公开(公告)号：CN116153418A

公开(公告)日：2023-05-23

申请号：CN202310413887.6

申请日：2023-04-18

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  无锡臻和生物科技有限公司

Inventor： 李苏星 ,  韩天澄 ,  李溪 ,  李宇龙 ,  宫芹芹 ,  张琦 ,  黄宇 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: G16B40/00 ,  G16B5/00 ,  G16B20/30 ,  G16B35/20

Abstract: 本申请公开了一种校正全基因组甲基化测序数据批次效应的方法、装置、设备和存储介质，属于基因检测技术领域。该方法通过预设数量的健康人血浆样本和肿瘤患者血浆样本的甲基化测序数据，筛选在健康人和肿瘤患者中甲基化水平相对稳定的区间作为甲基化稳定区间（house‑keeping window）；利用健康人血浆样本和待测样本的甲基化稳定区间的甲基化水平建立校正模型；利用校正模型校正待测样本全基因组内的甲基化水平。该方法在去除批次效应的同时保留了重要区域的甲基化特征，亦可在批次分组未知情况下去除批次效应。

公开(公告)号：CN115376616A

公开(公告)日：2022-11-22

申请号：CN202211299043.5

申请日：2022-10-24

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  臻悦生物科技江苏有限公司

Inventor： 杨顺莉 ,  李溪 ,  李宇龙 ,  洪媛媛 ,  韩天澄 ,  黄宇 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: G16B40/00 ,  G16B20/30 ,  G06K9/62

Abstract: 本发明提供了一种基于cfDNA多组学的多分类方法及装置，其中，多分类方法包括：基于ATAC‑seq技术对待测血浆样本进行超低深度的全基因组测序，并获取预设ATAC‑seq区域簇的测序数据，每个ATAC‑seq区域簇对应一类别的特征区域；基于预先配置的长插入片段阈值区间和短插入片段阈值区间分别统计每个ATAC‑seq区域簇测序数据的长插入片段数量和短插入片段数量；将统计得到的长插入片段数量和短插入片段数量输入预先训练的多组学分类模型中进行分类，得到待测血浆样本所属的类别。其基于片段组学的特征信息对待检测血浆样本进行分类，为后续应用提供部分依据。