一种梭杆菌遗传型的检测分型方法

    公开(公告)号:CN119162350A

    公开(公告)日:2024-12-20

    申请号:CN202310893821.1

    申请日:2023-07-20

    Abstract: 本发明提供了一组L1和L5遗传型梭杆菌特异性DNA序列,并设计了相应的检测引物以应用于L1/L5遗传型梭杆菌的检测分型,上述检测分型方法是一种直观并精确的用来测定L1/L5遗传分型的梭杆菌的方法,其可实现对L1和L5型梭杆菌直接快速的定性和定量检测,操作简单、耗时短,适用于单一菌株样本或含混合菌体样本,可根据PCR和定量PCR结果直接进行判读,不需要额外的测序和数据分析工作,在目前所测试的菌株中准确度可达到100%,上述L1/L5遗传型可能在结直肠癌(CRC)中发挥不同的致病作用,精确的检测鉴定对于了解其致病机制具有深远意义,并具有潜在的临床应用价值。

    一株从大肠癌肿瘤组织中获取的具核梭杆菌及其应用

    公开(公告)号:CN110903997B

    公开(公告)日:2021-11-23

    申请号:CN201911013460.7

    申请日:2019-10-23

    Abstract: 本发明提供了一株从大肠癌肿瘤组织中获取的不属于已知的具核梭杆菌亚种的具核梭杆菌THCT14E2,该菌株的16SrRNA基因序列具体如SEQ ID NO:1所示。THCT14E2的分类命名为Fusobacterium nucleatum,其保藏编号为CCTCC NO:M 2019361,保藏日期为2019年05月17日,保藏单位为中国典型培养物保藏中心。结直肠癌细胞系与THCT14E2共培养的结果说明THCT14E2可显著促进结直肠癌细胞增殖,因此,THCT14E2可促进了解结直肠癌微生态的多样性,将有助于结直肠癌来源的具核梭杆菌的功能研究。

    一种用于肌层浸润性膀胱癌生存预后预测的生物标记物及其应用

    公开(公告)号:CN109884301A

    公开(公告)日:2019-06-14

    申请号:CN201910143394.9

    申请日:2019-02-26

    Inventor: 蔚青 毕德玺

    Abstract: 本发明涉及一种用于肌层浸润性膀胱癌诊断和/或生存预后预测的生物标记物及其应用,所述生物标记物选自GAS6、PDGFC、DDR2、PDGFRA、FN1、PPARG中的至少一种,更优选为双基因生物标记物GAS6/PPARG、PDGFC/PPARG、DDR2/PPARG、PDGFRA/PPARG和FN1/PPARG中的至少一种。上述生物标记物在肿瘤组织中的表达特征均具有预测肌层浸润性膀胱癌生存预后的价值。GAS6、PDGFC、DDR2、PDGFRA和FN1在肿瘤中的表达与PPARG的表达均呈负相关,它们与PPARG的表达比值可作为分别作为独立的预后指标。本发明提供的双基因分子特征方法简单,容易实施;采用的指标为两种标志物的表达比值,样本间可直接比较,无需标准化处理。

    具核梭杆菌特异性DNA序列及其应用和检测方法

    公开(公告)号:CN118006815A

    公开(公告)日:2024-05-10

    申请号:CN202410244034.9

    申请日:2024-03-04

    Abstract: 本发明提供了一段具核梭杆菌特异性DNA序列,其具体序列如SEQ ID No.1所示或为与SEQ ID NO.1所示序列具有85‑99%相似性的同源序列;在上述特异性DNA序列的基础上,设计了用于检测的引物组合物,其包括如SEQ ID No.2~如SEQ ID No.5所示。上述具核梭杆菌的特异性DNA序列及其设计的引物可实现对具核梭杆菌直接快速的定性和定量检测,其检测方法适用于单一菌株样本或含混合菌体样本,且检测准确度远高于现有技术。

    一种用于肌层浸润性膀胱癌生存预后预测的生物标记物及其应用

    公开(公告)号:CN109884301B

    公开(公告)日:2023-03-31

    申请号:CN201910143394.9

    申请日:2019-02-26

    Inventor: 蔚青 毕德玺

    Abstract: 本发明涉及一种用于肌层浸润性膀胱癌诊断和/或生存预后预测的生物标记物及其应用,所述生物标记物选自GAS6、PDGFC、DDR2、PDGFRA、FN1、PPARG中的至少一种,更优选为双基因生物标记物GAS6/PPARG、PDGFC/PPARG、DDR2/PPARG、PDGFRA/PPARG和FN1/PPARG中的至少一种。上述生物标记物在肿瘤组织中的表达特征均具有预测肌层浸润性膀胱癌生存预后的价值。GAS6、PDGFC、DDR2、PDGFRA和FN1在肿瘤中的表达与PPARG的表达均呈负相关,它们与PPARG的表达比值可作为分别作为独立的预后指标。本发明提供的双基因分子特征方法简单,容易实施;采用的指标为两种标志物的表达比值,样本间可直接比较,无需标准化处理。

    一株人类肠道分离的具核梭杆菌动物亚种菌株及其应用

    公开(公告)号:CN110903999B

    公开(公告)日:2021-11-23

    申请号:CN201911013475.3

    申请日:2019-10-23

    Abstract: 本发明提供一株肠道分离的具核梭杆菌动物亚种菌株THCT6b3,该菌株的16SrRNA基因序列具体如SEQ ID NO:1所示。该菌株分类命名为Fusobacterium nucleatum subsp.animalis,其保藏编号为CCTCC NO:M 2019367,保藏日期为2019年05月17日,保藏单位为中国典型培养物保藏中心。本发明还提供了该菌株在肠道具核梭杆菌检测中的应用,首次建立基于PCR的具核梭杆菌动物亚种分子鉴定方法。本发明可促进揭示结直肠癌患者中肠道具核梭杆菌的构成及来源,并将有助于分析具核梭杆菌的分子流行病学特征。

    一株肠道分离的具核梭杆菌文氏亚种菌株及其应用

    公开(公告)号:CN110903998B

    公开(公告)日:2021-09-21

    申请号:CN201911013474.9

    申请日:2019-10-23

    Abstract: 本发明提供了一株肠道分离的具核梭杆菌文氏亚种菌株THCT14A3,分类命名为Fusobacterium nucleatum subsp.vincentii,保藏编号为CCTCC NO:M 2019363,保藏日期为2019年05月17日,保藏单位为中国典型培养物保藏中心。该菌株的16SrRNA基因序列具体如SEQ ID NO:1所示。本发明还提供了一段可用于鉴定具核梭杆菌文氏亚种的特异性DNA序列及其对应的引物序列。结直肠癌细胞系与THCT14A3共培养的结果显示THCT14A3可显著促进结直肠癌细胞增殖。因此,本发明提供的THCT14A3将有助于结直肠癌肠道的微生态研究。

Patent Agency Ranking