一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统

    公开(公告)号:CN110246544B

    公开(公告)日:2021-03-19

    申请号:CN201910409758.3

    申请日:2019-05-17

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统,该方法包括下述步骤:选取原始测序数据;原始测序数据采用FANSe算法,进行mapping分析,得到基因定量信息,设定基因原始分组;采用GWGS算法计算基因在原始分组中的重要性排序,再采用GWRS算法将每组基因的重要性整合,得到整合后的基因重要性排列列表,将基因按照重要性从高到低排序;采用基于SVM的Wrapper Feature Selection模型进行数据挖掘,区分数据样本类型,从重要性高的基因中筛选出生物标志物。本发明根据测序数据特点,有机整合多中心的原始测序数据,并解决平台、样本、实验设计上的系统差异,采用稳健性高的整合分析算法进行深度数据挖掘,挖掘到共同、特异、关键的生物大分子。

    苄索氯铵在制备用于防治肺癌的药物中的应用

    公开(公告)号:CN109793726B

    公开(公告)日:2021-02-05

    申请号:CN201910189607.1

    申请日:2019-03-13

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了苄索氯铵在制备用于防治肺癌的药物中的应用。本发明中结合体外体内实验发现苄索氯铵可以抑制肺癌的生长、增殖,由于苄索氯铵毒具有副作用小、安全性高,价格便宜的优点,因此可将其作为一种治疗肺癌的药物。此外,本发明还发现苄索氯氨与吉非替尼联合使用的时候,比单独使用吉非替尼的明显地抑制了肺癌细胞的生长,说明苄索氯铵的加入可以增加肺癌细胞对吉非替尼的敏感性,因此,可将苄索氯氨作为吉非替尼的增敏剂,或将苄索氯氨与吉非替尼联合用药,用于肺癌治疗方面。

    阿德福韦酯在制备抗肿瘤药物中的应用

    公开(公告)号:CN108938652B

    公开(公告)日:2021-02-05

    申请号:CN201811032093.0

    申请日:2018-09-05

    Applicant: 暨南大学

    Inventor: 何庆瑜 杨杰 李斌

    Abstract: 本发明提供了阿德福韦酯在制备抗肿瘤药物中的应用。本发明首次发现了阿德福韦酯的全新作用机制,其可显著破坏蛋白质KCTD12和CDK1之间的相互作用,从而破坏肿瘤细胞信号通路,继而抑制肿瘤细胞生长,靶向肿瘤的特异性高;同时,由于阿德福韦酯作用于两个蛋白质的相互作用,最大程度避免了耐药性的出现。本发明进一步通过分子生物学、细胞学和动物学实验首次证实了阿德福韦酯能够显著抑制结肠癌细胞的分裂和增殖,扩展了阿德福韦酯的应用范围,提高了其应用价值。同时,阿德福韦酯是广泛应用于市场和临床的药物,毒副作用较小且副作用应对措施较为明确、价格适中,具有重要的现实意义。

    铑配合物在制备抗菌药物中的应用

    公开(公告)号:CN108938646B

    公开(公告)日:2019-09-17

    申请号:CN201810651576.2

    申请日:2018-06-22

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了铑配合物在制备抗菌药物中的应用。本发明发现了铑配合物Rh2Ac4能特异性地抑制肺炎链球菌、化脓链球菌、李斯特菌和金黄色葡萄球菌的生长,但对革兰氏阴性菌大肠杆菌和鲍曼不动杆菌没有抑制作用;接着以肺炎链球菌为研究对象,运用蛋白质组学技术研究了铑配合物Rh2Ac4的抗肺炎链球菌的作用机制,研究结果显示铑配合物Rh2Ac4能够通过血红素转运系统PiuABCD进入肺炎链球菌体内,降低铁的摄取,从而干扰铁的代谢,抑制细菌生长,且对细胞毒性低,因此,可将铑配合物Rh2Ac4用于治疗肺炎链球菌感染,为抗菌新药的开发提供一种有效途径。

    阿伏苯宗在制备抗肿瘤药物中的应用

    公开(公告)号:CN108938606B

    公开(公告)日:2019-09-17

    申请号:CN201811032122.3

    申请日:2018-09-05

    Applicant: 暨南大学

    Inventor: 何庆瑜 杨杰 李斌

    Abstract: 本发明提供了阿伏苯宗在制备抗肿瘤药物中的应用。本发明首次发现了阿伏苯宗可显著破坏PHB和c‑Raf1两个蛋白质之间的相互作用,从而破坏肿瘤细胞信号通路,继而抑制肿瘤细胞生长;阿伏苯宗靶向肿瘤的特异性高,副作用较小且副作用应对措施较为明确。由于并非靶向单个基因或蛋白质,因此阿伏苯宗不会对癌细胞内特定分子或单一蛋白质产生持续药物压力而导致其产生突变,大大降低了临床耐药的出现。本发明进一步通过分子生物学实验和细胞学实验首次证实了阿伏苯宗能够显著抑制结肠癌细胞的转移,扩展了阿伏苯宗的应用范围,提高了其应用价值,对肿瘤治疗具有重要的现实意义。

