公开(公告)号：CN110791554A

公开(公告)日：2020-02-14

申请号：CN201911082549.9

申请日：2019-11-07

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 唐嘉婕 ,  李文涛 ,  徐辉 ,  杨敬敏

IPC: C12Q1/6851

Abstract: 本发明提供一种微量DNA的定量方法，至少包括以下步骤：设计内标模板；设计能够同时扩增目标模板和内标模板的引物对；利用所述引物对，将待测DNA序列和内标模板混合后进行PCR扩增；将扩增产物用二代测序平台对应的接头引物对进行再次扩增，获得二代测序文库；对所述二代测序文库进行二代测序平台测序；根据公式待测DNA的拷贝数=C*A1/A2，计算得目标模板的拷贝数，即为待测DNA的拷贝数；其中，C为内标模板的拷贝数；A1为目标模板序列的测序覆盖深度；A2为内标模板序列的测序覆盖深度。本发明不仅可以准确定量微量DNA，还可以直接读取目标DNA模板的序列，定量结果准确性不受非特异性扩增的影响。

公开(公告)号：CN114507707B

公开(公告)日：2024-05-31

申请号：CN202011276075.4

申请日：2020-11-16

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 覃振东 ,  徐辉 ,  杨敬敏 ,  唐嘉婕 ,  徐张蓝 ,  高鹏飞 ,  卢大儒

IPC: C12Q1/6806 ,  C12Q1/6888

Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域，特别是涉及一种富集目标区域再酶切构建单倍型的方法，所述方法包括以下步骤：1)富集目标核酸区域；2)设计仅能与目标核酸区域中的一个单倍体结合的向导序列，利用向导序列以及限制性核酸内切酶酶切步骤1)富集的目标核酸区域，分别回收酶切片段和/或未被酶切的片段；3)利用步骤2)回收的酶切片段和/或未被酶切的片段分别制备测序文库并测序，数据分析分别得到酶切片段和/或未被酶切的片段的核酸序列的SNP信息，即为目标核酸区域的单倍型信息。本发明的方法可以靶向基因组上一个较小区域且实验操作简便、成本低。

公开(公告)号：CN112195238B

公开(公告)日：2023-01-13

申请号：CN202011294989.3

申请日：2020-11-18

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司(CN)

Inventor： 杨敬敏 ,  朱学萍 ,  王彬 ,  唐嘉婕 ,  高鹏飞 ,  林健

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及遗传病基因检测领域，特别是涉及一种用于扩增PKD1基因的PCR引物组，所述PCR引物组包括第一引物对、第二引物对、第三引物对或第四引物对中的一对或几对。本发明的引物组延长了覆盖1号外显子的扩增子长度，成功实现对1号外显子区域的稳定扩增，扩增产物覆盖了PKD1全部外显子区域，及大部分内含子区域；特异性地获得PKD1基因序列，完全扩增不到PKD1的假基因序列；在完全排除假基因干扰的情况下，更加准确地检测PKD1基因的变异，包括已知变异和未知变异。

公开(公告)号：CN114645075A

公开(公告)日：2022-06-21

申请号：CN202011496518.0

申请日：2020-12-17

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 覃振东 ,  林健 ,  朱学萍 ,  唐嘉婕 ,  杨敬敏 ,  高鹏飞

IPC: C12Q1/6827

Abstract: 本发明涉及遗传病基因检测领域，特别是涉及一种真基因变异的检测方法，所述方法包括如下步骤：设计仅能与目的核酸区域的假基因序列结合的酶切探针，利用酶切探针和限制性核酸内切酶酶切目的核酸区域的假基因，回收酶切后产物；扩增回收的产物即为真基因序列，构建测序文库并测序，数据分析得到真基因的变异位点。本发明的检测方法通过酶切探针和内切酶的作用，将干扰序列进行切除，减少或完全消除假基因的干扰，保留所需的DNA序列，提高检测结果的可信度。

公开(公告)号：CN112195238A

公开(公告)日：2021-01-08

申请号：CN202011294989.3

申请日：2020-11-18

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 杨敬敏 ,  朱学萍 ,  王彬 ,  唐嘉婕 ,  高鹏飞 ,  林健

IPC: C12Q1/6883 ,  C12Q1/6869 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明涉及遗传病基因检测领域，特别是涉及一种用于扩增PKD1基因的PCR引物组，所述PCR引物组包括第一引物对、第二引物对、第三引物对或第四引物对中的一对或几对。本发明的引物组延长了覆盖1号外显子的扩增子长度，成功实现对1号外显子区域的稳定扩增，扩增产物覆盖了PKD1全部外显子区域，及大部分内含子区域；特异性地获得PKD1基因序列，完全扩增不到PKD1的假基因序列；在完全排除假基因干扰的情况下，更加准确地检测PKD1基因的变异，包括已知变异和未知变异。

公开(公告)号：CN111690988A

公开(公告)日：2020-09-22

申请号：CN202010573877.5

申请日：2020-06-22

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 覃振东 ,  王梁辉 ,  杨敬敏 ,  高鹏飞 ,  唐嘉婕

IPC: C40B50/06 ,  C12Q1/6806 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明提供一种捕获文库构建方法，至少包括以下步骤：1）将片段化的DNA与接头连接，获得预文库；2）利用扩增引物对预文库进行扩增，获得富集文库；所述扩增引物包括上游引物和下游引物，所述上游引物或下游引物的一端设有修饰基团；或者，所述上游引物和下游引物的一端同时设有不同的修饰基团；所述富集文库中包括双链DNA；3）使用核酸酶消化所述富集文库，使得所述富集文库中的双链DNA的一条单链被消化；4）在不存在接头封闭序列或存在低于正常工作体积的接头封闭序列的情况下，将步骤3）获得的产物与杂交探针进行杂交捕获，获得捕获文库。本发明可以在不加或减少封闭序列的前提下，保持较好的捕获效率，显著降低测序成本。

公开(公告)号：CN110938681A

公开(公告)日：2020-03-31

申请号：CN201911378483.8

申请日：2019-12-27

Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司

Inventor： 杨敬敏 ,  徐辉 ,  卢大儒 ,  王梁辉 ,  唐嘉婕

IPC: C12Q1/6858 ,  C12N15/11

Abstract: 本发明提供一种富集核酸延伸产物的方法，包括a.对样品中包含一组或多组等位基因对的核酸进行富集，所述富集的产物至少5kb，优选至少8kb，更优选至少10kb，并且富集的产物包含至少一组等位基因对；b.在探针与核酸杂交的条件下将探针与含有核酸的样品接触，所述探针包括分别靶向所述至少一组等位基因对中任一组的两条等位基因的至少两种探针，并且靶向其中一条等位基因的探针的延伸受到抑制，c.延伸探针，和d.富集延伸产物。