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公开(公告)号：CN112280828A
公开(公告)日：2021-01-29
申请号：CN202011137169.3
申请日：2020-10-22
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种降低扩增偏倚性的单细胞测序的细胞核分离方法及其应用，该方法包括：将待提取样品在在二号缓冲液中进行裂解处理；将裂解产物进行第一次离心处理，获得细胞核沉淀；将所述细胞核沉淀进行冲洗并在一号缓冲液中重悬，并进行第二次离心处理，最终在三号缓冲液中重悬混匀，以获得最终所需的细胞核。该方法只需常规、简单的试剂耗材，不需要昂贵的分离设备及长时间的梯度离心等操作，便可从较少的组织样本或者细胞中获得足量、完整的单个细胞核用于单细胞全基因实验研究，该方法相较于市售试剂盒处理过的细胞核，用于后续的全基因组扩增产物具更好的扩增均一性，与完整的单个细胞具备相近的扩增效果，同时省时且节约成本。
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公开(公告)号：CN110548029A
公开(公告)日：2019-12-10
申请号：CN201910952444.8
申请日：2019-10-09
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/506 , A61K31/4196 , A61P31/10
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及甲磺酸奥希替尼在制备治疗真菌感染药物中的应用。甲磺酸奥希替尼对于真菌感染有治疗效果，尤其是与氟康唑联合使用时，对抗真菌感染不仅仅抑菌效果良好而且达到了杀菌的效果，此外还具有广谱的抗菌效果，对于临床上氟康唑的白色念珠菌耐药株、新型隐球菌和酿酒酵母具有良好的杀灭效果。本发明通过实验验证了甲磺酸奥希替尼的杀菌机制与破坏细胞囊泡内pH稳态相关。因此本发明从大规模筛选到机制验证的角度为开发pH稳态作为抗真菌感染药物提供了新的证据和思路。本发明发现了基因PDR5和VMA1是甲磺酸奥希替尼抗真菌感染作用的药物靶点，为真菌感染的治疗及治疗药物的研究开发提供了新的发展方向和作用机理。
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公开(公告)号：CN110548029B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN201910952444.8
申请日：2019-10-09
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/506 , A61K31/4196 , A61P31/10
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及甲磺酸奥希替尼在制备治疗真菌感染药物中的应用。甲磺酸奥希替尼对于真菌感染有治疗效果，尤其是与氟康唑联合使用时，对抗真菌感染不仅仅抑菌效果良好而且达到了杀菌的效果，此外还具有广谱的抗菌效果，对于临床上氟康唑的白色念珠菌耐药株、新型隐球菌和酿酒酵母具有良好的杀灭效果。本发明通过实验验证了甲磺酸奥希替尼的杀菌机制与破坏细胞囊泡内pH稳态相关。因此本发明从大规模筛选到机制验证的角度为开发pH稳态作为抗真菌感染药物提供了新的证据和思路。本发明发现了基因PDR5和VMA1是甲磺酸奥希替尼抗真菌感染作用的药物靶点，为真菌感染的治疗及治疗药物的研究开发提供了新的发展方向和作用机理。
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公开(公告)号：CN110623957A
公开(公告)日：2019-12-31
申请号：CN201910952446.7
申请日：2019-10-09
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/5025 , A61P31/10 , A61K31/4196 , A61K31/506
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及普纳替尼在制备治疗真菌感染药物中的应用。普纳替尼对于真菌感染有治疗效果，尤其是与氟康唑联合使用时，对抗真菌感染不仅仅抑菌效果良好而且达到了杀菌的效果，此外还具有广谱的抗菌效果，对于临床上氟康唑的白色念珠菌耐药株、新型隐球菌和酿酒酵母等都具有良好的杀灭效果。本发明发现了基因PDR5和PMA1是普钠替尼抗真菌感染作用的药物靶点，为真菌感染的治疗及治疗药物的研究开发提供了新的发展方向和作用机理。
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公开(公告)号：CN110251497A
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201910671110.3
申请日：2019-07-24
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/155 , A61P31/10 , A61P17/00
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及盐酸氯苯胍在制备治疗真菌感染药物中的应用。本发明通过实验，证明了盐酸氯苯胍最小抑菌浓度为4μM，低于常用抗真菌药物氟康唑，在相同浓度剂量下，盐酸氯苯胍的抑菌效果更加显著，而且对于产生耐药性的真菌菌株及超级真菌仍有良好的杀灭效果，毒性低，安全可靠。本发明还发现了细胞壁和转录因子RLM1是盐酸氯苯胍治疗真菌感染的药物靶点，为真菌感染的药物治疗提供了广阔的前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN112538545A
