三中获得的物种间同源基因列表，对待转换物种的RDS文件中的表达矩阵进行替换；步骤五、将替换完成后的文件保存为新的RDS文件。本发明还公开了实现上述方法的系统。
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