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公开(公告)号：CN113241177B
公开(公告)日：2024-05-10
申请号：CN202110545459.X
申请日：2021-05-19
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
Abstract: 本发明提供了一种评估免疫力水平的方法、装置、设备及存储介质。所述方法包括如下步骤：(1)收集淋巴细胞样本的B细胞抗原受体可变区和/或T细胞抗原受体可变区的测序数据，并与公共数据库中的数据进行比对，计算D值；(2)根据所述D值的分布图区分健康样本和亚健康样本，并采用多重高斯分布拟合健康样本的D值，确定标准D值；(3)采用高斯分布函数拟合亚健康样本和疾病样本的D值，得到高斯分布函数A和高斯分布函数B；(4)根据标准D值、高斯分布函数A和高斯分布函数B评估未知样本的免疫力水平。本发明的方法对测序结果进行分析和多重高斯分布拟合，实现了准确、全面、高效评估样本免疫力的效果。
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公开(公告)号：CN111563172B
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202010376472.2
申请日：2020-05-07
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: G06F16/36 , G06F16/35 , G06F40/242
Abstract: 本发明公开了一种基于动态知识图谱构建的学术热点趋势预测方法和装置。其中，方法包括：获取与目标词汇对应的论文文本，并根据所述论文文本，确定与所述目标词汇对应的高频词汇词典；根据所述论文文本和所述高频词汇词典，建立与所述目标词汇对应的知识图谱；确定所述知识图谱中各节点的网络指标，并根据所述网络指标得到与所述目标词汇对应的学术热点趋势排名。本发明实施例可以根据与目标词汇对应的论文文本建立知识图谱，可以根据建立的知识图谱中各节点之间的关系，确定各节点的网络指标，并根据各节点的网络指标对与目标词汇对应的学术热点趋势进行预测。
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公开(公告)号：CN113046440B
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN202110384261.8
申请日：2021-04-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6827 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种尤文肉瘤相关融合基因检测探针组合物、试剂盒及其应用，所述探针组合物的靶基因包括NUTM2B全外显子、FUS全外显子、YWHAE全外显子、CIC全外显子、EWSR1全外显子、EWSR17～8号内含子、EWSR1 8～9号内含子及BCOR全外显子。本发明针对尤文肉瘤常见的基因融合突变形式，设计全面覆盖融合基因突变位点的探针组合物，显著提高了不同融合现象的检出率，降低了漏检率。
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公开(公告)号：CN110129431B
公开(公告)日：2022-10-04
申请号：CN201910459231.1
申请日：2019-05-29
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明提供了一种II型糖尿病微生物标志物及其应用，所述微生物标志物包括爱格士氏菌属(Eggerthella)、丹毒丝菌属(Erysipelotrichaceae)、Faecalitalea菌属(Faecalitalea)、毛螺菌菌属(Lachnospiraceae_ge)和Lachnoclostridium菌属(Lachnoclostridium)的组合。本发明的II型糖尿病微生物标志物与II型糖尿病相关度高，可用于协助诊断或预警II型糖尿病患病风险，还有利于个体通过调整饮食或医疗界入改善肠道菌微环境，从而减少个体患II型糖尿病的风险。
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公开(公告)号：CN113943834A
公开(公告)日：2022-01-18
申请号：CN202111287242.X
申请日：2021-11-02
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6844 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019‑nCoV的引物探针组合及其应用，所述恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019‑nCoV的引物探针组合包括特异性扩增并检测2019‑nCoV的ORF1ab基因和核壳蛋白N基因的特异性引物对和探针；所述探针的结构包括从5’端到3’端顺次连接的5’端序列、荧光发生基团、四氢呋喃、间隔序列、荧光淬灭基团、3’端序列和C3阻断基团。本发明还提供了一种恒温扩增快速核酸检测新型冠状病毒2019‑nCoV的试剂盒及其以非疾病诊断和/或治疗为目的的使用方法。所述试剂盒具有极好的灵敏度、特异性和准确性，检测效率高，具有极高的应用价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112322722B
