基于深度学习的荧光显微图像超分辨重建方法

    公开(公告)号:CN111524064A

    公开(公告)日:2020-08-11

    申请号:CN202010166665.5

    申请日:2020-03-11

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的荧光显微图像超分辨重建方法,包括:采集普通荧光显微图像和弱荧光显微图像;利用SRRF算法和普通荧光图像获得超分辨图;以普通荧光显微图像、弱荧光显微图像以及超分辨图像组成数据集;利用训练集训练U‑Net网络,获得良好照明条件及弱照明条件的快速SRRF超分辨重建模型和图像增强模型,应用时,采集普通荧光和弱荧光显微序列图像,利用对应的SRRF超分辨重建模型获得超分辨图像,利用图像增强模型增强弱荧光显微图像的质量。该技术方法在不牺牲分辨率的前提下提升成像速度,减少荧光样品的漂白和光毒性,将超分辨成像技术的优势应用到活细胞内亚细胞结构的动态观察中,极具应用前景和商用价值。

    用于光遗传学细胞高通量研究的无线程控光照系统及应用

    公开(公告)号:CN106754357A

    公开(公告)日:2017-05-31

    申请号:CN201611095124.8

    申请日:2016-12-01

    Applicant: 浙江大学

    CPC classification number: C12M35/02 C12M41/06

    Abstract: 本发明公开了一种用于光遗传学细胞高通量研究的无线程控光照系统,该系统包括上位机与控制软件、无线通讯模块、下位机中央处理器、下位机寄存器芯片组、下位机发光二极管组以及稳压直流电源。本发明的装置用于体外规模培养细胞的光遗传学信号通路研究尤其是与信号通路相关的药物分子筛选的研究,解决了目前相关研究中缺少高通量、多强度、长时间、多因素光照的体外刺激的设备问题,有效提高了光遗传学研究中光刺激系统的精确度和实验效率。另外,基于本系统所获得的培养细胞光激活的条件,如光照强度、光激活时间等对于将来细胞的光遗传学研究也有广泛的应用前景。

    基于视觉大模型的智能显微镜系统及辅助病理分析方法

    公开(公告)号:CN118799864A

    公开(公告)日:2024-10-18

    申请号:CN202411287636.9

    申请日:2024-09-14

    Abstract: 本发明公开了一种基于视觉大模型的智能显微镜系统,包括显微镜以及与显微镜通信连接的处理器;所述的处理器中包括智能分析单元;智能分析单元包含基于视觉大模型构建的多任务特征学习器;根据任务提示的图像对,智能分析单元控制显微镜收集目标位置的显微图像,将用于任务提示的图像对和目标位置的显微图像输入至多任务特征学习器内,输出目标位置对应任务的显微图像的分析结果。本发明还公开了基于所述的智能显微镜系统的辅助病理分析方法。本发明的智能显微镜系统提高了医学图像分析的效率和准确性。

    基于荧光分子衰减速率差异建立的多结构同步成像方法

    公开(公告)号:CN118425114A

    公开(公告)日:2024-08-02

    申请号:CN202410513942.3

    申请日:2024-04-26

    Applicant: 浙江大学

    Inventor: 许迎科 金璐红

    Abstract: 本发明涉及基于荧光分子衰减速率差异建立的多结构同步成像方法。本发明通过模拟存在不同荧光漂白速率的显微图像数据,制备模拟数据集。利用所构建的模拟数据集训练基于UNet网络的全监督深度学习模型和自监督深度学习模型。通过全监督模型或自监督模型对同一个样品中的多种目标用存在不同漂白速率的荧光分子进行标记并同时成像获取显微图像数据,得到不同目标的分类结果。本发明通过可在仅需少量真实生物数据的前提下就可获得高质量的目标分类模型,为绘制细胞器互作网络提供了更高效的技术手段。

    肾细胞癌类型的计算机辅助诊断系统及设备

    公开(公告)号:CN116228759B

    公开(公告)日:2023-08-01

    申请号:CN202310504664.0

    申请日:2023-05-08

    Abstract: 本发明公开了一种肾细胞癌类型的计算机辅助诊断系统及设备,系统包括:数据采集模块,收集肾脏组织全切片图像,构建训练集;数据处理模块,对肾脏组织全切片图像进行预处理;特征学习模块,包括特征学习器并采用训练集进行训练;图像特征库,采用特征学习器提取训练样本的特征向量,构建图像特征库;分类模块,将待分类肾脏组织全切片图像通过数据处理模块进行预处理,预处理后通过特征学习器中提取特征向量,根据待分类肾脏组织全切片图像的特征向量与图像特征库中所有特征向量判断待分类肾脏组织全切片图像的类型。本发明解决了由于罕见类数据不足和特征差异大而无法训练出准确性高的分类模型的问题。

