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公开(公告)号：CN117316281A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202210704954.5
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: G16B30/10 , G16B40/00 , G16B20/50 , C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于cfDNA在TSS附近测序覆盖深度特征的癌症无创早筛方法及系统。该方法通过较低深度的全基因测序方式对肿瘤来源cfDNA与健康个体来源的cfDNA在TSS附近的测序数据覆盖深度模式差异统计，建立癌症的早期筛查模型，实现对癌症的无创早筛。定义TSS上下游500bp[‑250bp,250bp]的区域为中心区域，TSS上游[‑2000bp,‑1000bp]和下游[1000bp,2000bp]为周围区域；一个基因的NF值为中心区域的平均覆盖度除以周围区域的平均覆盖度。本发明采用低深度的全基因组测序方式，大幅降低成本，并且可以在癌症较早期检测到早于cfDNA突变的片段异常变化，此方法较检测cfDNA突变信息来说更加灵敏。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117802230A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202211231738.X
申请日：2022-09-30
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了血液胞外囊泡miRNA，hsa‑miR‑200a‑5p可以作为鉴别卵巢肿瘤良恶性的生物标志物，从而能够用于制备鉴别卵巢肿瘤良恶性的芯片、检测试剂或检测试剂盒。利用该miRNA作为生物标志物能够提高卵巢癌早期诊断的特异性，降低其假阳性，从而对卵巢病变的良恶性鉴别以及卵巢癌的早期诊断具有潜在的良好临床应用价值。
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公开(公告)号：CN117316278A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202210704961.5
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: G16B30/00 , G16B40/00 , G16B20/00 , C12Q1/6869 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种基于cfDNA片段长度分布特征的癌症无创早筛方法及系统。该方法通过较低深度的全基因测序方式对肿瘤来源cfDNA与健康个体来源cfDNA的片段长度分布特征差异统计，建立癌症的早期筛查模型，实现对癌症的无创早筛。本发明方案聚焦血液cfDNA片段大小这一特征来区分ctDNA和非肿瘤来源的cfDNA，不依赖于致癌基因或者抑癌基因的突变检测，排除了克隆性造血突变引起的干扰；其次，本发明实施例数据表明，采用血液cfDNA片段大小特征可以区分健康人和早期肿瘤患者；最后，由于采用低深度全基因测序技术，本发明方案涉及检测费用大幅下降，有利于未来在恶性肿瘤早筛领域的应用。
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公开(公告)号：CN117316280B
公开(公告)日：2025-03-21
申请号：CN202210704951.1
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: G16B30/10 , G16B40/00 , G16B20/50 , C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于cfDNA末端序列特征的癌症无创早筛方法及系统。该方法通过较低深度的全基因测序方式对肿瘤来源cfDNA与健康个体来源的cfDNA在断裂位置上下游连续3组3bp碱基组合类别分布频率变化趋势进行差异统计，建立癌症的早期筛查模型，实现对癌症的无创早筛。本发明以5’末端位置连续9位以3个碱基为单位的组合DNA基序组合种类的分布绘制整体的图谱，并以频率作为训练特征在所研究队列中建立用于胆胰肿瘤的早期诊断模型，并评估模型的效能。此方法采用更精准的分析血液中肿瘤DNA方法以寻找肿瘤早诊的线索，为临床精准应用提供更为坚实可靠的数据支撑。
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公开(公告)号：CN117802228A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202211231729.0
申请日：2022-09-30
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6883 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了血液胞外囊泡miRNA，miR‑550a‑3‑5p可以作为卵巢癌的早期诊断，尤其是区分卵巢肿瘤良恶性的生物标志物，从而能够用于制备卵巢癌的早期诊断，尤其是区分卵巢肿瘤良恶性的芯片、检测试剂或检测试剂盒。利用该miRNA作为生物标志物能够提高卵巢癌早期诊断的特异性，降低其假阳性，从而对卵巢病变的良恶性鉴别以及卵巢癌的早期诊断具有潜在的良好临床应用价值。
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公开(公告)号：CN117316280A
公开(公告)日：2023-12-29
申请号：CN202210704951.1
申请日：2022-06-21
Applicant: 上海思路迪生物医学科技有限公司
IPC: G16B30/10 , G16B40/00 , G16B20/50 , C12Q1/6886 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种基于cfDNA末端序列特征的癌症无创早筛方法及系统。该方法通过较低深度的全基因测序方式对肿瘤来源cfDNA与健康个体来源的cfDNA在断裂位置上下游连续3组3bp碱基组合类别分布频率变化趋势进行差异统计，建立癌症的早期筛查模型，实现对癌症的无创早筛。本发明以5’末端位置连续9位以3个碱基为单位的组合DNA基序组合种类的分布绘制整体的图谱，并以频率作为训练特征在所研究队列中建立用于胆胰肿瘤的早期诊断模型，并评估模型的效能。此方法采用更精准的分析血液中肿瘤DNA方法以寻找肿瘤早诊的线索，为临床精准应用提供更为坚实可靠的数据支撑。
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