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公开(公告)号：CN118186137A
公开(公告)日：2024-06-14
申请号：CN202410489590.2
申请日：2024-04-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定菊花光反应周期长短的KASP标记组合、其开发方法及应用。本发明通过基于全基因重测序的BSA‑seq技术快速定位到与光反应周期相关的变异位点，将筛选到的SNP关联位点转化成KASP标记；本发明开发的SNP位点Chr9_205233550和Chr10_20239079，可单独或组合使用，该标记组鉴定菊花品种光反应周期长短的准确率能达到82.67％。该KASP标记组可以实现菊花光反应周期的早期鉴定，无需通过漫长繁琐的田间表型调查，即避免了人工主观判断带来的误差及人力物力的浪费，又大大地提高了选择效率。本发明的鉴定方法，可在菊花生长早期快速、准确地对光反应周期进行判断，有利于亲本的选配及后代优异株系的筛选，为菊花光反应周期MAS育种体系的建立奠定基础，对菊花光反应周期研究及其周年生产具有重要意义。
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公开(公告)号：CN117576595A
公开(公告)日：2024-02-20
申请号：CN202311664543.9
申请日：2023-12-06
Applicant: 南京农业大学
IPC: G06V20/17 , G06V10/422 , G06V10/42 , G06V10/764
Abstract: 本发明属于花卉品种资源研究及筛选领域，具体公布了一种高效评估园林小菊冠丛圆整度的方法；所述方法为：在园林小菊现蕾后，使用无人机航拍园林小菊获取群体影像，在拼接好的正射图像中描绘园林小菊单株冠层轮廓，根据冠层轮廓计算5项轮廓形状指标，根据这5项形状指标评估园林小菊冠丛圆整度。本发明为评估园林小菊冠丛圆整度提供了一种基于无人机图像的，高效准确的评估方法，相较于人工田间评价更为客观。本发明的方法以无人机图像为基础，效率高，可应用于不同品种园林小菊的圆整度评估，通用性强。
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公开(公告)号：CN111394800B
公开(公告)日：2022-04-08
申请号：CN202010175583.7
申请日：2020-03-13
Applicant: 南京农业大学
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种新的评估由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的方法，该方法能够体现文库中插入基因数量、基因丰度等关键性指标，解决了传统的由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量评估方法的片面性，适合一般的实验室进行准确的文库评估。该方法通过文库15轮循环数的PCR扩增、产物回收之后的浓度测定和电泳情况初步判断，之后将回收产物进行高通量测序、de novo组装后详细分析，获得文库的插入基因数量、基因丰度等关键性指标，完成由无参考基因组物种构建的酵母双杂交文库质量的准确评估。同时，还能获得无参考基因组物种基因的序列信息，为下一步互作蛋白编码基因的克隆提供基础。
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公开(公告)号：CN104313150B
公开(公告)日：2016-09-07
申请号：CN201410568698.7
申请日：2014-10-22
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域，提供菊花抗蚜性关联分子标记、分子标记引物、分子标记筛选方法及上述三者在菊花新品种培育上的应用。菊花抗蚜性关联分子标记包括主效QTL位点NoaE2G1、NoaE2G7、NoaE1H3、NoaE2H7、NoaE2H8的分子标记。其筛选方法包括：(1)试验材料及其表型数据的获得；(2)菊花连锁图谱构建；(3)菊花抗蚜性状的QTL定位；(4)菊花抗蚜性状关联分子标记的确定。解决了目前菊花抗蚜性状基因的精确定位和克隆的研究在国内外几乎空白这一现状，筛选出与菊花蚜虫抗性基因紧密关联的分子标记，建立菊花抗蚜性分子标记辅助选择体系，提高菊花抗蚜性选择效率，为菊花新品种的选育奠定基础。
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公开(公告)号：CN116564407B
公开(公告)日：2024-03-15
申请号：CN202310372815.1
申请日：2023-04-10
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明公开了一种全基因组选择预测菊花花期模型的筛选方法。本发明还公开了由所述方法筛选的全基因组选择预测模型在预测菊花花期、筛选菊花品种、菊花花期育种中的应用。本发明还公开了基于全基因组选择高效预测菊花花期的方法。本发明发现全基因组关联分析鉴定获得的显著关联位点以及SVM模型可以快速、高效、精准预测菊花动态花期，准确度可达0.90～0.95。本发明可实现菊花现蕾期、显色期、初开期、盛花期、衰败期以及开花早晚的早期预测，无需进行繁琐的田间全生育期观测，既避免了环境因子以及人为主观因素对花期表型鉴定的影响又大大缩短了育种周期，对于菊花花期改良和周年生产具有重要的理论和实践意义。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117248070A
公开(公告)日：2023-12-19
申请号：CN202311333774.1
申请日：2023-10-16
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , A01H1/04 , G16B20/20 , G16B30/10