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN202011470173.1
申请日：2020-12-15
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明提供了一种真菌微生物组作为标志物在制备治疗筛查和肺癌诊断中的应用，通过构建真菌微生物组DNA富集提取方法，从组织、粪便和肺泡灌洗液中提取真菌微生物组DNA，同时运用ITS测序和宏基因组测序进行真菌微生物组和基因功能分析，聚多曲霉富集在肿瘤组织，白色念珠菌富集在肿瘤组织和癌旁组织，马拉色菌富集在肺泡灌洗液；通过对这些靶标菌种或分子标志物的检测实现肺癌的尽早发现和干预，有望作为肺癌筛查的重要指标；另外，本发明通过肺腺癌患者的不同部位的粪便、组织和肺泡灌洗液样本中真菌菌群的DNA测序结果获得真菌种类和数量的特征，并以肺癌特异性富集的真菌的数量和比值特征为基础，从而更准确地筛查和辅助诊断肺癌。
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公开(公告)号：CN116026937A
公开(公告)日：2023-04-28
申请号：CN202111247321.8
申请日：2021-10-26
Applicant: 上海交通大学医学院
Abstract: 本发明公开了一种超敏且易用的多重单细胞蛋白质组学分析方法和应用，包括制备单细胞悬液，通过温和、高精度的全自动单细胞分离系统分选单细胞至微孔板，用裂解液和冻融裂解单细胞，对释放的蛋白质进行酶解、稳定同位素亲和标记、合并、脱盐，得到的肽段进行色谱分离和质谱检测，并进行包括数据库检索、数据质控和数据整合分析的数据处理。本发明对单个人源常规细胞的单细胞蛋白质组鉴定及定量深度可达到2000种以上，同时无需昂贵的超声设备、特殊定制的微流控芯片、复杂的液相系统改造等，并兼容多种市售主流液质联用质谱仪，用于单细胞或少量细胞的代谢组、蛋白质组或磷酸化等修饰蛋白质组的多组学分析和鉴定，极具推广应用前景。
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公开(公告)号：CN110623957B
公开(公告)日：2022-08-16
申请号：CN201910952446.7
申请日：2019-10-09
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/5025 , A61P31/10 , A61K31/4196 , A61K31/506
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及普纳替尼在制备治疗真菌感染药物中的应用。普纳替尼对于真菌感染有治疗效果，尤其是与氟康唑联合使用时，对抗真菌感染不仅仅抑菌效果良好而且达到了杀菌的效果，此外还具有广谱的抗菌效果，对于临床上氟康唑的白色念珠菌耐药株、新型隐球菌和酿酒酵母等都具有良好的杀灭效果。本发明发现了基因PDR5和PMA1是普钠替尼抗真菌感染作用的药物靶点，为真菌感染的治疗及治疗药物的研究开发提供了新的发展方向和作用机理。
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公开(公告)号：CN114032278A
公开(公告)日：2022-02-11
申请号：CN202110326152.0
申请日：2021-03-26
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: C12Q1/04 , C12Q1/06 , C12Q1/14 , C12Q1/70 , A61K35/74 , A61K36/06 , A61K35/76 , A61P35/00 , G16H50/20 , G16B20/30
Abstract: 本发明提供了一种结直肠癌的微生物标志物，其选自细菌、真菌、古菌和病毒中的一种及以上，优选为细菌和真菌的组合；本发明通过对结直肠癌个体和健康个体的粪便样本中微生物的丰度、组成及微生物间相互作用进行差异分析和比较，标志物在结直肠癌患者的粪便样本中的含量显著高于在健康个体的粪便样本中的含量，并且标志物之间的相互作用在结直肠癌患者的粪便样本中变化显著，且具有统计学意义，能够较为准确地确定个体是否患有结直肠癌，具有非侵入性辅助诊断结直肠癌的作用，患者耐受性强；本发明通过微生物组成分析获得结直肠癌患者肠道微生物组中特异性富集的物种种类、数量、比值和相互作用特征，最终以此为基础进行结直肠癌的诊断。
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公开(公告)号：CN110251497B
公开(公告)日：2021-08-03
申请号：CN201910671110.3
申请日：2019-07-24
Applicant: 上海交通大学医学院
IPC: A61K31/155 , A61P31/10 , A61P17/00
Abstract: 本发明属于医药制备领域，特别涉及盐酸氯苯胍在制备治疗真菌感染药物中的应用。本发明通过实验，证明了盐酸氯苯胍最小抑菌浓度为4μM，低于常用抗真菌药物氟康唑，在相同浓度剂量下，盐酸氯苯胍的抑菌效果更加显著，而且对于产生耐药性的真菌菌株及超级真菌仍有良好的杀灭效果，毒性低，安全可靠。本发明还发现了细胞壁和转录因子RLM1是盐酸氯苯胍治疗真菌感染的药物靶点，为真菌感染的药物治疗提供了广阔的前景。
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