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公开(公告)号:CN118588320A
公开(公告)日:2024-09-03
申请号:CN202410169156.6
申请日:2024-02-06
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所 , 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开了基于肠道微生物特征的鱼油降脂疗效预测模型及其构建方法,包括:获取T2D合并HTG患者的鱼油干预治疗病历数据,采集粪便样本和外周血样本;提取粪便样本中肠道微生物DNA,采用鸟枪法宏基因组测序获得肠道微生物基因组数据,经统计分析获取与患者鱼油干预治疗相关的微生物特征参数;检测患者干预前后TG数据估算TG响应组和无响应组之间的肠道微生物变量差异;构建肠道微生物基线变量的预测模型,采用重复迭代特征法获取最佳AUC值,提取对TG响应分组贡献最大的肠道微生物特征和最佳的随机森林模型TG响应概率阈值。本发明基于肠道微生物特征构建的预测模型可有效判别鱼油对T2D合并HTG患者降脂疗效高低。
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公开(公告)号:CN117110468A
公开(公告)日:2023-11-24
申请号:CN202311041761.7
申请日:2023-08-18
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开了极长链脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用,极长链脂肪酸联合标志物选自FA20:0、FA20:4、FA21:0、FA22:0、FA22:3、FA22:4、FA23:0、FA24:0、FA24:2、FA24:4、FA24:5、FA25:0、FA25:2、FA25:3、FA26:0、FA26:1、FA26:2、FA26:3,检测受试者血清中极长链脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计,通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值,用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好,与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号:CN117030893A
公开(公告)日:2023-11-10
申请号:CN202311041764.0
申请日:2023-08-18
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开了长链脂肪酸分类标志物组合在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用,其中长链脂肪酸分类标志物组合由oSFA、eSFA、oMUFA、eMUFA、oPUFA和ePUFA中至少两种以上组成,先检测受试者血清中长链脂肪酸分类标志物组合的浓度水平,然后进行ROC曲线统计,通过ROC曲线下面积判断分类标志物组合对2型糖尿病风险的预测价值;当ROC曲线下面积>0.7时,提示分类标志物组合对2型糖尿病风险具有良好的预测效果,用于辅助糖尿病的早期临床诊断检测灵敏度高、成本低且重复性好,与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号:CN118150750A
公开(公告)日:2024-06-07
申请号:CN202410169112.3
申请日:2024-02-06
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所
Abstract: 本发明公开了一种基于脂质组学评价鱼油降脂疗效的方法,包括采集受试者血清样本;采用甲醇/甲基叔丁基醚/水体系提取样本中的脂质组;采用超高效液相色谱串联高分辨质谱仪器采集脂质组学质谱数据;用WGCNA将数据分成共丰度簇,选择13作为软阈值幂β拟合网络的无标度拓扑结构;采用混合动态树切割法产生若干脂质模块;当以甘油脂类为主成分的脂质模块明显减少时,表示鱼油降脂疗效良好。本发明通过血清样本中脂质组学检测即可判断鱼油对2型糖尿病合并高甘油三酯患者的降脂疗效,具有重要医用价值。
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公开(公告)号:CN118039186A
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN202410169110.4
申请日:2024-02-06
Applicant: 上海交通大学医学院附属瑞金医院 , 上海市内分泌代谢病研究所 , 深圳华大生命科学研究院
Abstract: 本发明公开了基于肠道菌群甘油三酯指数的鱼油降脂疗效预测模型及其构建方法,包括筛选外部队列,收集表型数据;获取OCEAN队列的鱼油干预治疗病历数据,采集基线和若干随访点的外周血和粪便样本;提取粪便样本中肠道微生物DNA,宏基因组测序获得人体肠道微生物基因组;测试OCEAN队列基线和若干随访点的TG数据,以表型数据作为数据集,矫正年龄、性别和BMI并鉴定与TG显著相关的肠道微生物,构建GMTGI,以OCEAN队列评估GMTGI与鱼油降TG疗效的关系,基于ROC曲线确定患者基线GMTGI高于0.712,提示鱼油对患者降脂疗效好。本发明通过GMTGI值直接预测鱼油降脂疗效,为临床提供重要的参考价值。
