公开(公告)号：CN114611314A

公开(公告)日：2022-06-10

申请号：CN202210277805.5

申请日：2022-03-21

Applicant: 福州大学

Inventor： 李明林 ,  李佳宇

IPC: G06F30/20 ,  G06F111/14 ,  G06F119/14

Abstract: 本发明提出一种调控酪氨酸二肽自组装结构的模拟方法，包括以下步骤；步骤S1、绘制单个酪氨酸二肽分子自组装结构的坐标文件并进行结构优化；步骤S2、以步骤S1的分子结构为基本单元，配置不同环境的自组装参数，获得可设置动力学平衡参数的体系；步骤S3、以步骤S2获得的体系为对象，设置动力学平衡参数，进行能量最小化和NVT、NPT弛豫；步骤S4、对步骤S3得到的弛豫结构进行分子动力学模拟；步骤S5、归纳整合自组装结构，分析处理相应数据，得到适宜酪氨酸二肽自组装的参数条件及其纳米结构；本发明能确定最适宜酪氨酸二肽自组装的密度和温度，并获得相应的零维或一维结构，对于酪氨酸二肽纳米结构的实验制备有重要的指导意义。

公开(公告)号：CN114611314B

公开(公告)日：2024-06-21

申请号：CN202210277805.5

申请日：2022-03-21

Applicant: 福州大学

Inventor： 李明林 ,  李佳宇

IPC: G06F30/20 ,  G06F111/14 ,  G06F119/14

Abstract: 本发明提出一种调控酪氨酸二肽自组装结构的模拟方法，包括以下步骤；步骤S1、绘制单个酪氨酸二肽分子自组装结构的坐标文件并进行结构优化；步骤S2、以步骤S1的分子结构为基本单元，配置不同环境的自组装参数，获得可设置动力学平衡参数的体系；步骤S3、以步骤S2获得的体系为对象，设置动力学平衡参数，进行能量最小化和NVT、NPT弛豫；步骤S4、对步骤S3得到的弛豫结构进行分子动力学模拟；步骤S5、归纳整合自组装结构，分析处理相应数据，得到适宜酪氨酸二肽自组装的参数条件及其纳米结构；本发明能确定最适宜酪氨酸二肽自组装的密度和温度，并获得相应的零维或一维结构，对于酪氨酸二肽纳米结构的实验制备有重要的指导意义。