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公开(公告)号：CN105535013A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201610082951.7
申请日：2016-02-05
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/715 , A61K36/896 , A61K36/90 , C08B37/00 , A61P35/00
CPC classification number: A61K36/90 , A61K31/715 , A61K36/896 , A61K2236/331 , A61K2236/51 , A61K2236/53 , A61K2236/55 , C08B37/006
Abstract: 本发明公开了龙须菜多糖在制备用于诱导细胞中的FADD和GADD基因的表达的制剂中的应用。该龙须菜多糖制剂可以明显诱导肿瘤细胞的凋亡，对人胃癌、肺癌和小鼠黑色素瘤细胞都有诱导凋亡的作用。具体地，该龙须菜多糖制剂可以是凋亡诱导剂。本发明的龙须菜多糖制剂，在抗肿瘤药物或防癌保健品的制备中具有应用前景，也为治疗或预防肿瘤的药物开发提供了新的选择。
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公开(公告)号：CN103911449A
公开(公告)日：2014-07-09
申请号：CN201410138517.7
申请日：2014-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6869 , C12Q2563/143 , C12Q2525/173 , C12Q2525/131
Abstract: 本发明涉及一种检测RNA？PAS（Poly？A？Site）的方法，提供了一种基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法，包括含有oligo？dT的磁珠制备，即将5'端生物素修饰的oligo？dT引物与带链霉亲和素的磁珠混合结合；用所述磁珠与总RNA混合，筛选含有Poly？A的RNA；逆转录，双链cDNA第二链合成，双链cDNA断裂；移除Poly？A结构；末端修饰后连接测序接头；文库回收。该方法减少了RNA水平操作，在DNA水平移除Poly？A序列，消除Poly结构对测序的影响；选择双链DNA断裂酶处理，在不影响文库质量的基础上在DNA水平断裂；简化实验流程，降低实验难度和造价，使其应用范围更广。
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公开(公告)号：CN110144345B
公开(公告)日：2022-07-15
申请号：CN201910390311.6
申请日：2019-05-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种从卵泡液中提取cfDNA的方法，通过对卵泡液样本两步离心去除多余细胞碎片；利用裂解液对卵泡液进行裂解，加入的蛋白酶K消化多余的蛋白，同时加入的Carrier RNA使DNA更易析出沉降；利用羧基磁珠对DNA的吸附作用；在高盐低pH的条件下，将卵泡液中的cfDNA吸附到磁珠上，经过盐洗涤和醇洗涤后，去除100bp以下的片段，洗脱后再次加入0.5倍体积的羧基磁珠，吸附并去除大于300bp的长片段，获得合适长度范围的cfDNA。同时对所获的cfDNA进行末端修复，产生平末端连接，并在3’末端添加碱基A，并在cfDNA两端添加接头并扩增纯化等，完成高通量文库的构建，最终完成上机测序。
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公开(公告)号：CN113151462A
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202110254925.9
申请日：2021-03-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种用于诊断肺癌预后的生物标志物，其包括hsa‑miR‑21‑5p，hsa‑miR‑141‑5p和hsa‑miR‑490‑3p。本发明通过对肺癌相关miRNA筛选、靶基因的预测和功能分析，进行了预后模型的构建和风险因子评估，通过肺癌组织及癌旁组织检测验证，筛选出的三种新的miRNA标志物，并完成了肺癌预后模型的构建和临床样品验证，hsa‑miR‑21‑5p，hsa‑miR‑141‑5p，hsa‑miR‑490‑3p作为肺癌预后诊断标志物的应用及其检测试剂盒，可用于准确预后、个性化治疗以及疾病监测等。
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公开(公告)号：CN110656178A
公开(公告)日：2020-01-07
申请号：CN201911029436.2
申请日：2019-10-28
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种胃癌预后诊断标志物TREM1在胃癌预后检测及评估中的应用，涉及生物医学领域，所述应用是通过检测所述标志物TREM1的相对表达水平来评估胃癌患者预后情况。本发明还公开了包括所述标志物TREM1的引物与内参的检测试剂盒。本发明提供的胃癌预后诊断标志物TERM1具有高特异性和敏感性，可通过快速、简便的方法检测其相对表达量、进而对胃癌患者的预后进行准确的判断和评估，从分子水平实现对胃癌危险等级的分级分层，迅速、准确地预测胃癌预后，对不同预后程度的患者进行分类治疗，从而指导胃癌病人的个体化精准治疗，节约医疗成本，具有极高的临床应用价值。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110144345A