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公开(公告)号:CN117191975A
公开(公告)日:2023-12-08
申请号:CN202311041767.4
申请日:2023-08-18
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开了单不饱和脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用,单不饱和脂肪酸联合标志物由FA14:1、FA15:1、FA16:1、FA17:1、FA18:1、FA19:1、FA20:1、FA21:1、FA22:1、FA24:1、FA25:1和FA26:1组成,检测受试者血清中单不饱和脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计,通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值;当ROC曲线下面积>0.7时,提示该联合标志物对2型糖尿病风险具有良好的预测效果,用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好,与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号:CN117030894A
公开(公告)日:2023-11-10
申请号:CN202311041768.9
申请日:2023-08-18
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开了奇数链脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用,奇数链脂肪酸联合标志物由FA13:0、FA15:0、FA15:1、FA17:0、FA19:0、FA19:1、FA19:2、FA21:0、FA23:0、FA25:0、FA25:2和FA25:3组成,检测血清中奇数链脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计,通过ROC曲线下面积判断该联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值;当ROC曲线下面积>0.7时,提示该联合标志物对2型糖尿病风险具有良好的预测效果,用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好,与传统临床诊断标志物空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号:CN117169365A
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202311041758.5
申请日:2023-08-18
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 上海交通大学医学院附属瑞金医院
Abstract: 本发明公开了多不饱和脂肪酸联合标志物在制备诊断糖尿病的检测产品中的应用,多不饱和脂肪酸联合标志物选自FA19:2、FA20:4、FA22:3、FA22:4、FA24:2、FA24:4、FA24:5、FA25:2、FA25:3、FA26:2、FA26:3,检测受试者血清中多不饱和脂肪酸联合标志物的浓度水平后进行ROC曲线统计,通过ROC曲线下面积判断联合标志物对2型糖尿病风险的预测价值,用于辅助糖尿病的早期临床诊断灵敏度高、成本低且重复性好,与空腹血糖和餐后血糖具有协同作用。
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公开(公告)号:CN112326948B
公开(公告)日:2023-08-11
申请号:CN202011238177.7
申请日:2020-11-09
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所
IPC: G01N33/50
Abstract: 本发明公开了用于预测糖尿病的生物标记物、试剂盒及其使用方法,生物标记物包括以下胆汁酸分类指标组成的组:初级游离胆汁酸CA、CDCA,初级结合胆汁酸GCA、GCDCA、TCA、TCDCA、GCDCS、TCDCS、GCDCA_glucuronide,牛磺酸结合胆汁酸TCA、TCDCA、TCDCS、TDCS、TDCA、TLCA、TLCAS、TUDCA以及甘氨酸结合胆汁酸GCA、GCDCA、GCDCS、GCDCA_glucuronide、GDCS、GDCA、GDCA_glucuronide、GLCA、GLCAS、GUDCA,上述胆汁酸分类指标用于预测糖尿病灵敏度高、成本低且重复性好。
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公开(公告)号:CN110220987B
公开(公告)日:2021-09-28
申请号:CN201910501562.7
申请日:2019-06-11
Applicant: 上海市内分泌代谢病研究所 , 中国科学院大连化学物理研究所
IPC: G01N30/02
Abstract: 本发明公开了胆汁酸联合标志物在制备用于预测或诊断糖尿病的检测试剂或检测物的用途,胆汁酸联合标志物由甘氨胆酸、甘氨鹅脱氧胆酸钠、牛磺胆酸、牛磺鹅去氧胆酸钠和牛磺熊去氧胆酸钠组成,通过检测上述胆汁酸联合标志物的浓度水平,基于上述ROC曲线计算所得数据用于预测糖尿病发生风险,检测灵敏度高、检测成本低、重复性好。
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