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公开(公告)号：CN110241211B
公开(公告)日：2023-03-28
申请号：CN201910552941.9
申请日：2019-06-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 诊断结直肠癌的分子组合标志物及检测试剂盒。本发明公开了一种microRNA hsa‑miR‑133a‑3p，hsa‑miR‑145‑5p，hsa‑miR‑1‑3p和hsa‑miR‑378d以及其对应靶基因MLEC，SET，PPIA，YY1作为结直肠癌诊断标志物及其应用，在人结直肠癌组织中表现为显著特异性高表达现象，能够明确清楚地表征结直肠肿瘤的发生。针对联合生物标志物hsa‑miR‑133a‑3p，hsa‑miR‑145‑5p，hsa‑miR‑1‑3p，hsa‑miR‑378d以及其对应靶基因MLEC，SET，PPIA，YY1的表达水平进行大规模检测，可以快速、便捷、准确及灵敏的预测和诊断结直肠癌的发生。
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公开(公告)号：CN108680757B
公开(公告)日：2021-02-09
申请号：CN201810697733.3
申请日：2018-06-29
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种检测蛋白质和DNA相互作用的试剂盒，其至少包括外源组蛋白抗原。还公开了上述试剂盒在检测少量蛋白质和DNA相互作用中的应用，所需样品量可低至1000个细胞。本发明还公开了一种检测蛋白质和DNA相互作用的方法及其应用。本发明提供的技术方案通过在少量起始样品中补加所要研究的与DNA相互作用的组蛋白相应的抗原以减少样品损失并提高免疫沉淀反应的效率。具有以下优点：1、所需最低样品量为1000个细胞，更加适用于少量来源样品的蛋白质和DNA相互作用的检测分析；2、ChIP实验不需要特定的试剂盒和实验设备，成本较低，具有较高普遍适用性。
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公开(公告)号：CN110577999A
公开(公告)日：2019-12-17
申请号：CN201910714889.2
申请日：2019-08-02
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种CXCR4作为胃癌预后评估生物标志物的应用及诊断试剂盒，该标记物能够迅速、准确、方便地预测和评估胃癌预后，从分子水平实现了胃癌危险度的分级分期，大大提高胃癌预后检测及评估的敏感性和特异性。将不同预后程度的患者进行分类治疗，不仅能指导个体化精准治疗，而且可以节约医疗成本，具有较高的临床应用价值。
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公开(公告)号：CN110438229A
公开(公告)日：2019-11-12
申请号：CN201910707728.0
申请日：2019-08-01
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12N1/11
Abstract: 本发明公开了一种胃癌预后诊断生物标志物及其检测试剂盒，所述生物标志物为肿瘤微环境相关因子RGS1。本发明通过预后标记物及检测标记物RGS1的应用，可以迅速、准确、方便地预测胃癌预后，从分子水平实现胃癌危险高低的分级分层，显著地将不同预后程度的患者分类治疗，从而指导个体化精准治疗，同时节约了医疗成本，具有较高的临床应用价值。
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公开(公告)号：CN103911449B
公开(公告)日：2015-08-12
申请号：CN201410138517.7
申请日：2014-04-08
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明涉及一种检测RNA PAS（Poly A Site）的方法，提供了一种基于3T-seq全基因组范围分析APA的方法，包括含有oligo dT的磁珠制备，即将5'端生物素修饰的oligo dT引物与带链霉亲和素的磁珠混合结合；用所述磁珠与总RNA混合，筛选含有Poly A的RNA；逆转录，双链cDNA第二链合成，双链cDNA断裂；移除Poly A结构；末端修饰后连接测序接头；文库回收。该方法减少了RNA水平操作，在DNA水平移除Poly A序列，消除Poly结构对测序的影响；选择双链DNA断裂酶处理，在不影响文库质量的基础上在DNA水平断裂；简化实验流程，降低实验难度和造价，使其应用范围更广。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN118028489A
公开(公告)日：2024-05-14
申请号：CN202410363181.8
