一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌的酶切方法

    公开(公告)号:CN108949901A

    公开(公告)日:2018-12-07

    申请号:CN201810929537.4

    申请日:2018-08-15

    CPC classification number: C12Q1/44 C12Q1/04

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,涉及一种快速鉴定窖泥中甲烷囊菌(Methanoculleus)的酶切方法,该方法包含以下步骤:(1)将窖泥中含量最高的30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列分别进行MAFFT比对,找出各属的代表性序列2‑4个;(2)各属代表性序列的酶切分析,从中找出来甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式3‑10种;(3)在全部30个优势菌属与甲烷囊菌属的16S rDNA全长序列中逐一验证上述3‑10种特征性酶切方式。(4)经过确认的特征性酶切方式再进行实验验证。(5)最终确认至少一种甲烷囊菌16S rDNA全长序列的特征性酶切方式用于窖泥厌氧培养过程中菌落的快速鉴定。本发明可达到从窖泥厌氧菌群中快速识别甲烷囊菌属细菌的目的,比起常规测序鉴定节省大量时间。

    一种检测苔藓虫在污损早期附着程度的方法

    公开(公告)号:CN108893527A

    公开(公告)日:2018-11-27

    申请号:CN201810609102.1

    申请日:2018-06-13

    Abstract: 本发明属于生物技术领域,涉及一种检测苔藓虫在海洋污损中早期附着程度的方法,该方法包含以下步骤:(1)苔藓虫特异性引物的设计;(2)污损早期不同涂层表面海水污损样本的采集和基因组提取;(3)利用苔藓虫特异性引物对上述基因组样本进行PCR扩增来定量检测苔藓虫的附着程度。本发明基于海洋污损真核生物苔藓虫的18S核糖体RNA基因序列设计特异性引物,提供了一种不依赖于纯培养体系的苔藓虫附着测定方法,为海水现场污损样本中苔藓虫的附着程度检测提供了高效、快速的技术手段。同时,该方法也适用于室内纯培养体系中不同涂层表面的苔藓虫附着测定。

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