一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置

    公开(公告)号:CN112992267B

    公开(公告)日:2024-02-09

    申请号:CN202110392600.7

    申请日:2021-04-13

    Abstract: 本申请提供了一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置,其中,所述方法包括:获取scATAC‑seq数据,其中,scATAC‑seq数据包括峰值区域‑细胞矩阵;对峰值区域‑细胞矩阵进行初始化处理,分别得到表征转录因子之间的调控关系的初始邻接矩阵,以及表征每个转录因子的特征信息的初始特征矩阵;将初始邻接矩阵和初始特征矩阵输入至转录因子调控网络预测模型中,得到与初始邻接矩阵相对应的邻接矩阵预测结果。这样一来,仅通过采用scATAC‑seq数据即可解决单细胞的转录因子调控网络预测问题,规避了scRNA‑seq数据在预测调控关系时的诸多弊(56)对比文件Seungbyn Baek,et al.."Single-cellATAC sequencing analysis: From datapreprocessing to hypothesis generation".《Computational and StructuralBiotechnology Journal》.2020,(第18期),1429–1439.

    一种病原体感染损伤机理解析方法及装置

    公开(公告)号:CN109671467B

    公开(公告)日:2023-03-24

    申请号:CN201811521645.4

    申请日:2018-12-12

    Abstract: 本发明实施例提供的一种病原体感染损伤机理解析方法及装置,属于基因数据处理领域。该方法包括:获取多个基因沉默后的全基因组表达数据;获取所述全基因组表达数据所对应的基因表达秩序列;获取多种不同病原体感染后的全基因组表达谱数据;基于所述全基因组表达谱数据构建所述病原体感染的印记基因集;获取所述基因表达秩序列与所述印记基因集的富集分数;根据所述富集分数确定所述病原体感染的损伤机理,从而融合了海量各类跨平台的转录组大数据,无需从头培养病原体并感染细胞,做大规模的实验,进而降低了研发低成本、缩短了检测周期。并且减少了实验误差,使得对病原体感染的损伤机理的分析更加精确。

    面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置

    公开(公告)号:CN113687976A

    公开(公告)日:2021-11-23

    申请号:CN202110994739.9

    申请日:2021-08-27

    Abstract: 本发明提供了一种面向DNA信息存储的编码和解码方法与装置,该方法包括将目标DNA序列进行拆分处理,得到多个原始子序列;针对每个所述原始子序列,生成所述原始子序列的多个第一编码,将多个所述第一编码分别插入至所述原始子序列中的指定位置,得到第一中间子序列;对每个所述第一中间子序列进行编码处理,得到所述目标DNA序列的编码后的多个目标子序列。相关技术中,当编码、解码过程中地址信息错误时,解码恢复得到的序列信息的正确率会明显下降,本申请的技术方案通过加入多个第一编码的方式,提高了编码、存储DNA序列的正确率;通过反复多次对序列进行CRC校验的方式,提高了解码、恢复DNA序列的正确率。

    一种碳纤维及其制备方法与应用

    公开(公告)号:CN109709187B

    公开(公告)日:2021-07-13

    申请号:CN201811568960.2

    申请日:2018-12-21

    Abstract: 本发明公开了一种碳纤维及其制备方法与应用。它的制备方法,包括如下步骤:将泡沫镍作为基底置于反应器皿中,除去体系中的空气,然后以乙炔作为碳源,采用化学气相沉积方法反应,即得到碳纤维。本发明所述碳纤维在制备葡萄糖生物传感器和/或葡萄糖/氧气生物燃料电池中的应用。本发明葡萄糖生物传感器,其分子识别元件表面包覆所述碳纤维;且所述碳纤维上固定葡萄糖氧化酶。本发明葡萄糖生物燃料电池,其工作电极表面包覆所述碳纤维;且所述碳纤维上固定所述葡萄糖氧化酶。本发明碳纤维在葡萄糖生物传感器和GBFC应用中表现出良好的电化学性能。