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202011268239.9
申请日：2020-11-13
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了检测16p11.2微缺失的引物探针组合物、试剂盒及其应用，所述引物探针组合物检测染色体16p11.2上32.5～33.8M缺失突变；所述引物探针组合物包括SEQ ID NO:1～3、SEQ ID NO:4～6、SEQ ID NO:7～9、SEQ ID NO:10～12和SEQ ID NO:13～15。本发明针对染色体16p11.2上32.5～33.8M区域内近1.25Mb缺失突变，选择5个特定的缺失位点设计特异性引物和Taqman探针，实现了利用基于Taqman的特异、灵敏的多重qPCR直接检测16p11.2微缺失状态的效果。
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公开(公告)号：CN113257345B
公开(公告)日：2021-10-29
申请号：CN202110639770.0
申请日：2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法，所述方法包括如下步骤：获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据，并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息；以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据，统计切割后所有碱基片段的出现频率，以至少一种碱基片段进行拼接，合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度，获得特征数据集；将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集，采用特征数据集训练机器学习模型，并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高，可以缩短最小抑菌浓度的检测时间，对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号：CN113257345A
公开(公告)日：2021-08-13
申请号：CN202110639770.0
申请日：2021-06-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明提供了一种利用基因序列信息预测药物最小抑菌浓度的方法，所述方法包括如下步骤：获取耐药菌的多个样本的基因组测序数据，并根据所述基因组测序数据生成耐药菌的SNP信息和/或核苷酸k‑mers计数信息；以至少一种碱基长度的平滑滑动窗口切割所述基因组测序数据，统计切割后所有碱基片段的出现频率，以至少一种碱基片段进行拼接，合并所得拼接结果与所对应的耐药菌的最小抑菌浓度，获得特征数据集；将所述耐药菌的样本随机分为训练集和测试集，采用特征数据集训练机器学习模型，并计算所述机器学习模型的预测精度。该方法预测准确度较高，可以缩短最小抑菌浓度的检测时间，对临床用药具有重要的指导意义。
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公开(公告)号：CN112305045A
公开(公告)日：2021-02-02
申请号：CN202011118217.4
申请日：2020-10-19
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: G01N27/447 , G01N33/487
Abstract: 本发明涉及一种高密度脂蛋白亚分型检测试剂盒及其制备方法和应用，所述高密度脂蛋白亚分型检测试剂盒包括凝胶电泳分离柱、保护液、高密度脂蛋白电泳染色液和电泳缓冲粉剂；所述凝胶电泳分离柱浸没在所述保护液中。本发明所涉及的高密度脂蛋亚分型检测试剂盒具有能够分离和检测血浆脂蛋白HDL的各个亚分型的能力，仅需2层凝胶即可实现电泳分离和检测，而现有试剂盒产品需要至少3层凝胶；分离效果和分辨率远优于现有产品，电泳操作工序和分离时间也进一步缩短；成本低廉，适合大规模生产。
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公开(公告)号：CN112029862A
公开(公告)日：2020-12-04
申请号：CN202010943145.0
申请日：2020-09-09
Applicant: 上海宝藤生物医药科技股份有限公司 , 上海宝藤医学检验所有限公司 , 上海张江医学创新研究院
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种基于无核酸提取的文库构建检测结直肠癌标志物的试剂盒、方法及其应用，所述试剂盒包括结直肠癌分子标志物的引物组合物，所述引物组合物包括AKT1基因的引物对、BRAF基因的引物对、KRAS基因的引物对、NRAS基因的引物对、PIK3CA基因的引物对、PTEN基因的引物对和SMAD4基因的引物对，文库构建方法基于多重PCR，针对结直肠癌患者进行特定肿瘤细胞定位后，实现了无需核酸抽提而直接进行扩增的技术效果。
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