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公开(公告)号:CN109682897A
公开(公告)日:2019-04-26
申请号:CN201910044583.0
申请日:2019-01-17
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种同时测定环境水样中多种内分泌干扰物的方法,属于环境检测领域。它包括:(1)取水样,自然沉淀或离心后取上清液;使用固相萃取装置将上清液经过活化后的固相萃取小柱富集,富集后将萃取柱进行离心或真空干燥;(2)使用有机溶剂洗脱萃取柱,洗脱液浓缩后使用甲醇定容制成待测液;(3)建立目标污染物的定量方法;(4)采用高效液相色谱-三重四级杆质谱测定水样中内分泌干扰物的浓度。本发明方法试剂消耗少,成本低,步骤少却能同时对水体中的多种内分泌干扰物进行定量分析,将关注的内分泌干扰物从传统的几种到十几种扩展到103种,大幅提高分析通量,拓展了应用范围,能够更好地识别环境水样中潜在高风险内分泌干扰物。
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公开(公告)号:CN105259289B
公开(公告)日:2017-05-17
申请号:CN201510733788.1
申请日:2015-11-02
Applicant: 南京大学
IPC: G01N30/88
Abstract: 本发明公开了一种三唑类杀菌剂废水中致毒手性单体的识别方法,属于农药工业废水手性单体的毒物鉴别领域。其步骤包括:废水中三唑类杀菌剂的富集浓缩,分离与定性识别,手性单体的分离,致毒手性单体的识别。本发明从农药工业废水中分离并识别三唑类杀菌剂,并且鉴别出废水中致毒的三唑类杀菌剂手性单体,有利于有针对性的指导合成工艺与水处理设施,削减农药工业废水的毒性与潜在风险,从而降低农药生产对环境和人类健康的影响。
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公开(公告)号:CN104878002A
公开(公告)日:2015-09-02
申请号:CN201510300317.1
申请日:2015-06-05
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种检测水体鸭粪污染的巢式PCR试剂盒及其检测方法,属于水体污染检测领域。一种检测水体中鸭粪污染的巢式PCR试剂盒,包括两对巢式PCR引物、dNTP、PCR buffer、Taq酶、Mg2+溶液和ddH2O,该巢式PCR方法使用两轮PCR扩增,检测方法如下:提取待测水样DNA,以其为模板进行第一轮PCR扩增,引物为SDF、SDR,反应结束后,以第一轮PCR产物为模板,进行第二轮PCR扩增,引物为NDF、NDR,反应结束后,琼脂糖凝胶电泳检测158bp条带存在表明水体收受到鸭粪污染。该方法通过巢式PCR扩增,大大增加了检测的灵敏度,可以检测到水中存在的微量鸭粪污染,并且具有良好的特异性,可直接应用于水体粪便污染检测及防治工作中。
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公开(公告)号:CN103324861A
公开(公告)日:2013-09-25
申请号:CN201310288617.3
申请日:2013-07-10
Applicant: 南京大学
IPC: G06F19/00
Abstract: 本发明公开了一种基于分子动力学模拟的核受体介导内分泌干扰物质的虚拟筛选方法,属于环境可疑内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明是将受试小分子经过优化后和实验或者同源模建获得的受体文件进行对接组成复合物,然后用GROMACS软件包进行分子动力学模拟。对受体的12号螺旋进行运动轨迹分析,空间位置的均方根偏差分析随时间的变化曲线来鉴别具有受体活性的污染物质,在规定时间内,曲线趋于稳定的可以认为对应的螺旋定位到确定的位置,于是具有生物活性。然后再通过考察定位的位置来判断拟性还是抗性。
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公开(公告)号:CN102944635A
公开(公告)日:2013-02-27
申请号:CN201210377036.2
申请日:2012-10-08
Applicant: 南京大学
IPC: G01N30/88
Abstract: 本发明提供了一种测定水中磷酸三(2,3-二溴丙基)酯含量的方法,属于有机磷酸酯阻燃剂的检测领域。主要步骤包括(1)对样品进行固相萃取;(2)将萃取柱洗脱收集;(3)将(2)得到的洗脱液浓缩定容;(4)使用高效液相色谱-三重四极杆质谱联用仪对浓缩液进行测定。本发明完善了水环境中磷酸三(2,3-二溴丙基)酯的测定方法,通过超高效液相色谱-三重四极杆质谱联用,目标化合物磷酸三(2,3-二溴丙基)酯的检测方法较其它方法具有更大的优势。本发明使用超高效液相色谱,使分离速度较气相色谱和一般的高效液相色谱更加快速,采用三重四极杆质谱进行SRM扫描,选择性更高,使定性更加准确可靠的同时也提高了灵敏度,因此相对于其它的气相方法、液相质谱方法具有明显的优势。
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公开(公告)号:CN102747155A