申请日：2024-03-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6869 , C12Q1/6851 , C12Q1/6806 , C12N15/11 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种分子组合生物标志物及其检测试剂盒，涉及生物技术领域。该分子组合生物标志物为ANXA1基因，LDLR基因和负调控相关的has‑miR‑106a‑5p；其筛选方法为：构建包含甲基化DNA序列的小鼠模型，提取基因组DNA和总RNA，进行DNA甲基化测序、转录组测序、miRNA测序；与临床样品中的测序数据对照，筛选出具有相同趋势的差异表达基因和差异表达的miRNA；miRNA预测的靶基因与差异表达基因联合，筛选出miRNA与mRNA负相关的调控对；检测该分子组合生物标志物的试剂盒及其应用方法。本发明利用高量测序技术，将甲基化组学和转录组学联合，筛选出表达与甲基化呈现负相关的基因。
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公开(公告)号：CN113151462B
公开(公告)日：2023-03-21
申请号：CN202110254925.9
申请日：2021-03-09
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种用于诊断肺癌预后的生物标志物，其包括hsa‑miR‑21‑5p，hsa‑miR‑141‑5p和hsa‑miR‑490‑3p。本发明通过对肺癌相关miRNA筛选、靶基因的预测和功能分析，进行了预后模型的构建和风险因子评估，通过肺癌组织及癌旁组织检测验证，筛选出的三种新的miRNA标志物，并完成了肺癌预后模型的构建和临床样品验证，hsa‑miR‑21‑5p，hsa‑miR‑141‑5p，hsa‑miR‑490‑3p作为肺癌预后诊断标志物的应用及其检测试剂盒，可用于准确预后、个性化治疗以及疾病监测等。
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公开(公告)号：CN111424086A
公开(公告)日：2020-07-17
申请号：CN202010197122.X
申请日：2020-03-19
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886 , G01N33/574 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种用于胃癌诊治及预后评估的生物标记物及应用和检测试剂盒，采用肿瘤浸润免疫细胞因子IL23A作为胃癌诊治及预后评估生物标记物，通过检测所述肿瘤浸润免疫细胞因子IL23A的相对表达水平来评估患者预后情况。与现有技术相比，本发明细胞因子参与肿瘤免疫细胞浸润的多种免疫反应，能够从分子水平实现胃癌危险度的分级分期发展阶段，迅速、准确地检测和评估胃癌预后，有效提高胃癌预后检测及评估的敏感性和特异性。
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公开(公告)号：CN110241211A
公开(公告)日：2019-09-17
申请号：CN201910552941.9
申请日：2019-06-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6886
Abstract: 诊断结直肠癌的分子组合标志物及检测试剂盒。本发明公开了一种microRNA hsa-miR-133a-3p，hsa-miR-145-5p，hsa-miR-1-3p和hsa-miR-378d以及其对应靶基因MLEC，SET，PPIA，YY1作为结直肠癌诊断标志物及其应用，在人结直肠癌组织中表现为显著特异性高表达现象，能够明确清楚地表征结直肠肿瘤的发生。针对联合生物标志物hsa-miR-133a-3p，hsa-miR-145-5p，hsa-miR-1-3p，hsa-miR-378d以及其对应靶基因MLEC，SET，PPIA，YY1的表达水平进行大规模检测，可以快速、便捷、准确及灵敏的预测和诊断结直肠癌的发生。
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公开(公告)号：CN108680757A
公开(公告)日：2018-10-19
申请号：CN201810697733.3
申请日：2018-06-29
Applicant: 上海交通大学
CPC classification number: G01N33/68 , C12N15/1013
Abstract: 本发明公开了一种检测蛋白质和DNA相互作用的试剂盒，其至少包括外源组蛋白抗原。还公开了上述试剂盒在检测少量蛋白质和DNA相互作用中的应用，所需样品量可低至1000个细胞。本发明还公开了一种检测蛋白质和DNA相互作用的方法及其应用。本发明提供的技术方案通过在少量起始样品中补加所要研究的与DNA相互作用的组蛋白相应的抗原以减少样品损失并提高免疫沉淀反应的效率。具有以下优点：1、所需最低样品量为1000个细胞，更加适用于少量来源样品的蛋白质和DNA相互作用的检测分析；2、ChIP实验不需要特定的试剂盒和实验设备，成本较低，具有较高普遍适用性。
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