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公开(公告)号:CN118703640A
公开(公告)日:2024-09-27
申请号:CN202410950999.X
申请日:2024-07-16
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6844 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明属于食品安全检测技术领域,涉及一种基于RPA‑CRISPR/Cas12a检测水牛奶中掺假牛奶的引物探针组合物及其应用和检测方法。基于RPA‑CRISPR/Cas12a检测水牛奶和牛奶等温扩增引物为同一组RPA扩增引物为SEQ ID NO.1‑2所示碱基序列;用于CRISPR反应体系中鉴别水牛奶的特异性crRNA为SEQ ID NO.3所示碱基序列;用于CRISPR反应体系中鉴别牛奶的特异性crRNA为SEQ ID NO.4所示碱基序列。本发明检测方法可以将目标DNA含量转化为超灵敏、抗干扰的荧光信号,该荧光信号可利用仪器检测或紫外灯下目测。该检测方法可检测水牛奶中低至1%(v/v)的牛奶掺假,具有快速、灵敏、准确等优点,为水牛奶中掺假牛奶提供了一种简便快速、灵敏度高、特异性强的检测方法。
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公开(公告)号:CN115873929A
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202211225437.6
申请日:2022-10-09
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/70 , C12R1/93
Abstract: 本发明涉及生化分析和分子诊断领域,具体为一种基于动态限域空间的一管式分子诊断方法及其应用。利用蔗糖、甘油等溶液将两种互不兼容的等温扩增反应体系置于一个反应器中,实现一管式分子诊断。本发明检测方法应用于核酸、蛋白等靶标的快速、多重、可视化高灵敏检测。以病原体诺如病毒为例,可在1小时内实现单拷贝检测。本发明的优点:操作简单方便、快速肉眼可视、费用低、多重、高灵敏、适用现场即时检测等。
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公开(公告)号:CN117230217A
公开(公告)日:2023-12-15
申请号:CN202311163980.2
申请日:2023-09-11
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12R1/36
Abstract: 本发明属于分子生物学检测技术领域,涉及一种基于RPA‑CRISPR/Cas12a检测病原微生物(淋病奈瑟菌及FC428头孢曲松耐药克隆)的引物及其应用和检测方法。病原微生物为淋病奈瑟菌或淋病奈瑟菌FC428头孢曲松;其中,检测淋病奈瑟菌专用等温扩增引物为一组RPA扩增引物,碱基序列依次为SEQ ID NO.1‑2所示;检测淋病奈瑟菌FC428头孢曲松耐药克隆专用等温扩增引物为一组RPA扩增引物,碱基序列依次为SEQ ID NO.3‑4所示。同时设计了包含两个零件的微流控芯片平台,实现片上分步法检测。通过判读各腔室的荧光信号有无即可判断样本鉴别结果,实现现场快速即时检测,提高检测效率。
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公开(公告)号:CN120060450A
公开(公告)日:2025-05-30
申请号:CN202510162286.1
申请日:2025-02-14
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6848 , C12Q1/70 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明属于分子生物学和生物医学工程领域,具体的说是一种防污染LAMP比色检测体系及其应用和检测方法。防污染LAMP比色检测体系,包括如下a1)‑a5);a1)含dATP、dGTP、dCTP和不同浓度比例dTTP与dUTP的五种脱氧核苷酸混合液;a2)Zst酶、热敏UDG酶和缓冲液;a3)镁离子指示剂;a4)20×EvaGreen、MgSO4、无核酶水;a5)待检测样品LAMP混合引物。本发明起到防止LAMP产物气溶胶污染的作用,提高了核酸靶标的快速、现场检测能力。
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公开(公告)号:CN118685242A
公开(公告)日:2024-09-24
申请号:CN202410898366.9
申请日:2024-07-05
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明涉及生化分析和分子诊断领域,具体的说是一种富集增敏RPA‑CRISPR一管式检测样品前处理装置以及应用和RPA‑CRISPR检测方法。富集装置包括注射器、FTA卡及连接座,其中,连接座一端插入注射器,另一端设有毛细管,连接座内设FTA卡。本发明构建带有FTA卡的富集增敏装置对病原体基因组进行快速采集、提取,并使得采集的样本能够在室温下长期储存和运输,简化了样品前处理的繁琐步骤,节省了操作时间。