    一种检测结直肠癌中蛋白质组的方法

    公开(公告)号:CN107860922B

    公开(公告)日:2019-09-17

    申请号:CN201711004909.4

    申请日:2017-10-25

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明涉及癌细胞转移方面的研究,具体是一种检测结直肠癌中蛋白质组的方法。本发明利用Transwell筛选高侵袭的肠癌细胞HCT116‑I8,并结合SILAC技术进行定量组学的蛋白质鉴定找到与细胞侵袭能力相关的蛋白质或通路。蛋白质组学技术可以从整体角度分析高侵袭能力的细胞内蛋白质的动态表达水平,可以全景式地检测蛋白质表达谱。利用高度侵袭肠癌模型和蛋白组学筛选侵袭相关功能蛋白这一技术发明能够高通量、高精度、高分辨率地检测在结直肠癌中不同侵袭能力的细胞中蛋白质组的变化,并可以发现与侵袭转移相关的潜在通路。利用这一技术可以高效率的探索癌症等疾病的发生机制,并提供可信度较高的药物作用靶点。

    马来酸茚达特罗在制备抗肿瘤药物中的应用

    公开(公告)号:CN110013481A

    公开(公告)日:2019-07-16

    申请号:CN201910361231.8

    申请日:2019-04-30

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了马来酸茚达特罗在制备抗肿瘤药物中的应用。本发明首次发现马来酸茚达特罗可以抑制结直肠癌的生长。马来酸茚达特罗可抑制结直肠癌细胞的增殖活性,阻滞结直肠癌细胞周期,引起G1期阻滞,抑制体内结直肠癌的肿瘤生长。并且,马来酸茚达特罗抑制结直肠癌细胞增殖活性的效果随着马来酸茚达特罗浓度的增加和用药时间的延长而更加显著,对结直肠癌细胞的周期阻滞作用和体内生长具有浓度依赖性。同时,马来酸茚达特罗是一种FDA已批准上市的药物,较开发新药物而言成本低,无明显毒副作用,将其用来辅助治疗结直肠癌,能够为癌症的辅助治疗提供新的药物来源。

    蛋白热稳定测量结合双向稳定同位素标记蛋白组学筛选药物靶标的方法及应用

    公开(公告)号:CN109799350A

    公开(公告)日:2019-05-24

    申请号:CN201910043053.4

    申请日:2019-01-17

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了一种蛋白热稳定测量结合双向稳定同位素标记蛋白组学筛选药物靶标的方法及应用。该方法是利用正向-反向同位素标记的定量方法结合蛋白热稳定变化测量技术,其能够通过观测细胞内部哪些蛋白在药物的包裹下发生热力学变化,全局性地鉴定与药物相互作用的靶标蛋白。本发明的方法克服了传统鉴定方法的假阳性率高的缺点,其具有高通量、高深度、高精度、检测范围广,耗时短的特点,打破现有技术在药物靶标鉴定方面的局限性,为药物靶标研究提供有力的支撑。

    铑配合物在制备抗菌药物中的应用

    公开(公告)号:CN108938646A

    公开(公告)日:2018-12-07

    申请号:CN201810651576.2

    申请日:2018-06-22

    Applicant: 暨南大学

    Abstract: 本发明公开了铑配合物在制备抗菌药物中的应用。本发明发现了铑配合物Rh2Ac4能特异性地抑制肺炎链球菌、化脓链球菌、李斯特菌和金黄色葡萄球菌的生长,但对革兰氏阴性菌大肠杆菌和鲍曼不动杆菌没有抑制作用;接着以肺炎链球菌为研究对象,运用蛋白质组学技术研究了铑配合物Rh2Ac4的抗肺炎链球菌的作用机制,研究结果显示铑配合物Rh2Ac4能够通过血红素转运系统PiuABCD进入肺炎链球菌体内,降低铁的摄取,从而干扰铁的代谢,抑制细菌生长,且对细胞毒性低,因此,可将铑配合物Rh2Ac4用于治疗肺炎链球菌感染,为抗菌新药的开发提供一种有效途径。

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