公开(公告)号：CN118782148A

公开(公告)日：2024-10-15

申请号：CN202410988849.8

申请日：2024-07-23

申请人： 中山大学 ,  中山大学·深圳 ,  深圳市宝安区疾病预防控制中心(深圳市宝安区卫生检验中心、深圳市宝安区职业病防治所)

发明人： 杜向军 ,  陈亿雄 ,  冯镜儒 ,  韩文杰 ,  任萌 ,  翟珂 ,  张弛 ,  陈绎霖 ,  龙浩雨 ,  程佩文 ,  张晟 ,  王梓琪

IPC分类号： G16B30/10 ,  G16B40/20 ,  G16B40/30 ,  G16B20/30

摘要： 本发明公开了一种新型冠状病毒毒株抗原性快速鉴别方法及装置，用于解决现有相关技术中存在的时间经济成本较高，突变分析不够及时准确的技术问题。所述方法包括：获取新型冠状病毒的多组毒株对序列，以及每一组毒株对序列各自对应的多位抗原描述符；基于多个多位抗原描述符，将多组毒株对序列转换为抗原描述数据集，并根据抗原描述数据集，通过模型训练获得抗原关系预测模型；获取毒株序列信息，并对毒株序列信息进行层级采样，获得待测序列信息；采用抗原关系预测模型对待测序列信息进行抗原相似性预测，获得待测序列信息中多个毒株两两之间抗原相似关系的预测结果。

公开(公告)号：CN113284555B

公开(公告)日：2023-08-22

申请号：CN202110653805.6

申请日：2021-06-11

申请人： 中山大学

发明人： 杜向军 ,  舒跃龙 ,  张弛 ,  王樱涵 ,  陈材 ,  龙浩雨 ,  白俊博 ,  曾金锋 ,  曹子成 ,  张兵 ,  沈伟 ,  唐凤 ,  梁诗雯 ,  孙彩军

IPC分类号： G16B20/50 ,  G16B45/00

摘要： 本发明实施例公开了一种基因突变网络的构建方法、装置、设备及存储介质，所述方法包括：获取各毒株序列的基因序列数据，根据各毒株序列的基因序列数据确定各毒株序列之间的突变概率；根据各毒株序列之间的突变概率构建至少一个初始子网络；遍历各初始子网络，将两两初始子网络之间的全局最大突变概率的毒株序列对连接，得到连通网络；基于毒株序列的采样时间确定根毒株序列，根据连通网络的连通路径以及各毒株序列与根毒株序列的突变概率确定连通网络的网络方向，得到基因突变网络。本发明实施例提供的方法通过构建拓扑结构的基因突变网络，保留了更多进化与拓扑信息，所需参数少，构建方便、节省算力。

公开(公告)号：CN113284555A

公开(公告)日：2021-08-20

申请号：CN202110653805.6

申请日：2021-06-11

申请人： 中山大学

发明人： 杜向军 ,  舒跃龙 ,  张弛 ,  王樱涵 ,  陈材 ,  龙浩雨 ,  白俊博 ,  曾金锋 ,  曹子成 ,  张兵 ,  沈伟 ,  唐凤 ,  梁诗雯 ,  孙彩军

IPC分类号： G16B20/50 ,  G16B45/00

摘要： 本发明实施例公开了一种基因突变网络的构建方法、装置、设备及存储介质，所述方法包括：获取各毒株序列的基因序列数据，根据各毒株序列的基因序列数据确定各毒株序列之间的突变概率；根据各毒株序列之间的突变概率构建至少一个初始子网络；遍历各初始子网络，将两两初始子网络之间的全局最大突变概率的毒株序列对连接，得到连通网络；基于毒株序列的采样时间确定根毒株序列，根据连通网络的连通路径以及各毒株序列与根毒株序列的突变概率确定连通网络的网络方向，得到基因突变网络。本发明实施例提供的方法通过构建拓扑结构的基因突变网络，保留了更多进化与拓扑信息，所需参数少，构建方便、节省算力。