    一种微液滴数字PCR液滴检测方法及系统

    公开(公告)号:CN114549528A

    公开(公告)日:2022-05-27

    申请号:CN202210442041.0

    申请日:2022-04-26

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种微液滴数字PCR液滴检测方法及系统,包括:获取微液滴数字PCR图像并进行预处理,在预处理后的图像上依次使用Canny边缘检测和Hough圆检测获取独立液滴的定位信息,按定位信息对液滴进行截取并进行人工标注,以构建训练数据集;基于卷积神经网络构建液滴识别模型,使用训练数据集进行训练;将待测微液滴数字PCR图像进行预处理,使用Canny边缘检测和Hough圆检测获取独立液滴的定位信息,获得每个液滴的图像并按批次输入训练好的液滴识别模型,对液滴进行有效或无效分类识别;最后根据有效液滴的中心灰度进行阴性阳性判断。本发明的方法及系统可对样本中的阳性微液滴进行高精准度、高通量地识别。

    基于YOLOX模型的中成药药材成分的检测方法及装置

    公开(公告)号:CN114299492A

    公开(公告)日:2022-04-08

    申请号:CN202111631888.5

    申请日:2021-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种基于YOLOX模型的中成药药材成分的检测方法及装置,包括以下步骤:(1)采集中成药粉末的显微图像进行标注、预处理,构建成训练集;(2)以YOLOX‑S网络模型为基础构建目标检测模型;所述的目标检测模型包括输入层、特征提取网络、多尺度特征融合网络、解耦输出网络、输出层;(3)采用所述的训练集对目标检测模型进行训练;(4)采集待测中成药粉末的显微图像并输入至训练好的目标检测模型中,即可获得显微图像中存在的药材成分的类别信息及各药材成分在显微图像中对应的位置信息。本发明的检测方法极大的降低复方中成药的检测难度、保证检测精度、提高检测速率度和降低误检率。

    用于光遗传学细胞高通量研究的无线程控光照系统及应用

    公开(公告)号:CN106754357B

    公开(公告)日:2019-06-11

    申请号:CN201611095124.8

    申请日:2016-12-01

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本发明公开了一种用于光遗传学细胞高通量研究的无线程控光照系统,该系统包括上位机与控制软件、无线通讯模块、下位机中央处理器、下位机寄存器芯片组、下位机发光二极管组以及稳压直流电源。本发明的装置用于体外规模培养细胞的光遗传学信号通路研究尤其是与信号通路相关的药物分子筛选的研究,解决了目前相关研究中缺少高通量、多强度、长时间、多因素光照的体外刺激的设备问题,有效提高了光遗传学研究中光刺激系统的精确度和实验效率。另外,基于本系统所获得的培养细胞光激活的条件,如光照强度、光激活时间等对于将来细胞的光遗传学研究也有广泛的应用前景。

    新型多角度环状光学照明显微成像系统

    公开(公告)号:CN206757171U

    公开(公告)日:2017-12-15

    申请号:CN201720543615.8

    申请日:2017-05-17

    Applicant: 浙江大学

    Abstract: 本实用新型公开了一种新型多角度环状光学照明显微成像系统。本实用新型中单模光纤、准直透镜、四分之一波片、4f二维扫描振镜系统依次位于激光器出射光束的光轴之上,所述扫描振镜系统包含两个一维振镜和两个透镜,两个透镜组成4f系统,两个一维振镜的反射面分为位于4f系统的共轭面上;聚焦镜、二色镜依次位于经4f二维扫描振镜系统射出光束的光轴上;TIRF显微物镜、样品台依次位于二色镜反射光束光轴上,滤波片、第二场镜、探测器依次位于二色镜透射光束光轴上;所述样品台位于TIRF显微物镜的焦平面处,所述探测器的采集孔位于第二场镜的焦平面处。本实用新型实现方便快捷、高分辨率和低噪声的显微实验观察。

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