一种基因检测试剂评估管理系统

    公开(公告)号:CN118586696A

    公开(公告)日:2024-09-03

    申请号:CN202410582950.3

    申请日:2024-05-11

    Inventor: 费成平 丁伟峰

    Abstract: 本发明公开了一种基因检测试剂评估管理系统,涉及基因检测技术领域,该系统包括以下组成部分:试剂数据整合模块,整合多个来源的基因检测试剂数据,包括试剂性能、适用范围、价格的信息,构建统一的数据共享平台,通过数据整合,系统能够提供全面的试剂信息,方便用户进行查询和比较,试剂风险评估模块,利用先进的机器学习和逻辑回归技术,对基因检测试剂的多个维度进行综合评估,构建评估模型,对试剂的性能进行量化评分,并识别出潜在的风险和安全隐患,本发明利用机器学习算法和逻辑回归技术构建风险评估模型,对基因检测试剂的多个维度进行综合评估,准确识别出潜在的风险和安全隐患,更好地保障基因检测的安全性和有效性。

    SAM在早期筛查与诊断结直肠癌中的应用

    公开(公告)号:CN118050514A

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202410294612.X

    申请日:2024-03-15

    Abstract: 本发明涉及生物医学技术领域,具体的,本申请提供了SAM作为生物标志物在制备早期筛查与诊断结直肠癌产品中的应用,本申请通过收集临床资料及血液样本进行酶联免疫吸附法(ELISA)检测血浆中S‑腺苷甲硫氨酸(SAM)的含量。发现结直肠癌患者血浆中SAM浓度显著高于正常对照人群。本研究通过检测外周血SAM水平,发现SAM可作为CRC的诊断生物标志物。通过ELISA方法在血清中即可检测,方便准确,成本低,是一种适合临床开展的实验诊断方法。

    转录因子CEBPB结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法

    公开(公告)号:CN112708635A

    公开(公告)日:2021-04-27

    申请号:CN202011620055.4

    申请日:2020-12-30

    Abstract: 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法,包括如下步骤:S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区,而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态,转录因子CEBPB无法结合,影响CPEB1基因的染色质可及性,从而抑制CPEB1基因的表达;S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时,转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区,从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性,使其启动子区不能结合CEBPB,同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。

    结直肠癌抑癌基因及其启动子区高DNA甲基化的验证方法

    公开(公告)号:CN112481273A

    公开(公告)日:2021-03-12

    申请号:CN202011585665.5

    申请日:2020-12-29

    Abstract: 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因,为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法,通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验,证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因,且其启动子区存在高DNA甲基化位点,基因表达呈低表达模式。

    P2RX1、CBFA2T3和CERS4的多重甲基化反应体系用于胰腺导管腺癌早期筛查与诊断

    公开(公告)号:CN117987543A

    公开(公告)日:2024-05-07

    申请号:CN202311766617.X

    申请日:2023-12-20

    Abstract: 本发明提供P2RX1、CBFA2T3和CERS4的多重甲基化反应体系用于胰腺导管腺癌早期筛查与诊断,涉及生物医学技术领域,其技术要点在于:CBFA2T3、P2RX1和CERS4中至少一种ctDNA甲基化作为生物标志物在制备早期筛查与诊断胰腺导管腺癌产品中的应用。本申请中所提供的多重QMSP反应体系较单一体系降低了样本量、时间和成本,提高了诊断效能。且联合诊断模型在PDAC的筛查和评估临床分期方面的特异性与敏感性均显著高于CA19‑9和单一模型。

    结直肠癌DNA甲基化标志物
    18.
    发明授权

    公开(公告)号:CN110438228B

    公开(公告)日:2022-12-23

    申请号:CN201910702472.4

    申请日:2019-07-31

    Abstract: 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集,所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677;本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒;本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法,本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法,本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3),可用于CRC筛查与早期诊断,并优于目前广泛使用的SEPT9方法;可推广应用于结直肠癌的诊断。

    一种泛癌抑制非编码RNA及其泛癌抑制属性的检测方法

    公开(公告)号:CN112760321A

    公开(公告)日:2021-05-07

    申请号:CN202110048865.5

    申请日:2021-01-14

    Inventor: 丁伟峰 郭士成

    Abstract: 本发明提供一种泛癌抑制非编码RNA,为PAn‑cancer Non‑Coding RNA 246,命名为PANC246。还提供一种泛癌抑制非编码RNA的泛癌抑制属性的检测方法,包括如下步骤:2.1、构建质粒与肿瘤细胞系培养;2.2、CCK‑8实验检测过表达PANC246的肿瘤细胞株增殖能力;2.3、流式细胞术检测PANC246促癌细胞凋亡率;2.4、划痕实验检测PANC246抑制肿瘤细胞迁移能力;2.5、Transwell小室实验检测PANC246抑制肿瘤细胞侵袭能力;2.6、荧光定量PCR检测上调表达PANC246抑制原癌基因mRNA水平情况。本发明通过TCGA数据库中泛癌数据挖掘,发现一种全新的泛癌抑制ncRNA,命名为PANC246(PAn‑cancer Non‑Coding RNA 246)。本专利通过生物信息学与功能研究,以明确PANC246的泛癌抑制属性,以期为肿瘤的治疗提供新的非编码基因靶点。

    结直肠癌DNA甲基化标志物
    20.
    发明公开

    公开(公告)号:CN110438228A

    公开(公告)日:2019-11-12

    申请号:CN201910702472.4

    申请日:2019-07-31

    Abstract: 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集,所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677;本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒;本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法,本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法,本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3),可用于CRC筛查与早期诊断,并优于目前广泛使用的SEPT9方法;可推广应用于结直肠癌的诊断。

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