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公开(公告)号：CN104357563A
公开(公告)日：2015-02-18
申请号：CN201410606732.5
申请日：2014-10-30
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种二次DNA片段化的基因组单倍型高通量测序方法，分两次对基因组DNA进行片段化后测序以获得单倍型信息：第一次DNA片段化将基因组DNA分割成为一系列较长的核酸片段，在较长的核酸片段中构建一组片段文库，对每个片段文库进行扩增；将扩增后的较长的核酸片段进行第二次DNA片段化，第二次DNA片段化后得到较短的核酸片段，每个片段文库独立构建测序文库并分别进行高通量测序，测序的结果首先在每个片段文库内部进行序列比对或拼接，获得较长的核酸序列后进行跨片段文库的序列比对和拼接，从而实现利用高通量测序获得基因组单倍型信息。本发明方法实现了利用高通量测序获得基因组单倍型信息，且简单、效率高。
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公开(公告)号：CN102559864A
公开(公告)日：2012-07-11
申请号：CN201110291304.4
申请日：2011-09-29
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及可进行单分子核酸扩增的颗粒、其制备方法及应用。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒，表面结合有多条单链核酸和一条双链核酸，所述双链核酸通过其中一条序列的一端与颗粒表面连接，并可作为双链接头与待测序核酸、以及末端双链接头顺序连接，然后变性形成一条单链核酸分子模板，所述单链核酸分子模板可以以颗粒表面的单链核酸作为引物进行有效PCR扩增，在颗粒表面形成多条双链测序模板，再将所述多条双链测序模板转化为多条单链测序模板后用于检测待测序核酸的信息。所述可进行单分子核酸扩增的颗粒的制备方法为：(1)使单链核酸连接到所述颗粒表面；(2)使所述每颗颗粒表面至多连接一条双链核酸。
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公开(公告)号：CN101597643A
公开(公告)日：2009-12-09
申请号：CN200910026890.2
申请日：2009-06-03
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明带背景验证的信号组合编码DNA连接测序方法涉及一种具有背景校验的信号组合编码的DNA连接测序方法，属于生物技术领域。本发明的特征在于在信号组合编码的连接测序反应中增加了背景校验，成功地对全空信号与未发生连接反应两种情况进行了分辨，提高测序的准确率，增加了信号编码测序的可靠性。本发明在组合信号编码标记物外增加一种背景标记物，利用背景标记物对连接反应是否正常发生进行验证，验证成功后通过不同编码标记物在被检测时组合信号状态进行编码，并与所测碱基的种类一一对应，进行信号编码的连接DNA测序反应，在不降低测序通量的基础上提高测序反应的准确度。
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公开(公告)号：CN101565746A
公开(公告)日：2009-10-28
申请号：CN200910026891.7
申请日：2009-06-03
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明带奇偶校验的信号组合编码的DNA连接测序方法涉及一种信号组合编码的DNA测序方法，属于生物技术领域。本发明的特征在于向信号组合编码的连接测序的编码中增加了奇偶校验，有效地对检测获得的编码结果进行奇偶校验，并成功分辨全空信号与未发生连接反应两种情况，提高测序的准确率。本发明在信号组合编码标记物外增加一种奇偶校验标记物，利用奇偶校验标记物“有信号”和“无信号”两种状态与所获得的编码标记物状态的“有信号”的标记物的种类进行奇偶校验，校验成功后通过不同编码标记物在被检测时多个标记物“有信号”、“无信号”的排列组合进行信号组合编码的连接DNA测序反应，在不降低测序通量的基础上提高测序反应的准确率。
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公开(公告)号：CN118726547A
公开(公告)日：2024-10-01
申请号：CN202410801059.4
申请日：2024-06-20
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种能够提升微量核酸扩增效率的方法，扩增所需的扩增溶液体系包括微量核酸物质和稀释溶液；扩增反应开始前，配置扩增溶液体系，将全部待扩增的微量核酸物质投入一部分稀释溶液中，形成连续相反应体系，扩增反应开始后，另一部分稀释溶液连续注入上述连续相反应体系中，持续注入的稀释溶液用于稀释扩增溶液体系，并保持整个反应体系为连续相，从而达到提升扩增效率的效果。降低体系中的核酸浓度，延长反应的高效时间。该方法通过改变除微量核酸以外其他反应组分的添加时机，提高核酸扩增反应的效率，缩短反应所用时间，适用于多种不同体积、核酸起始量的不同扩增方法，并可以依据使用情况灵活调整各阶段的体积。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118547053A
