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公开(公告)号：CN115171779A
公开(公告)日：2022-10-11
申请号：CN202210825707.0
申请日：2022-07-13
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种基于图注意力网络和多组学融合的癌症驱动基因预测装置，实现的预测包括：基于基因相关数据构建的基因关联图谱和根据癌症多组学数据生成的多组学特征矩阵构建多维度基因网络；利用癌症驱动基因预测模型对多维度基因网络进行预测计算，包括：采用图注意力网络对输入的多维度基因网络提取不同维度的基因表征后，对不同维度的基因表征通过多头注意力机制实现跨维度的信息共享，获得同时融合了维度相关的全局信息和跨维度信息的共享基因表征，使用注意力机制计算不同维度基因表征的重要性，并根据重要性将所有维度的共享基因表征自适应融合为融合基因表征，对融合基因表征进行计算以预测癌症驱动基因，提升了预测准确率和可靠性。
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公开(公告)号：CN107385066B
公开(公告)日：2021-03-23
申请号：CN201710704268.7
申请日：2017-08-17
Applicant: 浙江大学
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6851 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种检测EGFR基因突变的引物对、试剂盒、检测方法及应用。所述引物对共有三对，分别用于检测EGFR基因S492R突变、G465E突变和G465R突变。本发明方法采用ARMS PCR原理，Taq DNA聚合酶缺少3’‑5’外切酶活性，PCR引物的3’末端的错配会导致产物的急剧减少，通过设计特异性引物，使其扩增受野生型模板阻滞，从而达到检测突变型的目的。使用本发明引物对通过荧光定量PCR方法来检测EGFR基因耐药性突变，操作简单，可以仅通过液体活检得出准确结果，灵敏度高，可以检测1％含量的突变。
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公开(公告)号：CN109671469B
公开(公告)日：2020-08-18
申请号：CN201811511026.7
申请日：2018-12-11
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种基于循环神经网络预测多肽与HLA I型分子之间结合关系与结合亲和力的方法，包括：构建两个训练集，其中，训练集1包括多个由多肽‑HLA I型序列及其亲和力组成的训练样本；训练集2包括多个由多肽‑HLA I型序列及其结合关系组成的训练样本；以双向GRU或带有注意力机制的双向GRU为基础，再加一个Sigmoid函数作为输出层组成预测网络，利用训练集1和训练集2训练预测网络，获得回归模型和分类模型；将待预测的多肽‑HLA I型序列输入至回归模型和分类模型，经计算获得多肽与HLA I型之间的预测亲和力数值。该方法能够快速较准确地预测多肽与HLA I型分子之间结合亲和力或结合关系。
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公开(公告)号：CN110317275A
公开(公告)日：2019-10-11
申请号：CN201910446589.0
申请日：2019-05-27
Applicant: 浙江大学
Abstract: 本发明公开了一种重组抗体样T细胞抗原受体、T细胞抗原受体偶联药物、双特异性分子及应用。本发明通过设计多种IgG1恒定区与1G4113的融合表达形式，筛选获得了可在哺乳动物细胞中可溶性表达的融合蛋白形式，仅需要一步纯化便能够获得纯度较高的重组抗体样T细胞抗原受体。将重组抗体样T细胞抗原受体与MMAE小分子偶联制成T细胞抗原受体偶联药物可以用于制成抗肿瘤药物。将重组抗体样T细胞抗原受体与荧光染料分子Cy5偶联可以用于药物的体内定位或肿瘤成像。将重组抗体样T细胞抗原受体与抗CD3抗体偶联制成可溶性表达的双特异性分子，可以用于制成抗肿瘤药物。
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