公开(公告)号：CN113643758A

公开(公告)日：2021-11-12

申请号：CN202111113150.X

申请日：2021-09-22

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 廖晓萍 ,  刘雅红 ,  方畅 ,  吴精乙 ,  高源 ,  凌宏韬 ,  吴名柔 ,  吴玉寒

IPC: G16B30/00 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06K9/62 ,  G06N3/04 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种面向肠杆科细菌获得抗β‑内酰胺类耐药性基因的预测方法，包括如下步骤：步骤一、构建训练集和测试集；步骤二、随机分割形成k‑mers；步骤三、构建预测模型；步骤四、输出每次预测的最优结果；步骤五、优化、测试和预测。本发明对于肠杆科细菌的抗β‑内酰胺类耐药性预测准确、结果可信、算法合理、模型稳定，能识别或分类与参考数据库中高度不同的ARGs，同时提高预测的性能，实现了以生物学意义为主导的深度学习应用。

公开(公告)号：CN113643758B

公开(公告)日：2023-04-07

申请号：CN202111113150.X

申请日：2021-09-22

Applicant: 华南农业大学

Inventor： 廖晓萍 ,  刘雅红 ,  方畅 ,  吴精乙 ,  高源 ,  凌宏韬 ,  吴名柔 ,  吴玉寒

IPC: G16B30/00 ,  G16B5/00 ,  G16B40/00 ,  G06F18/24 ,  G06F18/20 ,  G06N3/0464 ,  G06N3/08

Abstract: 本发明公开了一种面向肠杆科细菌获得抗β‑内酰胺类耐药性基因的预测方法，包括如下步骤：步骤一、构建训练集和测试集；步骤二、随机分割形成k‑mers；步骤三、构建预测模型；步骤四、输出每次预测的最优结果；步骤五、优化、测试和预测。本发明对于肠杆科细菌的抗β‑内酰胺类耐药性预测准确、结果可信、算法合理、模型稳定，能识别或分类与参考数据库中高度不同的ARGs，同时提高预测的性能，实现了以生物学意义为主导的深度学习应用。