一种金纳米棒上快速修饰HS-DNA的方法

    公开(公告)号:CN104759620A

    公开(公告)日:2015-07-08

    申请号:CN201510193295.3

    申请日:2015-04-22

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种在金纳米棒上快速修饰HS-DNA的方法。所述方法包括如下步骤:(1)在CTAB存在下,通过种子生长的方法合成CTAB双分子层稳定的金纳米棒;(2)通过离心再用mPEG-SH和Tween20混合液重悬的方法取代金纳米棒表面的CTAB分子,在金纳米棒上修饰上mPEG-SH和Tween20;(3)向修饰有mPEG-SH和Tween20的金纳米棒溶液中加入HS-DNA和高浓度的酸或盐,20-40℃老化1小时;(4)通过离心再用缓冲液重悬去除游离的HS-DNA就能够获得修饰有HS-DNA的金纳米棒。该方法快速、高效、经济,使金纳米棒具有很高的稳定性,避免了缓慢增加盐浓度的老化过程,使金纳米棒上修饰HS-DNA的修饰步骤简化、修饰时间缩短。

    上皮细胞粘附分子的核酸适体及其制备方法

    公开(公告)号:CN102827845A

    公开(公告)日:2012-12-19

    申请号:CN201210362899.2

    申请日:2012-09-24

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 上皮细胞粘附分子的核酸适体及其制备方法,涉及一种核酸。提供具有高特异性和高亲和力的上皮细胞粘附分子EpCAM的核酸适体及其制备方法与应用。所述上皮细胞粘附分子EpCAM的核酸适体具有G四聚体结构或者茎环结构,制备方法包括:设计并合成单链DNA随机寡核苷酸库,筛选目的寡核苷酸序列,并通过流式分析法鉴定其与靶蛋白结合的特异性和亲和力。筛选获得的核酸适体无毒性,分子量小,渗透性好,易于合成与标记,只特异性识别EpCAM蛋白,并且特异性识别表达EpCAM蛋白的细胞系,对不表达此蛋白的细胞系不具有识别功能。

    一种单克隆抗体的筛选方法

    公开(公告)号:CN115109149B

    公开(公告)日:2024-08-09

    申请号:CN202210703885.6

    申请日:2022-06-21

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种单克隆抗体的筛选方法。该方法包括:采用各个不同的第一核酸分子标识符和各个不同的第二核酸分子标识符并基于交叉定位标识法,对微孔芯片中的各个微孔进行编码,从而得到所述微孔芯片中的各个微孔的位置编码信息;基于所述微孔芯片中的各个微孔的位置编码信息对单克隆抗体进行筛选。该筛选方法可以降低操作难度和筛选成本,还可以大大提高实验通量。

    一种基于深度迁移学习的循环肿瘤细胞的快速注释方法

    公开(公告)号:CN114974433B

    公开(公告)日:2024-07-23

    申请号:CN202210582319.4

    申请日:2022-05-26

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明提供了一种基于深度迁移学习的循环肿瘤细胞的快速注释方法,将源域肿瘤细胞集的表达矩阵和目标域肿瘤细胞集的表达矩阵输入神经网络模型的特征提取器进行特征提取;将源域肿瘤细胞集特征和目标域肿瘤细胞集特征进行无监督聚类,采用循环一致匹配关联源域肿瘤细胞集和目标域肿瘤细胞集的共识分类,并通过计算领域共识分数,得到目标肿瘤细胞集分类数,为目标域肿瘤细胞集分配伪标签;输入神经网络模型的分类器,采用目标函数来更新神经网络模型的参数;循环执行至停止条件,输出目标域肿瘤细胞集的原型标签以及训练完成的神经网络模型,本发明提供的方法能够精确地给目标样本分配准确的标签,并为源域和目标域构建一个共同的表示空间。

    唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-15蛋白的核酸适配体及其应用

    公开(公告)号:CN113122543B

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202110358738.5

    申请日:2021-04-01

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素‑15(Sialic acid‑bindingimmunoglobulin‑like lectin‑15,Siglec‑15)蛋白的核酸适配体,所述的核酸适配体包括如SEQ IDNO:1至SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列。本发明的核酸适配体能够提供Siglec‑15蛋白的快速、精准检测,同时适配体能够阻断其与T细胞表面受体相互作用,一定程度上恢复T细胞增殖活性,从而使得肿瘤微环境的免疫正常化,且不会引起严重的自身免疫反应。Siglec‑15核酸适配体可作为药物用于肿瘤微环境高表达Siglec‑15的癌症,成为肿瘤免疫治疗的潜在核酸药物,可能对抗PD‑L1治疗无效的患者有效,进而补充现有肿瘤诊断和免疫治疗体系。

    一种糖基化外泌体PD-L1的检测方法

    公开(公告)号:CN114717299B

    公开(公告)日:2024-04-19

    申请号:CN202111320426.1

    申请日:2021-11-09

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种糖基化外泌体PD‑L1的检测方法,包括如下步骤:1)分离外泌体;2)连接第一偶合物与第一DNA,所述的第一偶合物能够与外泌体的糖基结合;3)加入第一偶合物与第一DNA的偶联物;4)加入PD‑L1适配体;5)稀释反应溶液;6)加入连接臂DNA;7)在连接臂的作用下DNA连接酶将第一DNA与PD‑L1适配体连接;8)对与连接臂互补的第一DNA与PD‑L1适配体连接部分进行扩增,检测扩增信号。本发明方法特异性检测糖基化的外泌体PD‑L1,无需分离释放糖蛋白,检测灵敏度高,检测限为1.09pg/mL,适用于多种生物体系。

    一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法

    公开(公告)号:CN115881222A

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN202211036695.X

    申请日:2022-08-26

    Applicant: 厦门大学

    Abstract: 本发明公开了一种原位DNA微阵列合成系统的合成序列计算方法,包括:得到整数序列集;构建概率数据库,构建概率索引数据库;进入迭代过程,扩增结点中的序列,更新扩增后结点的匹配位置,更新迭代结点集;计算迭代结点集中所有结点的指导值;从迭代结点集中,选出主导结点集,根据主导结点集进行分枝修剪;清空候选结点集,按指导值从大到小从迭代结点集中选取指定个数个候选结点,添加入候选结点集;从迭代结点集中随机选选取指定个数个候选结点,添加入候选结点集中;对扩增完成的整数序列进行检验,若为序列集编码后的整数序列集的公共超序列,则按编码规则进行译码,得到一串字符串。它能有效提高原位DNA微阵列合成系统的效率。

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