    染色体间易位识别方法、装置、电子设备及可读存储介质

    公开(公告)号:CN112052813A

    公开(公告)日:2020-12-08

    申请号:CN202010964014.0

    申请日:2020-09-15

    Abstract: 本申请提供了一种染色体间易位识别方法、装置、电子设备及可读存储介质,易位识别方法包括:对获取到的待识别染色体的初始测序数据进行预处理,得到所述待识别染色体的染色体交互图像;将所述染色体交互图像输入至预先训练好的区域分类模型中,从所述染色体交互图像中识别出染色体片段发生易位的高频区域;将所述染色体交互图像输入至预先训练好的位置检测模型中,根据所述高频区域确定出所述染色体交互图像中存在染色体片段发生易位的易位起始位置。这样,通过区域分类模型和位置检测模型对染色体片段进行分类和检测,能够准确的对染色体片段发生易位的情况进行识别,从而确定出染色体片段发生易位的易位起始位置,提高易位识别的精确度。

    一种药物重定位方法、装置、电子设备及存储介质

    公开(公告)号:CN109637595B

    公开(公告)日:2020-04-10

    申请号:CN201811521644.X

    申请日:2018-12-12

    Abstract: 本发明涉及一种药物重定位方法、装置、电子设备及存储介质,属于生物信息学技术领域。该药物重定位方法,包括:获取不同维度下的药物相似度网络;通过相似性网络融合算法将不同维度下的药物相似度网络融合成一个目标药物相似度网络;通过预设规则从所述目标药物相似度网络中筛选出满足药物重定位条件的药物,作为药物重定位的候选药物。本申请实施例中,从不同维度获取药物相似度网络,并将各个维度下的药物相似度网络进行融合,再基于融合后的药物相似度网络进行药物重定位,减少了使用单一属性进行药物重定位带来的偏性,保证了药物重定位的可靠性。

    关系预测方法、装置及电子设备

    公开(公告)号:CN109712678B

    公开(公告)日:2020-03-06

    申请号:CN201811516860.5

    申请日:2018-12-12

    Abstract: 本发明实施例提供一种关系预测方法、装置及电子设备,该关系预测方法包括:分别对多个药物单属性相似性网络、多个靶标单属性相似性网络、多个疾病单属性相似性网络进行融合,得到融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络;根据融合药物相似性网络、融合靶标相似性网络、融合疾病相似性网络构建三元异质网络;对三元异质网络的网络节点进行预测,得到第一关联关系,该第一关联关系包括第一药靶关联关系、第一药病关联关系、第一靶病关联关系。以此能够充分挖掘药物‑靶标‑疾病三元关联关系信息,融合了药物、疾病和靶标多个属性的相似性网络,不会因使用单一属性带来的偏性从而影响预测结果的准确性。

    一种染色质拓扑相关结构域的表征方法及装置

    公开(公告)号:CN108647492B

    公开(公告)日:2019-04-16

    申请号:CN201810410147.6

    申请日:2018-05-02

    Abstract: 本发明实施例提供一种染色质拓扑相关结构域的表征方法及装置。所述方法包括:获取待表征染色质拓扑相关结构域TAD对应的Hi‑C数据以及Hi‑C数据分辨率;根据Hi‑C数据的长度和Hi‑C数据分辨率计算获得待表征TAD中的碱基数;根据Hi‑C数据计算待表征TAD占据的细胞核中的空间体积;根据Hi‑C数据分辨率、待表征TAD中的碱基数和待表征TAD占据的细胞核中的空间体积计算获得待表征TAD的致密度,通过致密度来表征待表征TAD。所述装置用于执行所述方法。本发明实施例通过Hi‑C数据分辨率、待表征TAD中的碱基数和待表征TAD占据的细胞核中的空间体积计算获得待表征TAD的致密度,根据致密度能够准确的对待表征TAD进行表征。

Patent Agency Ranking