Abstract: 本发明公开了一种菊花托桂花型KASP标记开发方法及其应用。本发明通过基于全基因组重测序的BSA‑seq快速鉴定菊花托桂花型关联位点，并将SNP和InDel关联位点转化成KASP标记，与传统基于PCR和电泳的分子标记相比，KASP标记具有转化成功率高、分型准确、开发费用低、灵活性强、易于自动化等明显优势。开发的KASP‑Chr6__179207697‑G/A鉴定准确率可达76～85％，可在较短时间内完成大批量材料的托桂花型筛选，避免了繁琐的田间花期表型观测，减少了环境因对表型鉴定的影响，从而大大缩短育种周期。本发明为实现菊花托桂花型的早期大规模、高通量、自动化检测筛选奠定了重要基础，对菊花花型MAS育种具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号：CN106446596B
公开(公告)日：2019-04-30
申请号：CN201610562438.8
申请日：2016-07-15
Applicant: 南京农业大学
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种与菊花耐涝性显著相关的分子标记及其鉴定方法和应用，包括a.连续两年的耐涝性鉴定；b.菊花品种群体结构及亲缘关系分析；c.关联模型的比较和选择；d.与菊花耐涝性显著关联的分子标记的确定；e.优异等位变异挖掘及亲本选拔。本发明采用盆栽模拟淹水法对100个菊花品种进行连续两年的耐涝性鉴定，采用全基因组关联分析方法检测与耐涝性紧密关联的分子标记位点并进行了优异等位变异的挖掘。本发明检测到4个标记位点与菊花耐涝性显著关联，挖掘了2个优异等位变异并筛选了6份优异菊花品种，这不仅为菊花耐涝性杂交育种工作提供了优异亲本材料也为分子标记辅助育种(MAS)选择提供了一定参考。
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公开(公告)号：CN107815502A
公开(公告)日：2018-03-20
申请号：CN201711176758.0
申请日：2017-11-23
Applicant: 南京农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明涉及一种鉴定菊花耐涝性的dCAPS标记开发方法及应用，属于生物技术领域，该方法包括以下几个步骤：a、通过GWAS方法挖掘与菊花耐涝性显著关联的SNP位点；b、SNP突变位点特异性酶切位点分析及dCAPS引物设计；c、结合基因型与表型数据预期酶切扩增多态性；d、dCAPS标记在自然耐涝极端群体的验证；e、在F1后代耐涝极端群体中对WT-dCAPS1标记进行进一步验证。本发明开发了一个与菊花耐涝性状共分离的dCAPS共显性标记，命名为WT-dCAPS1，在两个群体的平均鉴定准确率为78.9％，初步认为可以应用于菊花耐涝性分子标记辅助育种，大大缩短育种周期，对于培育耐涝性菊花新品种具有重要的理论和实践意义。
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公开(公告)号：CN106446596A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201610562438.8
申请日：2016-07-15
Applicant: 南京农业大学
CPC classification number: G06F19/10 , C12Q1/6895 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明属于生物技术领域，公开了一种与菊花耐涝性显著相关的分子标记及其鉴定方法和应用，包括a.连续两年的耐涝性鉴定；b.菊花品种群体结构及亲缘关系分析；c.关联模型的比较和选择；d.与菊花耐涝性显著关联的分子标记的确定；e.优异等位变异挖掘及亲本选拔。本发明采用盆栽模拟淹水法对100个菊花品种进行连续两年的耐涝性鉴定，采用全基因组关联分析方法检测与耐涝性紧密关联的分子标记位点并进行了优异等位变异的挖掘。本发明检测到4个标记位点与菊花耐涝性显著关联，挖掘了2个优异等位变异并筛选了6份优异菊花品种，这不仅为菊花耐涝性杂交育种工作提供了优异亲本材料也为分子标记辅助育种(MAS)选择提供了一定参考。
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公开(公告)号：CN116469466B
公开(公告)日：2024-02-09
申请号：CN202310379493.3
申请日：2023-04-11
Applicant: 南京农业大学
IPC: G16B30/00 , C12Q1/6895 , G16B30/10 , G16B40/00 , G06F18/2135 , G06N5/01 , G06N20/10 , G06N7/01
Abstract: 涝性分子育种领域具有广阔的应用前景，同时本本发明公开了一种高效预测菊花耐涝性的 发明也可为菊花其他重要性状的分子育种提供方法及其应用。本发明通过全基因组关联分析鉴 依据。定菊花耐涝性显著相关的SNP位点，并在此基础上，比较了不同统计模型和不同密度SNP标记对全基因组预测效果的影响，建立了一种快速、高效、精准筛选优异耐涝菊花品种的方法，预测准确度可达0.949。基于本发明的方法预测出的体系在选育耐涝菊花品种时，不仅能够实现菊花耐涝性的早期选择，缩短育种周期，还有效克服了(56)对比文件Zhiwu Zhang等.Mixed linear modelapproach adapted for genome-wideassociation studies《.nature genetics》.2010,第1-9页.Jiangshuo Su等.Genome-wideassociation study identifies favorableSNP alleles and candidate genes forwaterlogging tolerance in chrysanthemums.《Horticulture Research》.2019,第6卷(第2019期),第1-13页.
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