公开(公告)日：2024-08-27
申请号：CN202410801063.0
申请日：2024-06-20
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种变温多重链置换DNA扩增方法，所述方法包括采用具有链置换活性的DNA聚合酶和随机序列引物对模板DNA进行扩增，扩增过程中反应温度发生变化，变化范围不小于3℃且不超过30℃，通过对反应温度的调控，较显著地提升了全基因组扩增反应的扩增均一性。本发明的变温多重链置换DNA扩增方法，通过控制反应温度，使得在较高的温度下，GC含量大于42％的约30％高GC含量区段得以解旋与DNA聚合酶结合并扩增，而在较低温度下，DNA聚合酶对GC含量较低的区段扩增效率更高，缓解了因不同GC含量而造成的DNA聚合酶扩增效率的差异，从而使得反应的扩增偏好性较低。
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公开(公告)号：CN109307102B
公开(公告)日：2020-07-31
申请号：CN201811207202.8
申请日：2018-10-17
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明公开了一种用于微流控芯片的微阀装置及其制备方法和应用，该装置包括盖片、弹性材料层和可变形装置层，弹性材料层位于盖片和可变形装置层中间，并且弹性材料层与盖片的中间设有独立的通液流道和空腔，空腔位于通液流道的两侧，弹性材料层能够在可变形装置层的挤压或者牵拉下进行弹性形变，从而控制通液流道的闭合和开启。本发明中的微阀结构易于制作，极大地降低了微流控芯片中阀结构的制作难度；同时该结构可以通过调整输入信号实时准确地改变阀的开合状态，从而精确控制微流控芯片中的流体运动。
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公开(公告)号：CN109762728A
公开(公告)日：2019-05-17
申请号：CN201910013293.X
申请日：2019-01-07
Applicant: 东南大学
Abstract: 本发明提供了一种空间转录组测序芯片及方法,该芯片及方法用于测定组织内不同空间位置中的一种或多种单细胞序列；包括微孔板以及编码测序微球，微孔板上设有编码测序微球；所述方法包括使用多种随机编码与微球偶联,其中每一种随机编码包括分子标记和位置标记条形码；分子标记可以检测组织单细胞的序列信息，位置标记用来记录组织的单细胞空间位置信息；基于该检测芯片及方法可以分析检测组织单细胞特异性转录组信息,并且可同时检测出上述组织中成千上万单细胞的空间位置。
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公开(公告)号：CN109439734A
公开(公告)日：2019-03-08
申请号：CN201811207218.9
申请日：2018-10-17
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种基于琼脂糖凝胶介质的全基因组扩增方法，包括将多重链置换扩增反应体系置于琼脂糖凝胶中，在凝胶的网格状结构中，完成对目标基因组的全基因组扩增。凝胶状态的琼脂糖形成网格状结构，将多重链置换扩增反应体系相对分隔于微小的反应空间中，各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少，因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应，目标核酸各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时，基于琼脂糖凝胶介质的多重链置换扩增，不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔，并且在系统调试和扩增反应的过程中，不需要对微量液体进行精密和复杂的控制，简化了反应系统，降低了操作复杂度。
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公开(公告)号：CN109439733A
公开(公告)日：2019-03-08
申请号：CN201811207205.1
申请日：2018-10-17
Applicant: 东南大学
IPC: C12Q1/6844
Abstract: 本发明公开了一种基于细长反应腔的RNA转录组分析方法，包括将RNA反转录扩增反应体系注入细长型的反应腔中，完成对目标RNA转录组的捕获和放大。细长形的反应腔体将RNA反转录反应体系相对分隔于一个细长的反应腔中，各微观反应单元之间的物质交换和相互影响大为减少，因此各微观反应单元以一个相对独立的状态发生反应，目标RNA各个片段之间的扩增一致性得到很大提升。同时，基于细长反应腔的RNA转录组分析，不需要预先制备微液滴发生装置或复杂反应微腔，并且在系统调试和扩增反应的过程中，不需要对微量液体进行精密和复杂的控制，简化了反应系统，降低了操作复杂度。
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