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公开(公告)号:CN103014145A
公开(公告)日:2013-04-03
申请号:CN201210362900.1
申请日:2010-10-12
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明涉及一种纳米颗粒在DNA折纸芯片上的可控分布方法,其包括如下步骤:第一步,利用DNA折纸术构造一个非对称二维图形,制备DNA折纸芯片;第二步,制备胶体金探针;第三步,DNA短链与胶体金探针杂交;第四步,粒径胶体金探针与非对称二维图形DNA折纸芯片连接;第五步,原子力显微镜成像;所述的非对称二维图形,在特定位置附近伸出三条订书钉链末端修饰寡核苷酸捕获探针,让它们与同一个末端修饰5nm粒径胶体金颗粒的报告探针链三对一杂交;本发明在极微量生化检测芯片研制,纳米器件开发,纳米粒子基本性质研究等学科领域具有广泛的应用空间。
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公开(公告)号:CN102533974A
公开(公告)日:2012-07-04
申请号:CN201110410181.1
申请日:2011-12-09
Applicant: 上海交通大学 , 复旦大学附属妇产科医院
Abstract: 本发明涉及一种检测22q11微缺失综合征的基因芯片及使用方法、试剂盒,所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1-50所示的核苷酸序列;所述使用方法包括如下步骤:(a)制备样品DNA片段;(b)荧光标记上述DNA片段;(c)洗脱上述标记产物;(d)将标记产物与所述基因芯片杂交;(e)扫描检测基因芯片的杂交信号,获得结果;本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单,检测特异性高,稳定性好,从样本抽提到得到扫描结果可在一个工作日内完成,成本低,适用于临床患者基因突变检测、产前诊断和正常人杂合子携带者检测。
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公开(公告)号:CN102533973A
公开(公告)日:2012-07-04
申请号:CN201110410049.0
申请日:2011-12-09
Applicant: 上海交通大学 , 复旦大学附属妇产科医院
Abstract: 本发明涉及一种检测X连锁鱼鳞病的基因芯片及使用方法、试剂盒,所述基因芯片包括固相载体和固定在该固相载体上的探针,所述寡核苷酸探针为SEQ ID NO.1-50所示的核苷酸序列;所述使用方法包括如下步骤:(a)制备样品DNA片段;(b)荧光标记上述DNA片段;(c)洗脱上述标记产物;(d)将标记产物与所述基因芯片杂交;(e)扫描检测基因芯片的杂交信号,获得结果;本发明还涉及包含前述基因芯片的试剂盒。本发明的基因芯片操作步骤简单,检测特异性高,稳定性好,从样本抽提到得到扫描结果可在一个工作日内完成,成本低,适用于临床患者基因突变检测、产前诊断和正常人杂合子携带者检测。
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公开(公告)号:CN102146479A
公开(公告)日:2011-08-10
申请号:CN201110095716.0
申请日:2011-04-15
Applicant: 上海交通大学 , 上海佰真生物科技有限公司
Abstract: 一种分子生物技术领域的用于精神分裂症、双相情感障碍和重性抑郁症关联基因检测的试剂盒,由PCR试剂组和连接酶检测反应试剂组构成,PCR试剂组包括:缓冲液、dNTP混合液、Taq DNA聚合酶、纯水和如SEQ ID No.1所示的上游引物和如SEQ ID No.2所示的下游引物;LDR试剂组包括:缓冲液、dNTP混合液、Taq DNA连接酶、纯水和如SEQ ID No.3所示的探针、如SEQ ID No.4所示的探针以及如SEQ ID No.5所示的探针。本发明操作简便,成本低廉,针对双相情感障碍而开发。结果可靠,稳定性好,灵敏度高。
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公开(公告)号:CN101985659A
公开(公告)日:2011-03-16
申请号:CN201010543122.7
申请日:2010-11-13
