公开(公告)号：CN110438228B

公开(公告)日：2022-12-23

申请号：CN201910702472.4

申请日：2019-07-31

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  鞠少卿 ,  钱飞 ,  马彦云 ,  张健锋 ,  邵可可 ,  肖峰 ,  靳钦

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11 ,  G16H50/20 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集，所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677；本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒；本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法，本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法，本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3)，可用于CRC筛查与早期诊断，并优于目前广泛使用的SEPT9方法；可推广应用于结直肠癌的诊断。

公开(公告)号：CN110438228A

公开(公告)日：2019-11-12

申请号：CN201910702472.4

申请日：2019-07-31

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  鞠少卿 ,  钱飞 ,  马彦云 ,  张健锋 ,  邵可可 ,  肖峰 ,  靳钦

IPC: C12Q1/6886 ,  C12N15/11 ,  G16H50/20 ,  G16B20/20

Abstract: 本发明提供一种用于预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集，所述标志物集包括ESR1、ZNF132、ZNF229、ZNF542和ZNF677；本发明还提供一种用于测定DNA甲基化标志物集的试剂盒；本发明还提供一种DNA甲基化标志物集用于制备预测受试者中结直肠癌(CRC)风险的试剂盒的用途。本发明还提供一种获取DNA甲基化标志物集的方法，本发明还提供一种用于评估结直肠癌DNA甲基化标志物集诊断准确性的方法，本发明提出了预测结直肠癌(CRC)风险的DNA甲基化标志物集并构建了诊断模型(模型1、模型2和模型3)，可用于CRC筛查与早期诊断，并优于目前广泛使用的SEPT9方法；可推广应用于结直肠癌的诊断。

公开(公告)号：CN112708635A

公开(公告)日：2021-04-27

申请号：CN202011620055.4

申请日：2020-12-30

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  邵可可 ,  张健锋 ,  鞠少卿 ,  马彦云

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/65 ,  C12N15/12 ,  C12Q1/6804 ,  C12Q1/6834

Abstract: 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法，包括如下步骤：S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区，而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态，转录因子CEBPB无法结合，影响CPEB1基因的染色质可及性，从而抑制CPEB1基因的表达；S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时，转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区，从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性，使其启动子区不能结合CEBPB，同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。

公开(公告)号：CN112481273A

公开(公告)日：2021-03-12

申请号：CN202011585665.5

申请日：2020-12-29

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  邵可可 ,  张健锋 ,  鞠少卿 ,  马彦云

IPC: C12N15/12 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因，为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法，通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验，证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因，且其启动子区存在高DNA甲基化位点，基因表达呈低表达模式。

公开(公告)号：CN112481273B

公开(公告)日：2023-11-24

申请号：CN202011585665.5

申请日：2020-12-29

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  邵可可 ,  张健锋 ,  鞠少卿 ,  马彦云

IPC: C12N15/12 ,  C12Q1/6886

Abstract: 本发明提供一种结直肠癌抑癌基因，为CPEB1基因。本发明还提供一种结直肠癌抑癌基因的启动子区高DNA甲基化的验证方法，通过DNA甲基化靶向测序技术检测甲基化程度、荧光定量PCR技术检测基因mRNA表达、Western印迹技术检测蛋白水平、流式细胞术检测细胞凋亡情况、CCK‑8实验和细胞克隆形成实验评估细胞增殖克隆能力、损伤修复实验评估细胞迁移能力、Transwell小室实验评估细胞侵袭能力、裸鼠成瘤实验模拟CPEB1基因在体内的致瘤能力等实验，证明CPEB1基因是一新的结直肠癌抑癌基因，且其启动子区存在高DNA甲基化位点，基因表达呈低表达模式。

公开(公告)号：CN112708635B

公开(公告)日：2023-02-21

申请号：CN202011620055.4

申请日：2020-12-30

Applicant: 南通大学附属医院

Inventor： 丁伟峰 ,  濮伟霖 ,  邵可可 ,  张健锋 ,  鞠少卿 ,  马彦云

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/65 ,  C12N15/12 ,  C12Q1/6804 ,  C12Q1/6834

Abstract: 本发明提供一种转录因子CEBPB和TFCP2竞争结合CPEB1基因启动子区调节CPEB1基因表达的方法，包括如下步骤：S1、通过实验验证转录因子CEBPB可结合CPEB1基因启动子区，而当CPEB1基因启动子区高甲基化状态，转录因子CEBPB无法结合，影响CPEB1基因的染色质可及性，从而抑制CPEB1基因的表达；S2、通过实验验证CPEB1基因启动子区高甲基化状态时，转录因子TFCP2可结合CPEB1基因启动子区，从而阻止转录因子CEBPB的结合。本发明的实验结果表明CPEB1基因启动子区的高DNA甲基化状态可增加转录因子TFCP2的结合活性，使其启动子区不能结合CEBPB，同时证明转录因子TFCP2是一新的DNA甲基化识别因子。