一种基于大语言模型的转录因子结合位点预测方法及装置

    公开(公告)号:CN117649877A

    公开(公告)日:2024-03-05

    申请号:CN202311601226.2

    申请日:2023-11-27

    Applicant: 江南大学

    Abstract: 本发明涉及一种基于大语言模型的转录因子结合位点预测方法及装置,属于生物信息技术领域。包括:获取待预测DNA序列,对待预测DNA序列进行预处理得到目标输入序列;将目标输入序列输入大语言模型中,输出全局特征矩阵;将全局特征矩阵输入卷积神经网络模块中,输出局部特征矩阵;将局部特征矩阵输入通道注意力模块中,输出通道强化特征矩阵;将通道强化特征矩阵输入空间注意力模块中,输出空间强化特征矩阵,将空间强化特征矩阵和局部特征矩阵进行残差连接得到强化局部特征矩阵;将强化局部特征矩阵输入全连接层,输出待预测DNA序列上存在转录因子结合位点的预测概率。本申请通过充分提取DNA序列的特征,提高了预测结果的准确性。

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