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公开(公告)号：CN113687976B
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202110994739.9
申请日：2021-08-27
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明提供了一种面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置，该方法包括将目标DNA序列进行拆分处理，得到多个原始子序列；针对每个所述原始子序列，生成所述原始子序列的多个第一编码，将多个所述第一编码分别插入至所述原始子序列中的指定位置，得到第一中间子序列；对每个所述第一中间子序列进行编码处理，得到所述目标DNA序列的编码后的多个目标子序列。相关技术中，当编码、解码过程中地址信息错误时，解码恢复得到的序列信息的正确率会明显下降，本申请的技术方案通过加入多个第一编码的方式，提高了编码、存储DNA序列的正确率；通过反复多次对序列进行CRC校验的方式，提高了解码、恢复DNA序列的正确率。
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公开(公告)号：CN113611364B
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202110994772.1
申请日：2021-08-27
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明提供了一种面向DNA存储的DNA序列处理方法、装置与电子设备，涉及DNA信息存储的技术领域，包括获取目标DNA序列的多个目标子序列；对每个第一中间子序列进行数据偏移处理，得到多个第二中间子序列；将多个第二中间子序列确定为目标DNA序列的处理后的多个子序列。长序列分为多个子序列后，经过编码和带误码采样，各子序列由于码字种类较少，容易出现不同子序列距离接近情况，如此将给聚类结果造成干扰导致正确率下降。本申请的技术方案通过两步加扰方案，增加了子序列之间的距离，提高了聚类正确率，进而提高了还原DNA序列的正确率。
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公开(公告)号：CN113611364A
公开(公告)日：2021-11-05
申请号：CN202110994772.1
申请日：2021-08-27
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明提供了一种面向DNA存储的DNA序列处理方法、装置与电子设备，涉及DNA信息存储的技术领域，包括获取目标DNA序列的多个目标子序列；对每个第一中间子序列进行数据偏移处理，得到多个第二中间子序列；将多个第二中间子序列确定为目标DNA序列的处理后的多个子序列。长序列分为多个子序列后，经过编码和带误码采样，各子序列由于码字种类较少，容易出现不同子序列距离接近情况，如此将给聚类结果造成干扰导致正确率下降。本申请的技术方案通过两步加扰方案，增加了子序列之间的距离，提高了聚类正确率，进而提高了还原DNA序列的正确率。
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公开(公告)号：CN113192557A
公开(公告)日：2021-07-30
申请号：CN202110620219.1
申请日：2021-06-03
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本申请提供了一种染色体变异检测方法、装置、电子设备及介质，该方法包括：获取待检测染色体的初始测序数据；根据所述初始测序数据的分辨率，构造所述初始测序数据的特征谱；根据所述初始测序数据的特征谱，统计各个待检测染色体的第一离群量和第一特征向量；从所述待检测染色体中，选择第一离群量大于第一预设阈值的染色体，并确定为发生变异染色体；根据所述发生变异染色体对应的第一特征向量，确定所述发生变异染色体的变异位置；本申请使用的仅仅是初始测序数据的全局信息和背景信息区分异常点，能更准确去除数据噪声和其他生物学信号的影响，假阳性低；使用简便，无需大量标注良好的训练数据集。
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公开(公告)号：CN108676871B
公开(公告)日：2020-03-06
申请号：CN201810744848.3
申请日：2018-07-09
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明公开了肠道微生物B.coprocola菌株的EDU99824.1基因可作为二型糖尿病诊断的分子标志物。本发明利用PCR和Sanger测序的方法发现EDU99824.1基因第879位点和第880位点的基因型在健康人和未用药的二型糖尿病病人肠道B.coprocola菌株中存在差异，即可以通过检测粪便基因组中EDU99824.1基因的上述两个SNP位点来判断受试者是否患有二型糖尿病。本发明的诊断试剂盒可用于二型糖尿病的诊断，在临床上具有广泛的应用前景。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109712678A
公开(公告)日：2019-05-03
申请号：CN201811516860.5
申请日：2018-12-12
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明实施例提供一种关系预测方法、装置及电子设备，该关系预测方法包括：分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合，得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络；根据融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络构建三元异质网络；对三元异质网络的网络节点进行预测，得到第一关联关系，该第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。以此能够充分挖掘药物-靶标-疾病三元关联关系信息，融合了药物、疾病和靶标多个属性的相似性网络，不会因使用单一属性带来的偏性从而影响预测结果的准确性。
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公开(公告)号：CN109671467A
公开(公告)日：2019-04-23
申请号：CN201811521645.4
申请日：2018-12-12
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: G16B25/10
Abstract: 本发明实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法及装置，属于基因数据处理领域。该方法包括：获取多个基因沉默后的全基因组表达数据；获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列；获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据；基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集；获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数；根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理，从而融合了海量各类跨平台的转录组大数据，无需从头培养病原体并感染细胞，做大规模的实验，进而降低了研发低成本、缩短了检测周期。并且减少了实验误差，使得对病原体感染的损伤机理的分析更加精确。
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公开(公告)号：CN109637595A
公开(公告)日：2019-04-16
申请号：CN201811521644.X
申请日：2018-12-12
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明涉及一种药物重定位方法、装置、电子设备及存储介质，属于生物信息学技术领域。该药物重定位方法，包括：获取不同维度下的药物相似度网络；通过相似性网络融合算法将不同维度下的药物相似度网络融合成一个目标药物相似度网络；通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物，作为药物重定位的候选药物。本申请实施例中，从不同维度获取药物相似度网络，并将各个维度下的药物相似度网络进行融合，再基于融合后的药物相似度网络进行药物重定位，减少了使用单一属性进行药物重定位带来的偏性，保证了药物重定位的可靠性。
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公开(公告)号：CN109616152A
公开(公告)日：2019-04-12
申请号：CN201811492500.6
申请日：2018-12-06
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
Abstract: 本发明提供了一种癌症特异的共调网络建立方法及装置，属于癌症调控网络建立技术领域。所述方法包括：根据公开数据库获得TF和miRNA对靶基因的TF调控信息和miRNA调控信息；根据TF调控信息和miRNA调控信息建立三元调控网络；识别所述三元调控网络中的FFLs，获得FFLs识别结果；根据FFLs识别结果和癌症基因组表达量信息，筛选得到癌症特异的miRNA-TF共调网络。本发明建立了TF，miRNA和靶基因的三元调控网络，并结合基因表达信息，获得miRNA-TF共调网络，提高了miRNA-TF共调控关系的准确性。
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公开(公告)号：CN108949965A
公开(公告)日：2018-12-07
申请号：CN201810958625.7
申请日：2018-08-22
Applicant: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明公开了SNP标志物在II型糖尿病诊断中的应用。本发明首次发现了肠道微生物B.coprocola菌株EDV01869.1基因SNP位点基因型与II型糖尿病有关，通过检测粪便基因组中EDV01869.1基因424位的SNP的基因型，可以判断患者是否患有II型糖尿病，提示可将上述SNP位点应用于II型糖尿病的早期临床诊断。
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