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公开(公告)号:CN111798922B
公开(公告)日:2024-04-02
申请号:CN202010742489.5
申请日:2020-07-29
Applicant: 中国农业大学
IPC: G16B20/20 , G16B20/30 , G16B30/10 , G06F18/214 , G06N7/01
Abstract: 本发明公开了基于重测序数据中多态性位点密度鉴定小麦育种的基因组选择利用区间的方法。该方法包括提取待鉴定作物材料基因组DNA并进行全基因组重测序;质控重测序数据并将其比对到作物参考基因组上得到DNA序列比对文件;分别过滤鉴定待鉴定作物材料得到待鉴定作物材料与作物参考基因组相比的排除CNV变异区间的SNP变异位点;计算所述得到的待鉴定作物材料SNP变异位点之间的差异SNP变异位点的密度分布;根据密度分布拟合得到混合正态分布后根据分布边界确定阈值,得到待鉴定作物材料之间的SNP多态性热点区间和SNP低频变异区间。本发明可用于确定不同品种间的遗传差异,从基因组水平对种质资源的相似性进行评估。
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公开(公告)号:CN117604158A
公开(公告)日:2024-02-27
申请号:CN202410002264.4
申请日:2024-01-02
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及用于小麦株高性状鉴定的分子标记及其应用,本发明公开了一个与小麦株高性状相关的变异位点,并通过该位点开发了KASP标记和专用引物。采用这一KASP标记和专用引物,可以确定待测小麦的基因型,即ERFT基因型(变异位点为T/T)或ERFC基因型(变异位点为C/C)或ERFT/ERFC基因型(变异位点为T/C)。对96份小麦样本的单倍型分析结果表明,根据待测小麦的基因型,可以确定具有ERFC基因型的小麦植株的成熟期株高小于具有ERFT基因型的小麦植株。这一发现有助于筛选出株高矮化,抗倒伏的小麦品种,为培育高产、稳产、矮杆、抗倒伏的小麦品种提供了理论基础,并提供了分子辅助选择的工具。
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公开(公告)号:CN116855625A
公开(公告)日:2023-10-10
申请号:CN202310789539.9
申请日:2023-06-29
Applicant: 中国农业大学
Abstract: 本发明公开了一种小麦骨干亲本染色体中心区祖系单倍群骨架特异性引物对及其开发方法。该特异性引物包括如下至少一对引物对:序列如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的引物对,序列如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的引物对,序列如SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示的引物对,序列如SEQ ID No.7和SEQ ID No.8所示的引物对,序列如SEQ ID No.9和SEQ ID No.10所示的引物对等。采用该特异性引物对对待测小麦的基因组DNA进行扩增,扩增产物与目标长度相同还是不同,能够确定待测小麦的染色体骨架类型。
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公开(公告)号:CN116790659A
公开(公告)日:2023-09-22
申请号:CN202310845951.8
申请日:2023-07-11
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12N15/84 , C07K14/415 , C12N15/29 , C12N15/11 , C12N1/21 , C12Q1/6895 , A01H5/00 , A01H6/46 , C12R1/01
Abstract: 本发明公开了小麦干旱、高温胁迫相关蛋白TaGLYI7及其生物材料和应用。本发明要解决的技术问题是如何调控小麦高温胁迫和/或干旱胁迫抗性。具体公开了序列3或4所述蛋白质、调控所述蛋白质的编码基因表达的物质或调控所述蛋白质的活性或含量的物质在下述任一种的应用:A1)调控植物高温胁迫和/或干旱胁迫抗性中的应用;A2)调控植物高温胁迫和/或干旱胁迫抗性中的应用和/或制备调控植物高温胁迫和/或干旱胁迫抗性产品中的应用。并且公开了在小麦中的相关分子标记,通过此分子标记能够对小麦的高温胁迫和/或干旱胁迫抗性进行鉴定或辅助鉴定。
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公开(公告)号:CN108588272B
公开(公告)日:2020-07-24
申请号:CN201810862840.7
申请日:2018-08-01
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种与小麦株高和穗长性状主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用。本发明提供了检测待测小麦株高或穗长的引物对,为用于扩增靶片段的引物对;所述靶片段为含有由引物1、引物2和引物3扩增得到的片段的片段;所述引物1为序列1所示的单链DNA分子;所述引物2为序列2所示的单链DNA分子;所述引物3为序列3所示的单链DNA分子;本发明的实验证明了,利用引物对STARP‑2001对小麦分离群体进行辅助选择。结果表明,基因型与高秆亲本京411一致的单株显著高于基因型与矮秆亲本一致的单株,这表明引物对STARP‑2001用于小麦矮秆育种的分子标记辅助选择是切实有效的。
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公开(公告)号:CN106317214B
公开(公告)日:2019-09-13
申请号:CN201610804152.6
申请日:2016-09-05
Applicant: 中国农业大学
Abstract: 本发明公开了植物耐热相关蛋白TaXPD及其编码基因与应用。本发明所提供的蛋白质为如下a1)或a2)或a3):a1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;a2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;a3)将a1)或a2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物耐热性相关的蛋白质。实验证明,向拟南芥突变体uvh6‑1中导入所述蛋白质的编码基因,得到存活率增加和/或下胚轴伸长长度增加和/或离子渗漏率降低的转基因植物。因此,本发明提供的蛋白质对培育耐热性增加的植物,具有重要的理论意义和实用价值。
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公开(公告)号:CN106148331B
公开(公告)日:2019-01-08
申请号:CN201510151948.1
申请日:2015-04-01
Applicant: 中国农业大学
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种与小麦株高主效QTL紧密连锁的分子标记及其应用。本发明公开成套DNA分子,由SEQ ID No.1所示的DNA分子和SEQ ID No.2所示的DNA分子组成。本发明在小麦株高性状的分子标记辅助育种中具有重要应用。
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公开(公告)号:CN108690127A
公开(公告)日:2018-10-23
申请号:CN201710228752.7
申请日:2017-04-10
Applicant: 中国农业大学
IPC: C07K14/415 , C12N15/29
Abstract: 本发明公开了抗逆相关蛋白TaMYB85及其编码基因与应用。本发明所提供的抗逆相关蛋白TaMYB85,为如下1)或2)或3):1)氨基酸序列是序列表中序列2所示的蛋白质;2)在序列表中序列2所示的蛋白质的N端或/和C端连接标签得到的融合蛋白质;3)将1)或2)所示的蛋白质经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的与植物抗逆性相关的蛋白质。实验证明,将编码抗逆相关蛋白TaMYB85的核酸分子导入哥伦比亚生态型拟南芥,得到转基因拟南芥;高温处理后,与哥伦比亚生态型拟南芥相比,转基因拟南芥的耐热性显著提高。因此,抗逆相关蛋白TaMYB85可调控植物抗逆性。
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公开(公告)号:CN106062195A
公开(公告)日:2016-10-26
申请号:CN201380082005.7
申请日:2013-11-29
Applicant: 中国农业大学
CPC classification number: C07K14/415 , C12N15/8261 , Y02A40/146
Abstract: 提供了玉米基因ZmSPL1和ZmSPL2。还提供了由这些基因编码的蛋白和这些基因的用途。
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