公开(公告)号：CN115404270A

公开(公告)日：2022-11-29

申请号：CN202211343981.0

申请日：2022-10-31

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  臻悦生物科技江苏有限公司

Inventor： 王小庆 ,  洪媛媛 ,  王睿 ,  聂佩瑶 ,  夏瑞燕 ,  吕芳 ,  张琦 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: C12Q1/6858 ,  G16B20/30 ,  G16B20/10

Abstract: 本发明公开了一种DNA甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法、应用、终端设备及计算机可读存储介质，属于基因检测技术领域。上述甲基化测序文库甲基化转化率的评估方法是选择位点甲基化转化率与甲基化文库甲基化转化率相关的位点作为参照位点，该评估方法克服了酶学转化法甲基化文库构建过程中甲基化文库C‑T甲基化转化率受碱基序列影响的问题，利用该参照位点甲基化转化率能够快速评估甲基化文库甲基化转化率，并用于DNA甲基化检测中甲基化转化率的质控，方便快捷，解决了传统方法周期长、耗时、耗力等问题。同时提供了终端设备及计算机可读存储介质，能够根据参照位点的甲基化转化率输出文库甲基化转化率或输出文库是否合格的结果。

公开(公告)号：CN116153418B

公开(公告)日：2023-07-18

申请号：CN202310413887.6

申请日：2023-04-18

Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 ,  无锡臻和生物科技有限公司

Inventor： 李苏星 ,  韩天澄 ,  李溪 ,  李宇龙 ,  宫芹芹 ,  张琦 ,  黄宇 ,  陈维之 ,  杜波

IPC: G16B40/00 ,  G16B5/00 ,  G16B20/30 ,  G16B35/20

Abstract: 本申请公开了一种校正全基因组甲基化测序数据批次效应的方法、装置、设备和存储介质，属于基因检测技术领域。该方法通过预设数量的健康人血浆样本和肿瘤患者血浆样本的甲基化测序数据，筛选在健康人和肿瘤患者中甲基化水平相对稳定的区间作为甲基化稳定区间（house‑keeping window）；利用健康人血浆样本和待测样本的甲基化稳定区间的甲基化水平建立校正模型；利用校正模型校正待测样本全基因组内的甲基化水平。该方法在去除批次效应的同时保留了重要区域的甲基化特征，亦可在批次分组未知情况下去除批次效应。