公开(公告)号：CN116026937A

公开(公告)日：2023-04-28

申请号：CN202111247321.8

申请日：2021-10-26

Applicant: 上海交通大学医学院

Inventor： 王慧 ,  李辰 ,  顾蕾 ,  王芹芹 ,  刘宁宁 ,  赵犇鹏

IPC: G01N30/02 ,  G01N27/62

Abstract: 本发明公开了一种超敏且易用的多重单细胞蛋白质组学分析方法和应用，包括制备单细胞悬液，通过温和、高精度的全自动单细胞分离系统分选单细胞至微孔板，用裂解液和冻融裂解单细胞，对释放的蛋白质进行酶解、稳定同位素亲和标记、合并、脱盐，得到的肽段进行色谱分离和质谱检测，并进行包括数据库检索、数据质控和数据整合分析的数据处理。本发明对单个人源常规细胞的单细胞蛋白质组鉴定及定量深度可达到2000种以上，同时无需昂贵的超声设备、特殊定制的微流控芯片、复杂的液相系统改造等，并兼容多种市售主流液质联用质谱仪，用于单细胞或少量细胞的代谢组、蛋白质组或磷酸化等修饰蛋白质组的多组学分析和鉴定，极具推广应用前景。

公开(公告)号：CN115170884A

公开(公告)日：2022-10-11

申请号：CN202210861047.1

申请日：2022-07-22

Applicant: 西安交通大学 ,  上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心

Inventor： 李辰 ,  周敏 ,  赵列宾 ,  龚铁梁 ,  毛安钰 ,  高泽宇 ,  吴佳伦 ,  贾昶 ,  吴可菲 ,  于莉莎 ,  盖彤

IPC: G06V10/764 ,  G06V10/77 ,  G06T7/11 ,  G06T7/00 ,  G06N3/04 ,  G06V10/82

Abstract: 一种基于分层注意力机制的儿童白血病多实例分类方法，首先，进行细胞分割任务：将儿童白血病病人的多张骨髓细胞图像中的有核细胞通过细胞分割模块提取出来，N个细胞为一份的随机采样，形成一个多实例包，作为样本输入学习；其次，进行儿童白血病分类任务：将上述输入学习后的样本作为儿童白血病分类模块，区分每个样本属于急性髓系白血病，或急性淋巴系白血病，并进一步进行多个层级的分型；本发明使用多示例学习的方法，将细胞编码成特征，并通过注意力模块计算不同细胞对各个类别的贡献度，分型形成层级特征，从细分型的注意力矩阵聚合至粗分型，针对癌细胞比例的损失函数，通过对比例的限制，半监督地分类了各个细胞是否属于癌细胞，使得注意力机制可以更好地计算细胞对各个类别的贡献度，使得分类更为精准。