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公开(公告)号：CN116364192A
公开(公告)日：2023-06-30
申请号：CN202310216689.0
申请日：2023-03-08
Applicant: 南京农业大学
IPC: G16B40/30 , G06F18/23 , G06N3/08 , G06N3/0464
Abstract: 本发明公开了一种使用自监督特征学习的三代宏基因组分箱方法，其包括步骤为：步骤一、在已测序基因组数据基础上生成模拟长reads；步骤二、将长reads送入自监督特征表示模型训练，并保存最佳模型参数；步骤三、模型训练后，将三代reads送入模型提取特征，宏基因组long reads序列通过特征表示模型转换成特征向量后，将输入到聚类层通过聚类层进行分箱。本发明避免了以往大多数方法只看重核苷酸频率和覆盖度等统计特征而忽视long reads本身序列特征的缺点，其使用的具有半监督性质的对比学习能够有效利用已有的数据库信息，避免了以往无监督学习的盲目性。
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公开(公告)号：CN116004691A
公开(公告)日：2023-04-25
申请号：CN202310039660.X
申请日：2023-01-11
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种评估致病力强度的报告体系，通过如下步骤构建：首先构建青枯菌OE1‑1的ΔphcB突变体OE1‑1‑dphcB，接着将phcA的直接转录靶点xpsR的启动子区域与编码β‑半乳糖苷酶的大肠杆菌报告基因lacZ分别连接到pUC18‑mini‑Tn7T‑Gm质粒上，通过电激转入OE1‑1‑dphcB后，利用PCR反应筛选构建成功的菌株即为报告菌株。本发明将报告菌株与待测菌株共培养进行β‑半乳糖苷酶活实验，检测xpsR表达情况；xpsR表达情况与lacZ表达呈正相关关系，待测青枯菌株致病力越强，则β‑半乳糖苷酶活性越强，生化实验反应液显色越明显。
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公开(公告)号：CN115305185A
公开(公告)日：2022-11-08
申请号：CN202211090491.4
申请日：2022-09-07
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种研究有益菌VOCs控制土传病害的装置，包括第一筒体，第二筒体，第一筒体的顶部敞口，第一筒体的底部与第二筒的顶部连接，在第一筒体和第二筒体的交界处设置有隔板，隔板开有若干圆孔，在隔板上垫有一层无菌过滤层；第一筒体与第二筒体连接处的外壁设有密封层。本发明下部筒体用于培养有益菌产生VOCs，上部筒体用于培育植株；在第一筒体底部打孔并铺垫无菌过滤层，既保证培养装置上下相连，使VOCs气体得以良好扩散进入第一筒体中的基质，又避免作物生长基质落入下部第二筒体；由第二筒体为有益菌产生的VOCs气体提供足够的扩散空间，并在两个筒体连接处外壁缠绕封口膜形成密封层，防止VOCs从中逸出。
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公开(公告)号：CN114822697A
公开(公告)日：2022-07-29
申请号：CN202210310443.5
申请日：2022-03-28
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法，其步骤为：步骤一、构建非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤二、封装非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤三、土壤样品DNA抽提和建库；步骤四、采用Illumina测序技术完成土壤样品的宏基因组测序；步骤五、对测序数据进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据；步骤六、对质控数据进行耐药基因定量分析；步骤七、不同样品的耐药基因丰度总体比较分析并可视化。本发明不仅可以用于宏基因组质控数据的ARGs物种溯源定量分析，还可以使用该数据库进行ARGs注释；对微生物基因组序列进行ARGs注释时甚至可以评估其所携带的ARGs宿主来源，为抗性基因水平基因组转移等相关研究提供了技术支撑。
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公开(公告)号：CN111607535B
公开(公告)日：2021-02-09
申请号：CN202010403070.7
申请日：2020-05-13
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种环丝氨酸与有益菌配合防控番茄土传青枯病的应用，采用灌根法将环丝氨酸与有益菌施入土壤；其中，有益菌为菌株NJQL‑A6，分类命名为皮氏罗尔斯通氏菌(Ralstonia pickettii)，2012年9月26日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏单位地址：北京市朝阳区大屯路，菌种保藏号为CGMCC No.6628。本发明通过资源调控的方式可以增强有益菌抑制土传青枯病的能力，同时施用有益菌和环丝氨酸，以环丝氨酸作为资源物质，不仅能够促进有益菌生长，还能显著提高有益菌对青枯菌的抑制能力，从而减少番茄青枯病的发病率，防控番茄土传病害。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110059759A
