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公开(公告)号:CN113077849B
公开(公告)日:2023-03-31
申请号:CN202110284392.9
申请日:2021-03-16
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 一种大肠杆菌β‑内酰胺类获得性耐药表型预测复合方法,解决了现有预测耐药表型的工具一般通过对氨基酸序列进行一系列计算,而且计算需要多软件、多系统平台进行,用户友好度不佳,对于非生物学或非信息学的研究人员来说,现有的方法具有很强的技术壁垒的问题,其包括预处理和预测与识别,所述预处理包括步骤:提取目标耐药基因构件训练集;去除非获得性耐药相关基因;随机过程切割数据;预加重和平稳性控制;LPCC特征系数/灰度关联;本发明结构新颖,构思巧妙,模型构建于R包和JavaWeb网页中,并加入数据库更新策略,提高效用价值。
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公开(公告)号:CN113643758A
公开(公告)日:2021-11-12
申请号:CN202111113150.X
申请日:2021-09-22
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种面向肠杆科细菌获得抗β‑内酰胺类耐药性基因的预测方法,包括如下步骤:步骤一、构建训练集和测试集;步骤二、随机分割形成k‑mers;步骤三、构建预测模型;步骤四、输出每次预测的最优结果;步骤五、优化、测试和预测。本发明对于肠杆科细菌的抗β‑内酰胺类耐药性预测准确、结果可信、算法合理、模型稳定,能识别或分类与参考数据库中高度不同的ARGs,同时提高预测的性能,实现了以生物学意义为主导的深度学习应用。
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公开(公告)号:CN113077849A
公开(公告)日:2021-07-06
申请号:CN202110284392.9
申请日:2021-03-16
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 一种大肠杆菌β‑内酰胺类获得性耐药表型预测复合工具,解决了现有预测耐药表型的工具一般通过对氨基酸序列进行一系列计算,而且计算需要多软件、多系统平台进行,用户友好度不佳,对于非生物学或非信息学的研究人员来说,现有的方法具有很强的技术壁垒的问题,其包括预处理和预测与识别,所述预处理包括步骤:提取目标耐药基因构件训练集;去除非获得性耐药相关基因;随机过程切割数据;预加重和平稳性控制;LPCC特征系数/灰度关联;本发明结构新颖,构思巧妙,模型构建于R包和JavaWeb网页中,并加入数据库更新策略,提高效用价值。
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公开(公告)号:CN117130400A
公开(公告)日:2023-11-28
申请号:CN202310625895.7
申请日:2023-05-30
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明涉及一种基于PLC的模拟海洋酸化变异性的装置及其控制方法,属于海洋模拟检测技术领域,所述模拟装置有空气压缩机构和二氧化碳供给机构,所述空气压缩机构包括空气压缩机和双通电磁阀,所述空气压缩机连接有空气减压器,能够将空气进行稳压输送,所述二氧化碳供给机构包括二氧化碳罐、气体调节阀和曝气环,所述空气压缩机和所述二氧化碳罐连接双通电磁阀,能够调节气体的流量,所述气体调节阀可调节二氧化碳的通入量,二氧化碳罐输送二氧化碳与压缩的空气混合输送至所述曝气环中进行水体曝气,降低水体的PH值,通过PH检测仪测量水体中PH实测值后反馈至PLC控制器输出控制所述双通电磁阀的开闭,达到调节气体流量控制PH值的目的。
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公开(公告)号:CN113643758B
公开(公告)日:2023-04-07
申请号:CN202111113150.X
申请日:2021-09-22
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种面向肠杆科细菌获得抗β‑内酰胺类耐药性基因的预测方法,包括如下步骤:步骤一、构建训练集和测试集;步骤二、随机分割形成k‑mers;步骤三、构建预测模型;步骤四、输出每次预测的最优结果;步骤五、优化、测试和预测。本发明对于肠杆科细菌的抗β‑内酰胺类耐药性预测准确、结果可信、算法合理、模型稳定,能识别或分类与参考数据库中高度不同的ARGs,同时提高预测的性能,实现了以生物学意义为主导的深度学习应用。
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