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公开(公告)号:CN118840746A
公开(公告)日:2024-10-25
申请号:CN202410829362.5
申请日:2024-06-25
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海浦东复旦大学张江科技研究院 , 复旦大学
Abstract: 本发明公开了基于函数型数据分析方法的低密度脂蛋白分型分析算法,涉及低密度脂蛋白分型检测技术领域;包括:S1:低密度脂蛋白分型图像信号作结构化数据处理;S2:低密度脂蛋白分型函数型图像信号的无监督特征提取;其中,所述S1的低密度脂蛋白分型图像信号作结构化数据处理。本发明通过将非结构化的图像信号转化为函数特征根矩阵及函数特征矩阵,算法将复杂的图像分析问题简化为更易于处理的结构化数据挖掘问题;利用二维函数空间映射,算法能够有效地保留原始图像信号中的空间相干性,能够更好的对图像中的模式识别和特征提取。
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公开(公告)号:CN119694564A
公开(公告)日:2025-03-25
申请号:CN202411750853.7
申请日:2024-12-02
Applicant: 复旦大学 , 上海浦东复旦大学张江科技研究院 , 上海宝藤生物医药科技股份有限公司
IPC: G16H50/30 , G06V10/774 , G06V10/764 , G06N20/20
Abstract: 本发明公开了一种基于低密度脂蛋白电泳图像识别与疾病预测模型及方法,涉及图像识别领域。包括采集多组患病正样本训练得到疾病预测训练模型;通过疾病预测训练模型测试患者的健康负样本;当输出标识为患有各疾病类型时,递归地移除健康负样本的各关键特征,直到疾病预测训练模型输出标识为不患有各疾病类型,采集移除的各关键特征为不重要特征,最终得到各疾病类型的不重要特征集;采集多组疾病预测优化数据;每组疾病预测优化数据均包括患者的健康负样本、每次递归地移除不重要特征后的关键特征,以及用于表示患者不患有各疾病类型的标识;多组疾病预测优化数据对疾病预测训练模型进行训练,提高了低密度脂蛋白电泳图像检测的速度和准确性。
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公开(公告)号:CN118112261A
公开(公告)日:2024-05-31
申请号:CN202410003171.3
申请日:2024-01-02
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海张江转化医学研发中心有限公司
IPC: G01N33/92
Abstract: 本发明公开了一种脂类质控品及其制备方法和应用。所述脂类质控品为冻干剂型,所述脂类质控品包括:基质液和脂类标志物;所述基质液包括基质、pH缓冲剂、填充剂、赋性剂和高分子保护剂;所述脂类标志物包括低密度脂蛋白质。本发明所述脂类质控品的长期储存稳定性及复溶后稳定性良好,2~8℃下保存有效期为6个月,适用于血清或血浆样本脂蛋白精确细分类检测的质量控制。
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公开(公告)号:CN119314563A
公开(公告)日:2025-01-14
申请号:CN202411380777.5
申请日:2024-09-30
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司
IPC: G16B40/00 , G16B20/30 , G06F18/2135 , G06F18/23 , G06N20/20
Abstract: 本发明涉及一种基于多维菌群特征和机器学习的慢性便秘肠道菌群移植供受体配型的方法及其应用,通过收集肠道菌群移植(FMT)治疗前供体与受体的16s rRNA肠道菌群数据以及FMT临床治疗疗效的回顾性数据,计算了供体与受体之间的菌群丰度差异度、代谢途径活性差异度,酶活性差异度和物种多样性差异度等特征,通过主成分分析对特征进行选择,筛选出能够解释90%方差的高贡献特征,使用随机森林机器学习模型筛选出其中与治疗疗效相关的特征标记物,计算出这些标记物在模型中的权重,最终通过对每个供体的菌群特征进行加权打分和排序,筛选出最优的供体。
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公开(公告)号:CN119993279A
公开(公告)日:2025-05-13
申请号:CN202510098070.3
申请日:2025-01-22
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司 , 南京江北医院 , 黄河三门峡医院
IPC: G16B40/00 , C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , G16B20/30 , G06F18/23213
Abstract: 本申请实施例提供一种基于共识矩阵进行女性阴道菌群结构分型的方法、装置和设备及存储介质,涉及生物检测技术领域,包括:基于提取的多个女性阴道分泌物拭子的DNA,采用16s rRNA引物进行PCR扩增,对每个扩增后的DNA进行测序、聚类,并对生成的ASV代表序列进行分类和注释,得到女性阴道菌群的相对丰度矩阵数据,对相对丰度矩阵数据的样本和菌种按照设定比例进行重复抽样,并对生成的多个子集采用多种聚类方法进行聚类,获得多个聚类结果;采用共识矩阵方法,获得相对丰度矩阵数据中任两条样本在多个聚类结果中的共现率;对获得的所有共现率进行聚类,获得菌群CST分型结果,用以提高女性阴道菌群结构分型的鲁棒性和准确性。
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公开(公告)号:CN118658516A
公开(公告)日:2024-09-17
申请号:CN202410811438.1
申请日:2024-06-21
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司 , 黄河三门峡医院
Abstract: 本发明涉及用于预测胃癌免疫治疗疗效的生物标志物及其应用。本发明综合分析肿瘤免疫微环境和抗原呈递特征,选取出与胃癌免疫治疗疗效响应相关的重要特征参数,挖掘可用于预测胃癌免疫治疗疗效的生物标志物,可用效用于构建预测模型,预测胃癌患者接受免疫治疗是否具有疗效,鉴别对免疫治疗响应的患者,提高胃癌免疫治疗受益者检出率,为诊断和治疗胃癌提供个性化策略。
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公开(公告)号:CN118335205A
公开(公告)日:2024-07-12
申请号:CN202410463165.6
申请日:2024-04-17
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于16S rRNA测序数据预测人体肠道健康状况的方法及其应用,包括:筛选代谢物小分子以及其主要生物途径中相关的酶;基于16SrRNA分析产生的OTU/ASV,构建包含参考基因组和环境采样生物的系统树,用于预测每个OTU/ASV的个体基因家族拷贝数;基于拷贝数预测采样序列的基因组含量;基于基因组含量预测酶活性相关基因家族的相对丰度谱,结合已知的功能注释数据库,预测每个样本中各个酶的相对丰度谱;酶的相对丰度谱反映了肠道内酶的活性,构建酶‑代谢物‑人体肠道微生态健康状况的生物网络,根据相关功能酶活性进行人体肠道微生态健康的评估/监控,以相关的酶活性变化反映人体肠道微生态健康状况。
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公开(公告)号:CN115896347A
公开(公告)日:2023-04-04
申请号:CN202211248089.4
申请日:2022-10-12
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海华藤生物科技有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种用于检测甲型流感病毒和乙型流感病毒的引物探针组合及其应用。所述引物探针组合包括甲型流感病毒的引物和探针以及乙型流感病毒的引物和探针。本发明开发恒温扩增快速检测甲、乙流病毒的引物探针组合,所述引物探针组合具有良好的灵敏度,能在20min内快速、高特异性地检测到低浓度模板,不易产生由高温引起的气溶胶污染,另外,且恒温检测仪器价格相对低廉,便于广泛推广应用。
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