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公开(公告)号:CN118652995A
公开(公告)日:2024-09-17
申请号:CN202410950993.2
申请日:2024-07-16
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/689 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , C12N15/11 , C12M1/34 , C12M1/00 , C12R1/36 , C12R1/01
Abstract: 本发明属于分子生物学检测技术领域,涉及一种鉴定病原体(淋病奈瑟菌和沙眼衣原体)的引物及其应用和检测方法。病原体为淋病奈瑟菌及沙眼衣原体;其中,检测淋病奈瑟菌引物为SEQ ID NO.1‑2所示碱基序列;检测沙眼衣原体引物为SEQ ID NO.3‑4所示碱基序列。同时搭建所述微流控检测平台,其通过3D打印机设置打印获得,平台设有RPA反应器单元(101)和CRISPR反应室,RPA反应器单元与CRISPR反应室通过微通道相连。通过观察不同腔室的荧光信号,可以判定样本的鉴别结果,从而实现在现场快速进行即时检测,提高检测效率。
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公开(公告)号:CN117210541A
公开(公告)日:2023-12-12
申请号:CN202310884096.1
申请日:2023-07-19
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6848 , C12Q1/70 , C12Q1/689 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明涉及生化分析和分子诊断领域。本发明为一种基于环介导等温扩增的防污染分子诊断方法及其应用,包括多重病原微生物核酸检测。本发明描述了ZO5DNA聚合酶突变体、热敏UDG酶、自制缓冲液、dUTP等组分可以加入LAMP反应体系中,起到防止LAMP产物气溶胶污染的作用,应用于核酸、蛋白等靶标的快速、高灵敏检测。以病原体人乳头瘤病毒16亚型和18亚型为例,检测灵敏度达到单拷贝。本发明的优点:高效防气溶胶污染、操作简单方便、费用低、多重、高灵敏等。
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公开(公告)号:CN116790363A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310722555.6
申请日:2023-06-16
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明涉及生化分析和分子诊断领域,具体的说是一种适用于RPA‑CRISPR反应的时空双维度分隔检测装置及其应用。装置包括外管和设置在其内的内管,内管带有上下底面,其下底面设有至少一个供RPA扩增产物扩散的毛细通道;所述内管的外壁与外管内壁贴合。本发明将RPA置于外管,CRISPR/Cas12a置于内管;反应初始,两体系被物理屏障隔绝。随着RPA反应进行,扩增产物积累,逐步通过毛细通道向上扩散至内管,从而激活内管中CRISPR/Cas12a检测体系。在内管中,Cas12a效应蛋白与RPA扩增产物特异性结合,发挥反式切割活性,非特异性切割单链DNA报告探针,产生荧光信号,实现一管式高灵敏检测。应用该方法可检测低至100CFU/mL肠炎沙门氏菌。操作简单方便、特异性强、灵敏、无污染。
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公开(公告)号:CN116694798A
公开(公告)日:2023-09-05
申请号:CN202310810838.6
申请日:2023-07-04
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6893 , C12Q1/6844 , C12N15/113 , B01L3/00 , C12N15/11 , C12R1/90
Abstract: 本发明属于分子生物学检测技术领域,涉及一种病原体的检测方法,特别涉及一种疟原虫种属鉴定和分型的引物和检测方法。检测疟原虫专用等温扩增引物为一组RPA扩增引物,碱基序列依次为SEQ ID NO.1‑2所示。本发明设计了包含多个反应腔室和一个中心进样口的微流控芯片,将CRISPR/Cas12a反应体系分别预置于反应腔室中,自中心进样口加入的RPA试剂均匀流向四周,进行一步法RPA‑CRISPR反应。通过判读各腔室的荧光信号有无即可判断样本种属鉴别结果,实现现场快速即时检测,提高检测效率。
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