公开(公告)日:2012-10-24
申请号:CN201210235805.5
申请日:2012-07-09
Applicant: 南京大学
Inventor: 程树培 , 张宴 , 吴兵 , 陈亚军 , 张徐祥 , 李梅 , 崔益斌 , 李爱民 , 顾继东 , 福得 , 史薇 , 韦斯 , 刘苏 , 尹金宝 , 施鹏 , 赵福正 , 黄开龙 , 张宗尧 , 贾舒宇 , 王铸
IPC: C12Q1/68
Abstract: 毒理基因组学指数(crTGI)预警饮用水源水致癌风险的方法,步骤如下:(1)应用基因芯片,检测水源水对小鼠的涉癌毒理基因组学指数(crTGIs),指示水样中所有污染物潜在的致癌毒性;(2)以强致癌污染物苯并芘(BaP)为阳性毒性对照,将水源水涉癌毒理基因组学指数(crTGIs)数值,转化为BaP毒性的当量浓度;根据美国EPA控制BaP对人体致癌风险的标准阈值浓度,评价水源水BaP当量浓度的致癌风险度。
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公开(公告)号:CN119380859A
公开(公告)日:2025-01-28
申请号:CN202411622127.7
申请日:2024-11-14
Applicant: 南京大学
IPC: G16C20/30 , G16C20/70 , G16C10/00 , G06F18/243 , G06F18/2411 , G06F18/2413
Abstract: 本申请公开了一种内分泌干扰物定量活性的预测方法,涉及内分泌干扰物的虚拟筛查领域,包括:获取核受体体外实验数据,并剔除实验数据中的重复数据,以及剔除不包含简化分子线性输入规范SMILES表示的化合物集;采用分子指纹方法,提取化合物的一级、二级和三级特征结构。针对每一个化合物簇,构建基于机器学习或定量read‑across的定量预测模型,用于预测化合物的定量活性值;针对现有技术中内分泌干扰物定量活性预测效率低,本申请提取化合物的多级结构特征,针对不同规模的化合物结构簇构建相应的定量预测模型。通过分子对接和分子动力学模拟,从结构生物学角度研究内分泌干扰物与核受体的相互作用机制等,提高了效率。
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公开(公告)号:CN111462827B
公开(公告)日:2023-07-28
申请号:CN202010466655.3
申请日:2020-05-28
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于核受体二聚过程的雌激素干扰活性定量预测方法,属于预测毒理学领域。本发明首先获取雌激素受体的晶体结构,并确定晶体结构中配体的雌激素效应EC50值,然后对雌激素受体的晶体结构的受体蛋白和配体分子进行预处理;然后构建复合体对复合体进行分子动力学模拟,计算复合体的自由结合能;建立定量相关关系,拟合回归预测模型;最后利用所拟合的回归模型进行雌激素干扰活性预测。本发明综合考虑了受配体结合、二聚化、共因子招募过程,然后利用分子动力学方法计算复合体的结合能,并建立预测回归模型,有效地提高了雌激素干扰活性的预测准确性。
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公开(公告)号:CN110610745B
公开(公告)日:2021-12-24
申请号:CN201910904484.5
申请日:2019-09-24
Applicant: 南京大学
IPC: G16C10/00
Abstract: 本发明公开了一种基于增强采样分子动力学模拟的混合拟、抗雌激素效应的识别和预测方法,基于核受体变构和共调节因子调控机制,采用增强采样分子动力学模拟方法,通过识别局部和全局自由能最低点并进行动态轨迹聚类,提取配体化合物作用下雌激素受体α的稳态构象,并根据受体第12号螺旋稳定位置与共调节因子招募/抑制机制的关系,判断受测化合物的雌激素干扰效应,识别和预测拟性、抗性和混合拟、抗性干扰物。相比于传统体外实验方法,此方法成本低廉、效率更高,且避免了混合拟、抗性干扰物的细胞特异性问题;相比于已有的计算机辅助筛选方法,此方法能有效识别稳态构象,实现混合拟、抗雌激素干扰效应的预测。
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公开(公告)号:CN113409899A
公开(公告)日:2021-09-17
申请号:CN202110677549.4
申请日:2021-06-18
Applicant: 南京大学
Abstract: 本发明公开了一种基于作用模式的人类发育毒性预测的方法,属于化学品的人类发育毒性虚拟筛选与活性预测领域。包括构建化合物活性数据集,基于人类发育毒性作用模式,选取了有害结局路径,收集了有害结局路径信号通路上的研究事件及其活性数据;并基于所述数据集构建第一预测模型;然后利用若干种具有体内实验数据的化合物,以及利用所述第一预测模型对具有体内实验数据的化合物进行预测的预测结果,利用朴素贝叶斯算法训练得到第二预测模型;将待测化合物输入到所述第一预测模型中进行定性预测,并将定性预测结果输入所述第二预测模型,完成对化学品的人类发育毒性进行预测。本发明可以对潜在基于作用模式的人类发育毒性化学品进行高通量筛查。
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