公开(公告)日：2019-07-26
申请号：CN201910336951.9
申请日：2019-04-25
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种基于加权LBP-颜色矩的堆肥腐熟度预测方法，它包括以下步骤：S1、获取堆肥图像；S2、分别获得堆肥图像的LBP纹理特征和堆肥图像的颜色特征；S3、将堆肥图像的LBP纹理特征和颜色特征进行加权融合，获得堆肥图像特征向量；S4、对堆肥图像特征向量做PCA降维获得降维堆肥图像特征向量；S5、降维堆肥图像特征向量输入至SVM分类器进行腐熟度预测；S6、SVM分类器输出预测结果。整个评价方法易操作，非常适于推广应用。
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公开(公告)号：CN108410825A
公开(公告)日：2018-08-17
申请号：CN201810375733.1
申请日：2018-04-20
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种噬菌体鸡尾酒及其应用，该噬菌体组合物包括以下(1)～(4)中的四株分离自不同地区的青枯菌专性裂解性噬菌体：(1)噬菌体NJ-P3，保藏编号为：CCTCC NO：M 2018099；(2)噬菌体NB-P21，保藏编号为：CCTCC NO：M 2018100；(3)噬菌体NC-P34，保藏编号为：CCTCC NO：M 2018101；(4)噬菌体NN-P42，保藏编号为：CCTCC NO：M 2018102；上述的噬菌体均于2018年3月6日保藏于中国典型培养物保藏中心，分类命名为Podoviridae phage。四株分离自不同地区的青枯菌专性裂解性噬菌体进行组合对青枯病的防治具有显著的协同增效作用。
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公开(公告)号：CN103992957B
公开(公告)日：2016-06-22
申请号：CN201410228275.0
申请日：2014-05-27
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: Y02W30/43
Abstract: 本发明属于农业废弃物资源利用技术，公开了一株能分解梨树修剪枝条的降解真菌及其菌剂，该菌株D10属于撕裂蜡孔菌(Ceriporia lacerata)，2013年7月8日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，菌种保藏号为CGMCC NO.7852。该菌株可在以梨树枝条为唯一碳源的培养基上生长。在21d的液态发酵过程中，菌株D10的漆酶、木质素过氧化物酶、锰过氧化物酶的酶活力最高值分别为11.03，36.71和152.75U·mL-1。本发明是利用微生物发酵的方法降解农业废弃梨树修剪枝条，使其转化为有机肥料，可以变废为宝、保护环境，具有广阔的应用前景。
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公开(公告)号：CN105296363A
公开(公告)日：2016-02-03
申请号：CN201510713680.6
申请日：2015-10-28
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开一种草酸青霉菌NJDL-03菌株及其应用，该菌株NJDL-03属于草酸青霉菌，于2015年7月8日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，菌种保藏号为CGMCC NO.11061。草酸青霉菌株NJDL-03能显著提高羟基磷灰石的溶解度，释放出的大量磷酸根离子(PO43-)，沉淀环境中Pb2+，生成极易沉淀及十分稳定的羟基磷灰石铅[Pb10(PO4)6(OH)2]，降低铅在环境中的有效性，从而修复铅污染的环境。由该菌株NJDL-03进行固体发酵制得的草酸青霉菌肥在提高羟基磷灰石的溶解度，修复土壤铅污染及提高石灰性土壤磷素利用率，促进作物生长的应用上效果显著。
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公开(公告)号：CN103740608B
公开(公告)日：2015-08-26
申请号：CN201310662410.8
申请日：2013-12-09
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于农业集约化生产技术，公开了一株嗜热地芽孢杆菌NJRC-14及其微生物有机肥料。本发明提供了一株嗜热地芽孢杆菌(Geobacillus kaustophilus)菌株NJRC-14，在30～50℃下能快速增殖，与菜粕进行固体发酵产生大量抑制土传青枯病病原菌生长的物质。本发明还提供了利用菌株NJRC-14制备微生物有机肥料的方法和应用，该微生物有机肥料生产方法简单，质量稳定，无需二次发酵，具有较好的经济和社会效益。试验表明，该微生物有机肥料施入土壤后能够使拮抗菌迅速繁殖，在土壤中形成优势群，拮抗菌利用菜粕产生拮抗物质，抑制病原菌的生长，在发病严重的番茄青枯病土壤中生防效率达75%以上。
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