公开(公告)日：2019-08-20
申请号：CN201910390311.6
申请日：2019-05-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12N15/10
Abstract: 本发明公开了一种从卵泡液中提取cfDNA的方法，通过对卵泡液样本两步离心去除多余细胞碎片；利用裂解液对卵泡液进行裂解，加入的蛋白酶K消化多余的蛋白，同时加入的Carrier RNA使DNA更易析出沉降；利用羧基磁珠对DNA的吸附作用；在高盐低pH的条件下，将卵泡液中的cfDNA吸附到磁珠上，经过盐洗涤和醇洗涤后，去除100bp以下的片段，洗脱后再次加入0.5倍体积的羧基磁珠，吸附并去除大于300bp的长片段，获得合适长度范围的cfDNA。同时对所获的cfDNA进行末端修复，产生平末端连接，并在3’末端添加碱基A，并在cfDNA两端添加接头并扩增纯化等，完成高通量文库的构建，最终完成上机测序。
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公开(公告)号：CN108796039A
公开(公告)日：2018-11-13
申请号：CN201810697732.9
申请日：2018-06-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6806
CPC classification number: C12Q1/6806 , C12Q2563/131
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA甲基化检测的试剂盒，其至少包括生物素标记的甲基化的λ‑DNA和链霉素包被的磁珠。还公开了该试剂盒在少量DNA样品甲基化检测中的应用，样品量可低至1ng。本发明还公开了一种DNA甲基化检测的方法及其应用。本发明提供的技术方案显著降低了DNA甲基化检测所需的最低起始样品量，且不需要特定的试剂盒和实验设备，节省成本，具有较高的普适性。在富集甲基化DNA的同时不引入外源DNA污染，若采取文库构建和高通量测序的检测方法时不会受到外源DNA信息的影响，有利于进一步降低测序成本，提高数据质量。
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公开(公告)号：CN105542024A
公开(公告)日：2016-05-04
申请号：CN201610006118.4
申请日：2016-01-06
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: C08B37/00 , A61K36/04 , A61K2236/331 , A61K2236/51 , A61K2236/53
Abstract: 本发明公开了一种来自红藻类植物龙须菜的海洋中药龙须菜多糖，还首次揭示了其作为抗肿瘤药物，尤其是顺铂的增效剂的增效作用，可作为抗肿瘤药物的增效剂。还公开了该龙须菜多糖在制备治疗肿瘤的药物、保健品或食品中的应用，其主要通过抑制肿瘤细胞的生长和增殖达到抗肿瘤作用。对胃腺癌、肺癌和子宫颈癌都有抗肿瘤作用。本发明还公开了龙须菜多糖的制备方法，及其抗肿瘤作用的检测方法。本发明为龙须菜作为海洋药物资源的进一步利用提供了新的途径，本发明的龙须菜多糖在制备抗肿瘤药物、防癌保健品或食品中的用途，也为治疗或预防肿瘤的药物开发提供了新的选择。
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公开(公告)号：CN116083531A
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202310082830.2
申请日：2023-01-18
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种精准分析单细胞APA位点的sc3T‑seq方法，涉及分子生物学和生物信息学领域，oligo(dT)20引物与链霉亲和素的磁珠孵育结合，加入少量起始样本和外源单链DNA，双链cDNA合成，双链cDNA断裂，移除polyA，释放带标签的cDNA，加入具有生物素标记的λ‑DNA，加入羧基磁珠，筛选去除外源cDNA，末端修复、加接头、构建cDNA文库，链霉素亲和磁珠去除生物素标记λDNA，得到纯净的样本文库。本发明降低了起始样品量，使分析APA位点的实验技术能够适用于少量样本甚至单个细胞，对于精准检测、分析细胞特异性的APA有很大的作用。
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公开(公告)号：CN115651973A
公开(公告)日：2023-01-31
申请号：CN202211093343.8
申请日：2022-09-08
Applicant: 苏州京脉生物科技有限公司 , 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , G16B40/00 , G16B30/00
Abstract: 本申请提供一种可传代细胞的高保真甲基化位点的分离与分析方法，包括步骤：(A)将可传代细胞进行传代培养多代后，取不同代数的细胞进行基因组DNA提取，作为实验样本；(B)将spike‑in加入实验样本中，进行重亚硫酸盐转化，构建简并代表性重亚硫酸盐测序文库，并进行测序；所述spike‑in为甲基化和未甲基化的lambda DNA；(C)对于测序数据，根据spike‑in计算转化效率和错误转化率最终对甲基化水平的评估产生偏差，并且对每个位点的DNA甲基化水平采用二项分布近似贝叶斯模型进行定量检测，通过比较不同代别的甲基化水平得到高保真甲基化位点。
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