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种分子生物技术领域的检测精神分裂关联基因的试剂盒及其制备方法。试剂盒PCR试剂组和LDR试剂组,其中:PCR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA聚合酶,纯水,四对PCR专用扩增引物;LDR试剂组包括:缓冲液,dNTP混合液,Taq DNA连接酶,纯水,四组LDR专用探针。制备方法包括:PCR引物的设计及合成:PCR引物采用引物设计软件PRIMER3进行引物设计,TM值选择60度左右;LDR探针的设计及合成:LDR探针每个位点包括三条,两条5’端探针和一条3’端探针;Taq DNA聚合酶和Taq DNA连接酶采用TAKARA的产品或New England Biolabs的产品。本发明可以实现对精神分裂关联基因内特定SNP位点的快速、高效、准确的分型。
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公开(公告)号:CN101434994A
公开(公告)日:2009-05-20
申请号:CN200810207776.5
申请日:2008-12-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 一种基因工程技术领域的CYP2C9基因第九号外显子单核苷酸多态性的检测方法。方法包括:步骤一,以GenBank数据库中CYP2C9基因第九号外显子以及外显子与内含子接合部位序列为模板设计一对等位基因特异性的核酸引物,利用引物对来扩增CYP2C9基因的第九号外显子的DNA序列,对扩增产物进行分离纯化,得到相应分离核酸;步骤二,对分离核酸的CYP2C9基因第九号外显子的第1739-1740位核苷酸进行检测,确定其是否存在单核苷酸多态性。本发明可用于研究我国人群中CYP2C9基因多态性与临床用药安全的关系,为新药研发提供了指导依据。
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公开(公告)号:CN1182245C
公开(公告)日:2004-12-29
申请号:CN01126148.X
申请日:2001-07-13
Applicant: 上海交通大学 , 中国科学院上海生命科学研究院
Abstract: 一种短指和身高相关基因,属于生物技术的基因领域。其核酸序列如SEQ IDNO.3所示。它具有SEQ ID NO.4所示的氨基酸序列。本发明为A-1型短指发病和身高发育的分子遗传的相互关系提供了基因关系的依据,本发明将有力地推动人类骨骼发育异常病理机制研究的进一步发展,加深了人类在分子水平上对骨骼发育的认识,并为今后相应的基因诊断、药物设计和临床治疗提供了基因学的根据。
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公开(公告)号:CN116356008A
公开(公告)日:2023-06-30
申请号:CN202111631410.2
申请日:2021-12-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , G01N33/68 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种先天性心脏病相关SETD2基因新发变异位点及其应用;所述基因核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述新发变异位点位于第43529位,chr3:47120450为T→A和第79848位,rs769925323为T→C。本发明涉及一种检测前述核苷酸变异的方法,包括如下步骤:步骤一,收集三口家系样品,并对前述序列潜在新发变异位点进行分型;步骤二,采用Sanger测序方法,分析位于第43529和79848位的遗传变异情况。本发明为研究SETD2基因新发变异与先天性心脏病的关系奠定了基础,为预测罹患先天性心脏病风险提供分子靶标,同时也为基于该基因的先天性心脏病早期筛查提供理论依据。
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公开(公告)号:CN111909997A
公开(公告)日:2020-11-10
申请号:CN202010942097.3
申请日:2020-09-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6851
Abstract: 本发明提供了一种miRNA标志物在制备奥氮平治疗精神分裂症疗效评估方面的产品中的应用及试剂盒,miRNA标志物为miR-143-3p,miR-143-3p表达量的检测方法:血清样本的处理,采血、离心、保存备用;总RNA的提取;使用超微量分光光度计检测RNA的总量;进行反转录获得cDNA,将得到的cDNA进行荧光定量检测;采用相对定量法对检测结果进行分析。本发明首次发现了miR-143-3p在奥氮平治疗精神分裂症疗效中差异表达,通过检测miR-143-3p的表达水平可以判断患者对奥氮平治疗精神分裂症疗效的高低,可作为检测或治疗指标应用于临床,为精神分裂症的机理研究以及临床应用提供理论基础。
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